[INPA论文] 一种低成本的数字3D昆虫扫描仪

文摘   科学   2024-11-05 09:07   北京  

A low-cost digital 3D insect scanner






作者信息
Thanh-Nghi Doana,b,*, Chuong V. Nguyenc
aFaculty of Information Technology, An Giang University, An Giang, Vietnam

越南安江省安江大学信息技术系
bVietnam National University Ho Chi Minh City, Vietnam
越南胡志明市越南国立大学
cImaging and Computer Vision Group, CSIRO DATA61, Canberra, Australia
澳大利亚堪培拉 CSIRO DATA61 图像与计算机视觉组
文链接

https://doi.org/10.1016/j.inpa.2023.03.003

01
背景

在昆虫学实验室中,收集生物标本对于获取科学知识和描述自然物种特征至关重要。通过对标本进行数字化处理,使其更易于共享、检查、注释和比较,从而从实物收藏中获取有用信息至关重要。目前的研究主要集中在开发三维建模机器系统,以实现昆虫标本的数字化,尽管这些系统取得了很多成果,但也存在一些缺点,如成本高、模型建立时间长。因此,本研究提出了一种新的扫描机器,用于创建昆虫的三维虚拟模型。

02
创新点
1.使用微单相机代替传统的数码单反相机,最大限度减少了拍摄过程中的噪音和振动,有助于加快拍摄过程,并消除了拍摄时的失误,使昆虫的结构细节清晰可见,从而大幅提高了照片的质量
2.使用 “从运动看结构”(SfM)方法建立三维模型,省去了对图案化垫子装置的要求,也无需使用激光来定位昆虫标本,可有效减少对昆虫标本的损坏;
3.设计和制造简单,成本合理,仅为 5621美元,不到已报道研究的一半;
4.整个三维成像过程自动化,捕捉时间合理,可用于多种昆虫物种。
03
实验
创建昆虫三维虚拟模型的过程如图1所示,具体流程为:放置物理标本→堆叠微单相机拍摄图像→扩展景深图像聚焦→从不同方向自动获取样品的二维图像→建立三维昆虫网状模型。本研究所建立的三维昆虫扫描仪示意和实物图见图2。

作者使用177个数据集来评估之前发表的方程预测鸡蛋V和S的准确性和精度,见表1。另一方面,作者使用177个鸡蛋的L、B和W通过不同的方程来预测每个鸡蛋的V和S。然后,将方程得到的S和V与数字图像分析得到的S和V进行比较。结果表明,Paganelli和Narushin提出的方程给出了合理的R2,可以根据L和B预测S。

图1 创建昆虫三维模型过程概览


图2 三维昆虫扫描仪示意图(A)、昆虫实物样本(B)、系统图像(C)


表1列出了不同SfM应用程序在许可费、GPU、磁盘大小、三维重建模型时间和三维模型质量方面的比较结果。以半翅目昆虫为例,专有软件 Agisoft Metashape在建立高质量模型时却需要花费较少的时间,且建立的三维模型大小仅为 11.3MB,与Meshroom(27.6MB)和COLMAP(556MB)等开源软件相比要小得多。因此所开发三维昆虫扫描仪使用Metashape软件建立昆虫样本的三维模型

表1 不同先进 SfM 软件的三维重建结果对比

04
结论

这项研究开发了一种新型低成本三维昆虫扫描仪,可创建色彩准确、分辨率高、精度高的三维模型,且适用于体积小、结构复杂的昆虫样本。整个系统的成本约为5621美元,低于许多现有系统的成本。此外,整个三维成像过程自动化,捕捉时间合理,其中半翅目昆虫的三维模型大小为11.3MB,适用于大量生物博物馆藏品的三维数字化。所开发扫描仪易于安装和修改,可在各种环境和领域进行扩展和使用。未来的研究重点为如何为腿、翅膀和触角等非常小的物体创建高质量的三维模型。



引用格式

Doan T N, Nguyen C V. A low-cost digital 3D insect scanner. Information Processing in Agriculture, 2024, 11(3): 337-355.

编辑:葛全武
校对:鲁娜
审核:付学谦

日期:2024年11月5日


期刊简介

《农业信息处理(英文)》,创刊于2014年,由中国农业大学主办,李道亮教授主编,已被ESCIEIScopusDOAJ、中国科学引文数据库(CSCD)等数据库检索。2019年入选《中国科技期刊卓越行动计划》之高起点新刊项目,2020年入选中国农林核心期刊(A类)目录,2023年正式被ESCI(Emerging Sources Citation Index)收录2023年度首个影响因子7.7Q1区。《WJCI报告》学科排名位居全球TOP5%或学科排名TOP3,影响因子7.9082023Citescore21.1,在林学领域排名第2,在水生科学领域排名第3,在农学作物科学领域排名第3,在动物科学与动物学领域排名第4,在计算机科学及应用领域排名第15。主要刊载最新信息技术在农业的应用,包括:农业物联网、农业人工智能和大数据、农业机器人、农业能源与控制、农业供应链与管理、空间信息技术、信息技术在现代农业工程的应用和其他农信息化技术。


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