第四届国际表观基因组学研讨会在上海隆重开幕!

文摘   2023-10-29 21:00   北京  

2023年 10 月 28 日早上 8:10,第四届国际表观基因组学研讨会暨2023中国肿瘤甲基化标志物年会于上海市徐汇区青松城大酒店隆重开幕,本次大会由中国抗癌协会肿瘤标志专业委员会、中国生物信息学(筹)表观遗传信息学专业委员会联合主办复旦大学生物医学研究院、全癌标志物研究联盟承办会议邀请了 28 名国内外表观基因组学研究的重量级嘉宾, 200 余名研究者参加本次盛会,共同探讨交流表观遗传学领域的最新研究进展。本届大会联合主席是复旦大学生物医学研究院于文强教授中国抗癌协会肿瘤标志专业委员会主任委员邢金良教授

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首先进行的是本次会议的特别策划,纪念DNA甲基化与肿瘤相关联(Linking Methylation to Cancer, LMTC)发现40周年。于文强教授发表特别致辞:“40年前,美国医学科学院院士,约翰霍普金斯大学 Andy Feinberg教授,在自然杂志发表文章。发现肿瘤存在全基因组的DNA低甲基化现象,在生物医学发展史上第一次将肿瘤与DNA甲基化联系起来,开启了肿瘤研究的新纪元。40年来,表观遗传学在肿瘤领域的研究已经形成了一个又一个热点,表观遗传学异常与肿瘤发生密切相关已经成为广泛的全球共识。DNA甲基化相关研究在肿瘤的诊断、治疗和预后判断中发挥着越来越重要的作用,肿瘤研究已经进入了表观遗传时代。今天,我们在这里隆重纪念Andy Feinberg教授的有关肿瘤DNA甲基化研究的这一重大发现,具有重要的理论和现实意义......”随后,大会播放了纪念DNA甲基化与肿瘤相关联(Linking Methylation to Cancer,LMTC)发现40周年回顾视频。


于文强教授发表特别致辞

接着来到特邀报告环节,美国艺术与科学院院士Andrew P. Feinberg简要回顾了自己如何走上表观遗传研究的道路,并带来题为Epigenetic Plasticity as a major driver of Cancer Progression的报告。报告中Andrew P. Feinberg院士系统性地讲述了肿瘤与表观重塑的关系,主要介绍了表观遗传随机性模型,阐述了随机性表观遗传变异可能是进化和发育的驱动因素,而促进表观遗传重塑的基因变异也有助于生物适应外界变化的环境。此外,Andrew P. Feinberg院士还从DNA甲基化图景及表观遗传势能图景的建模为我们提供了理解肿瘤表观遗传学的新视角。

接着是美国科学院院士Peter A. Jones为我们带来题为Development of epigenetic therapies - from discovery of 5-azacytidine to clinial trials的报告。报告中Peter A. Jones院士回顾了从事表观遗传研究以及5-azacytidine的研究道路,并阐述了azacytidine作为甲基化抑制剂的机理。接着Peter A. Jones院士介绍了肿瘤中的DNA甲基化和甲基转移酶DNMT家族,并详细讲解了DNMT3结构域,DNMT-核小体复合物的电镜结构,以及肿瘤发展中的DNMT图景。最后,Peter A. Jones院士总结了当前的DNMTi疗法,展望了DNMTi疗法的光明未来。

在特邀报告之后,复旦大学生物医学研究院于文强教授主持大会开幕式,中国抗癌协会肿瘤标志专业委员会主任委员邢金良教授致辞。两位大会主席对来自世界各地的参会者表示热烈欢迎,预祝本次会议圆满成功并希望大会助力表观基因组学研究取得突破和进展。


大会主席复旦大学生物医学研究院于文强教授

大会主席中国抗癌协会肿瘤标志专业委员会主任委员邢金良教授

基础专场胡立夫教授主持。首先带来分享的是圣路易斯华盛顿大学医学院讲席教授王艇教授,为我们带来题为The Human Pangenome Project: Creating a Reference that Better Represents Human Global Genetic Diversity的报告。王艇教授从Human Pangenome Project出发,主要介绍了新开发的表观生物学工具MethylGrapher,并探讨了不同的参考基因组选择对全基因组研究的影响,还向我们介绍了iGVF(impact of genetic variation on function)与MaHT(Somatic Mosaicism across Human Tissues)项目。



接下来分享的是中国科学院院士、英国皇家妇产科学院荣誉院士黄荷凤院士,报告题目是卵母细胞源性糖尿病的表观遗传机制黄荷凤院士主要讲述了她的团队从发育角度探索糖尿病发生和早期调控的近期工作。他们首先发现男性精子和孕期不良环境因素暴露会增加子代糖尿病发病风险,在小鼠实验中也发现高糖卵子来源F1代高脂饮食加快糖耐量受损发生,并证明了糖耐量受损主要原因是胰岛素分泌障碍。接着,黄荷凤院士讲解了对于他们发现的现象背后机制的探索。团队发现,高糖卵子中DNA去甲基化酶Tet3 mRNA表达下降,且胰岛素分泌相关调控基因Gck甲基化异常。在该研究中还发现,补充Tet3和Gck激动剂可逆转糖代谢异常表型,表明这两者很可能成为药物靶点。最后黄荷凤院士还向我们介绍了围孕期的相关检查已经进入临床路径,从早期发育角度预防其他代谢性疾病和心血管疾病也在研究中。


