顶刊中的“水刊”,水刊中的“顶刊”!巨型顶刊Nature Communications竟对高分文章流量密码“多组学”如此偏爱!

文摘   2024-09-06 18:03   上海  

导师贼忙上午门诊、下午做手术、晚上值夜班),天天见不到人......

我天天看文献,啥用没有...

快疯了!到底怎么才能毕业????

难道我也是所谓的"放养研究生"???我真的就毕业无望了????

不不不,机会是留给有准备的人的,阿星现在为大家指几条方向,速速行动起来自救吧!

1、尽快确定方向,发论文。进组之后,基于课题组的已有基础和资源,赶紧明确研究方向,以论文为导向,以毕业为导向,奋斗吧朋友们!

2、抱紧师兄、师姐大腿,让他们帮忙指一条容易毕业的明路。可以请靠谱的师兄师姐吃顿饭,表示感谢,听取一下他们在科研方面的经验、教训和思考。    

3、反向push导师。此外就是主动找导师多汇报,推进自己的研究,解决遇到的问题。

但是该说不说如果你无任何想法就去找老师,老师也是相当反感,毕竟人家超忙啊,没那么多时间听你在那嗯嗯啊啊半天说不出个所以然,相反如果你带着一份精美的报告,一份严谨的思路设计去找导师,那效果就截然相反了,所以,各位朋友,咋还是先不断充实自己的“大脑想法”吧!!

今天阿星给大家分享一个助力大家顺利毕业的“科研利器”——多组学。

多组学研究到底是什么呢

随着常规转录组测序、单细胞转录组测序等技术和分析方法的不断完善和发展,转录组学的研究取得了极大成功。然而,单组学只能为了解疾病的生物机制提供有限的见解。多组学则为了解分子功能和疾病机制带来了新的机会。

就其本质而言,多组学分析绝不仅仅是两个或者三个组学数据的简单拼接组合,而是需要将这些数据进行深入整合,突破单一组学研究的局限性,在有限的数据中挖掘更多有意义的信息,构建基因表达调控的立体调控网络,与生物学问题和生物学功能联系起来,深层次理解各个分子之间的调控及因果关系。

这就意味着每增加一种组学,就需要大量的技术比较、量身定制的统计分析以及大量时间、人力和金钱的投资。可是没时间,没经费或者手头有资源但没时间整合怎么办?别担心组学公共数据库挖掘提上日程,阿星就是那个天选团队!我这边随时待命,万事俱备,就差你啦!

代表性文章

来篇代表性文章给大家安安心吧~不要太感谢我哦    

文章是由青大附院牛海涛及王永华团队刊载于Molecular Therapy-Nucleic Acids的一篇研究论文:Integrated multiomics analysis and machine learning refine molecular subtypes and prognosis for muscle-invasive urothelial cancer

研究亮点:该研究借助整合机器学习多组学数据的手段,成功鉴别出肌肉侵袭性尿路上皮癌(MUC)的高分辨率分子亚组,还构建出了稳固的共识机器学习驱动标识(CMLS)。并且,经由多个队列的核验,有力地证明了CMLS在预测患者结局以及引导治疗规划方面的实用价值

尤为关键的是,研究中所运用的数据库均为免费数据库,包括TCGAGEO,复现起来极为简单方便,若更换新的疾病研究方向,又是一篇高分文章出炉

数据来源:16S rRNA-seq、代谢数据(PMID:31171880、PMID:29924794、PMID:31281534、ColPortal);Bulk RNA-seq:TCGA-COAD、TCGA-READ;scRNA-seq:GSE146771、GSE108989    

小伙伴们,是不是活脱脱的例子,你心动了吗?想复现吗?戳戳阿星助您轻松搞定!我们团队具有高效服务,承诺1个月左右就出完整报告,从实验设计到样本处理、数据分析再到报告撰写,一气呵成。

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