写在开头
前段时间在学习再回首！杨博分享的生信经验！
里面有提到杨博士的生信学习经验，感觉这个学习经验和我们的生信入门&数据挖掘线上直播课课程设置十分契合hhh，如果想要系统性学习一下生信可以了解一下我们的课程哦！
当然新手零基础入门生信或多或少会遇到一些问题，但是遇到问题解决问题是生信学习和分析的常态哦，如果自学的话就要善用搜索去解决问题，如果加入课程就可以在搜索之后适当的请教助教以及老师！
这期推文结合上期学员遇到的问题，整理一下当我们开始学习R语言的时候，一些要注意的点。
1. 非必要不动配置文件！
这是11月学员在做课前准备工作，安装好R语言再安装R包时候遇到的问题，在尝试修改镜像以及本地导入依赖包均无法解决后，腾讯会议连线发现是修改了配置文件hhh
学员遇到报错及解决过程
1. 首先是安装clusterProfiler包时遇到Go.db报错问题
一般遇到这种问题报错说缺什么包就装什么包，但是学员安装之后还是未能加载成功
2. 安装完需要加载GO.db，然后重新安装clusterplufer，还是报错
甚至开始怀疑是不是R语言版本的问题，但是目前4.4.0及以上版本在录制课前准备工作的时候，是没有任何问题的，所以不是R语言版本的问题。
3. 设置镜像重新安装，还是报错！
因为有个别r包依赖于几十个其它包，比如这个大名鼎鼎的clusterProfiler，如果你网络不好，很有可能它本来是可以自动安装各种依赖的因为网络问题终止。所以如果你在library(clusterProfiler)报错很正常的。这个时候你需要单独的安装它缺失的依赖包即可，比如 GO.db是一个R包，需要装它，仿写你运行的脚本里面BiocManager开头的代码，把引号里面的词换成GO.db就行。案例就是（复制粘贴下面的代码）：
options(BioC_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor/")
options("repos" = c(CRAN="http://mirrors.cloud.tencent.com/CRAN/"))
options(download.file.method = 'libcurl')
options(url.method='libcurl')
options(timeout=10000)
BiocManager::install('GO.db',ask = F,update = F)
就算是设置了镜像，重新安装还是一样的报错，所以其实这个时候就可以好好探究一下报错了！
4. 腾讯会议连线解决
把学员遇到的问题和助教老师讨论后，助教老师开了腾讯会议连线学员解决
最终发现是因为学员不小心修改了配置文件，所以导致的报错，将配置文件修改回去之后就可以了！
教学团队讨论与总结
对于每期的课程，除了有打磨了五年的课程内容安排外，还有教学团队持续的答疑，以及对应学习阶段的补充资料！
关于答疑部分，每期还会将全部的答疑汇总成推文，整理好方便大家查阅。
对于比较复杂或者不太寻常的报错，再辅助学员解决之后，教学团队也会基于这个问题进行讨论和总结，方便后续有学员再遇到类似问题时可以快速帮助解决！
对于简单的问题，会鼓励学员基于之前的答疑文档去思考解决，对于复杂一些的问题，教学团队会一起帮忙解决，hhh就像小洁老师说的，加入课程之后教学团队就是大家的靠山，不用害怕努力往下学习就好！
2. 不同版本之间不要直接迁移R包
第二点是上次长沙线下的时候学员遇到的问题，第一天结束会让学员批量安装系列单细胞需要用到的R包，然后有问题当场提问解决
有位有基础的学员居然安装遇到一系列的问题，后来细问就是之前用的4.3的R版本，升级到4.4.0之后直接迁移了全部的R包，所以导致遇到了一系列的报错！
当我们在更新R语言大版本的时候，肯定会需要重新安装系列R包，可以将之前的R语言版本中安装的R包导出保存，然后再批量安装！
可参考chatGPT给出的代码，已测试过导出和读写无误，但是因为R包来源不同，直接都使用install安装可能会遇到一些报错！
# 获取已安装的包及其版本
installed_packages <- installed.packages()[, c("Package", "Version")]
# 将结果保存到一个CSV文件
write.csv(installed_packages, file = "installed_packages.csv", row.names = FALSE)
# 读取已保存的包信息
installed_packages <- read.csv("installed_packages.csv")
# 提取包名
packages_to_install <- installed_packages$Package
# 批量安装包
install.packages(packages_to_install)
不过解决批量安装的报错，会比解决版本冲突遇到的报错更加简单哦！可参考之前的推文一口气安装800个R包以及批量安装一系列github上面的R包
3. 遇到报错不要慌！
在学习R语言过程中，大家都会遇到报错，不论是刚接触的新手，还是使用很多年的老手！
遇到问题解决问题即可，不过我们有个偷懒小技巧：遇到waring提示信息先跳过，遇到Error在解决！
如果害怕鲜红的提示信息，那可以换个不那么明显的主题，从视觉上给自己心理安慰。
结尾小结
综上是新手入门要注意的一些些点，也是新手学习生信避坑指南1.0全部内容，后续应该会整理别的一些常见的问题给大家作为参考
如果你也想做单细胞转录组数据分析，最好是有自己的计算机资源哦，比如我们的2024的共享服务器交个朋友福利价仍然是800，而且还需要有基本的生物信息学基础，也可以看看我们的生物信息学马拉松授课（买一得五） ，你的生物信息学入门课。
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