研院风采|南京农业大学三亚研究院 崖城学堂第43期《四维进化的可视化:将基因组学与大规模CT数据集整合的前景与挑战》

文摘   2024-10-29 19:21   海南  


10月27日,南京农业大学三亚研究院崖城学堂第43期邀请到哥本哈根大学副教授Christy Anna Hipsley,为广大师生带来《四维进化的可视化:将基因组学与大规模CT数据集整合的前景与挑战》(Visualising evolution in 4D: prospectsand challenges for integrating genomics with large-scale CT datasets)的主题讲座。

在讲座中,Dr.Hipsley介绍了基因组学与大规模CT数据集结合的前景与挑战,深入讲解如何整合多组学与博物馆CT数据来分析物种间和物种内的变异及进化过程。

Dr. Hipsley详细阐述了CT技术在自然历史研究中的应用:通过采用综合技术来重构脊椎动物长达5亿年历史中的形态转变,包括物种描述、进化过程以及发育生物学等方面。具体而言,她运用X射线计算机断层扫描(CT)技术为化石和现存生物体生成三维模型,并在进化框架下进行对比分析,常常使用几何形态测量学方法。目前,她将这些方法应用于灵长类、犬科、海洋哺乳动物、有袋类、海龟以及其他爬行动物等不同生物类群,旨在探究新生代气候变化对形态和分类变异的影响,以及确定生物多样性产生和被破坏的背景条件。这些研究推动了数字化分析的发展。

Dr. Hipsley指出CT技术在生态学研究中的一大挑战是处理巨大样本量,并介绍了CT技术在植物研究中的应用,包括植物结构可视化以及植物表型量化中。讲座结束后,她与现场师生进行了深入的交流。Dr. Hipsley的精彩演讲为研究院师生带来了前沿的学术视野,激发了大家对通过新技术进行进化生物学研究的浓厚兴趣。 




Christy Anna Hipsley

个人简介:生态学与进化生物学专家、墨尔本大学生物科学学院荣誉院士、维多利亚博物馆研究员,专注于采用综合技术来重构脊椎动物长达5亿年历史中的形态转变,研究领域涵盖生物信息学、分子学、生态学、古气候学以及形态学等。以第一作者在《Nature》《Nature Ecology & Evolution》以及《Communications Biology》等国际顶尖学术期刊上发表多篇文章。近期,凭借其关于狗的驯化的创新性理念,荣获丹麦国家研究小组颁发的“年度原创创意”奖。



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来源:南京农业大学三亚研究院

校对:张   鸿

编辑:高方莹

责编:李彬滨

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