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泛基因家族分析发文章就上2区!你研究的物种能不能发?
学术
2024-07-31 19:15
山东
泛基因家族分析
是基于物种泛基因组序列信息去进行家族成员鉴定及分析的新方法,能很好地弥补
单一参考基因组无法全面代表整个物种的全部遗传变异信息的不足
,是进行基因家族分析的新方法新思路。与传统基因家族分析相比具有以下3个优势:
1. 全面性:
泛基因家族分析基于物种泛基因组序列信息,能够包含多个个体的遗传变异信息,从而更全面地反映基因家族的真实情况;
2. 准确性:
通过比较多个个体的基因组序列,可以更准确地识别基因家族成员之间的变异情况,包括单核苷酸多态性(SNP)、插入/缺失(InDel)等;
3. 功能解析:
结合功能注释信息,可以进一步解析基因家族成员在物种内的功能分化和进化关系,为理解物种的生物学特性提供重要线索;
随着测序成本的降低,越来越多的物种发布了泛基因组信息,
据不完全统计,目前已有60个常见真核物种发布了泛基因组:
一个物种有了泛基因组信息,那就可以开展泛基因家族分析了
,抓紧看看有没有你研究的物种!
泛基因家族分析主要包含以下8项内容:
泛基因家族成员的鉴定;
泛基因家族成员在各品系中的缺失分析;
泛基因家族成员的系统发育分析;
泛基因家族成员选择压力分析;
泛基因家族成员结构变异的注释;
泛基因家族成员结构变异对其转录表达的影响分析
泛基因家族成员结构变异对其基因结构及保守结构域的影响分析
差异表达基因家族成员转录因子互作网络分析
目前来看,
以上
8
大
分析内容完全覆盖
一篇
2区期刊
SCI论文了
,如果再添加功能验证实验比如亚细胞定位或转基因等,那就可以冲1区文章了。
随着越来越多物种的泛基因组公布,泛基因家族分析势必会成为
下一个发文热点
!
泛基因家族分析所用数据基本
全部都是其他人上传的
公共数据
,
0实验
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你就说这
性价比高
不高吧?
泛基因家族分析另一个优点就是
操作简单
,对
电脑性能要求低
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