第三位分享的是广州医科大学附属第一医院梁文华教授,报告题目是ctDNA甲基化标志物在肺癌早诊早筛中的应用梁教授的报告从肺癌早期诊断及分级管理、早期演进中的特征和预测组织损伤部位及程度三个方面展开。梁教授提出,以ctDNA甲基化检测为代表的液体活检是一项突破性技术,ctDNA甲基化在肿瘤早诊中极具价值,特别是结合影像学的多模态诊断方式,能够显著提升肺结节良恶性鉴别准确率,避免过度诊治。



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应用专场的上半场由戴广海教授主持。首先报告的是美国范安德尔研究所沈慧教授,报告题目是New tools for DNA methylation studies。沈教授先简单介绍了前期已经发表的工作,并主要介绍了自己实验室最新开发的生信工具Biscuit,这种工具支持多种文件格式,有更高的准确性,效率也高于当前的主流工具,还可以同时获得基因组与表观基因组数据。此外,沈教授还简要介绍了她的团队在小鼠甲基化微阵列和单细胞测序方面的工作。


第二位报告嘉宾是中山大学肿瘤防治中心常务副院长马骏教授马骏教授首先分享了他的团队研制出晚期鼻咽癌“增效”的放化综合治疗“中国方案”,提出先化疗后放疗的方案,发现“吉西他滨+顺铂(GP)”具有双重肿瘤杀灭效应,以及卡陪他滨节拍放疗后化疗可以进一步提高疗效,这些工作也改变了全球标准方案。此外,马骏教授团队还创立了低风险鼻咽癌的“减毒”治疗新策略,修改了鼻咽癌分期标准,提高了患者的生活质量。


第三位报告嘉宾是中国福利会国际和平妇幼保健院副院长王玉东教授,他的汇报主题是DNA甲基化在妇科肿瘤早筛早诊中的精细化应用王玉东教授先向我们分享了宫颈癌的相关背景,包括宫颈癌的病因、宫颈癌早诊早疗一般流程、宫颈癌筛查诊断痛点等。接下来王玉东教授向我们重点介绍了DNA甲基化检测在宫颈癌早诊中的应用,以及DNA甲基化标志物PCDHGB7的特点。教授通过临床实验数据以及亲身案例说明,DNA甲基化检测与活检病理的一致性高,具有很广的临床应用前景。


上半场的最后一位报告嘉宾复旦大学附属华山医院副院长兼外科主任钦伦秀教授,题目是“种子与土壤对话与抗癌转移新策略”。钦教授总结了他的团队近二十余年的成果,并主要阐述了近十年的工作。首先是发现了癌与免疫微环境“对话”促转移的新机制,包括癌细胞正向调变炎症免疫细胞表型促癌转移的新机制和微环境炎症免疫失衡反向增强癌细胞的侵袭转移潜能。接着钦教授讲述了从癌与微环境对话机制发展抗转移新策略,包括炎症免疫再平衡联合抗转移、设计研发抗转移小分子化合物NZ001以及靶向代谢治疗。最后,钦教授总结,他的团队从分子分型与转移预测的机制研究出发,提出炎症免疫再平衡抗转移、靶向代谢抗转移、靶向代谢抗转移的治疗方案,多项药物、方案即将进入临床。


应用专场的下半场由师建国教授主持。下半场第一位报告嘉宾是解放军总医院肿瘤医学部肿瘤内科主任戴广海教授,报告主题是晚期胰腺癌治疗进展和探索。戴广海教授汇报了当前晚期胰腺癌的治疗方式,化疗仍为治疗基石,并向更强组合进军,不过效果的提升有效;而免疫治疗扔在探索中,失败居多,未来和其他治疗方案结合需要探索。戴广海教授也提出,新的靶向药物值得期待,而甲基化检测的有效性也需要更多的临床试验。


第二位报嘉宾武汉大学中南医院妇儿医院副院长胡争教授,汇报题目是HPV感染的精准诊断和治疗在介绍了宫颈癌的相关背景后,胡教授从新机制、新检测和新疗法三个方面展开报告。胡教授团队围绕宫颈癌与HPV相关机制进行了深入研究,并受到新冠病毒检测的启发,利用CRISPR Cas12技术开发新的检测技术,还利用纳米颗粒研发新的治疗方案,以猪为试验对象得到了很好的结果。


第三位嘉宾中山大学附属肿瘤医院院长助理王峰教授,汇报主题是消化道肿瘤免疫治疗临床和转化研究王峰教授团队发现MSI-H直肠癌单药免疫治疗有效率高,可豁免手术及放化疗,并提出POLE/POLD1是预测免疫治疗疗效的新型分子标志物。他们还在食管癌和胃癌创新了免疫联合化疗,并成为一线标准治疗方案。


最后一位嘉宾复旦大学附属肿瘤医院教授丁春明教授,汇报的题目是ctDNA Genomics in Totality for Better Tumor Liquid Biopsy Solutions丁教授首先向我们介绍了ctDNA的相关背景,并总结了肿瘤液体活检当前的几大难题:检验是否有肿瘤,检验是哪种肿瘤,以及能否在早期检测到肿瘤。报告中丁春明教授提到的单链建库方法也引起了热烈讨论。


整整一天会议,报告专家嘉宾与台下观众频频互动,现场会议气氛热烈,高质量并且精彩纷呈的会议报告让所有参会人员感到意犹未尽、收获颇丰。更多精彩的表观基因组学报告将继续进行,敬请大家期待!


(本次大会志愿者复旦大学蒋之恺同学对文章亦有贡献)

计算表观遗传学
“计算表观遗传学(Computational Epigenetics - CEPI)”公众平台致力于表观遗传领域的科学研究,汇集领域内数据分析、算法开发及平台搭建,领航表观前沿,共同探索表观遗传调控机制。
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