手把手教学|Trizol法提取RNA:从样本前处理到操作步骤

文摘   科学   2024-08-26 07:00   广东  

一、实验原理:

Trizol试剂的主要成分是苯酚,对细胞进行裂解,使细胞中的蛋白质以及核酸物质解聚。苯酚虽然可以有效的使蛋白质变性,但它不能完全抑制RNA酶的活性,因此Trizol中还加入了8-羟基喹啉、异硫氰酸胍、β-巯基乙醇等来抑制内源和外源RNase(即RNA酶)。存放在Trizol 中的样品可以在负八十保存半年左右。


二、样本处理方法:

  • 贴壁培养细胞

1. 吸出培养液,细胞用预冷的1×PBS清洗两次。

2. 吸出PBS洗液,然后每1×10^8-2×10^7的培养细胞中加入1mL的Trizol,轻摇培养皿,确保溶液均匀分布于细胞表面。(可用细胞刮刀剥离细胞)

3. 使用移液器反复吹打使细胞脱落,然后将内含细胞的裂解液转移至离心管中,再用移液器吹打直至裂解液中无明显沉淀(溶液清亮)。

4. 室温静置5-10分钟后,再进行后续的RNA提取操作。


  • 悬浮培养细胞

1. 将悬浮细胞收集至离心管中,12000rpm 4℃离心2分钟,弃上清,用预冷的1×PBS清洗两次。

2. 向1×10^6-2×10^7细胞中加入1mL的Trizol。

3. 用移液器吹打至裂解液清亮无明显沉淀。

4. 室温静置5-10分钟后,再进行后续的RNA提取操作。


  • 动物组织、植物材料样品

1. 将准确称取的RNA提取样品转移液氮预冷的研钵中,用研杵研磨组织(研磨过程中需要不断向研钵中补加液氮),直至研磨成粉末状,然后向粉末中加入适量的Trizol并混匀。(针对柔软易裂解的组织样本,可以使用匀浆器加入适量Trizol进行匀浆裂解。)

2. 将上述混合液转移至离心管中,用移液器反复吹打充分混匀。室温静置5分钟,12000rpm 4℃离心5-10分钟。

3. 小心吸取上清液,移入新的离心管中,再进行后续的RNA提取操作。

三、操作步骤:

(1)样本前处理。

(2)向上述裂解液中加入Trizol体积量1/5氯仿,充分混合(涡旋或用枪头混匀)。室温静置15分钟。

(3)12000rpm 4℃离心15分钟。小心取出离心管,此时匀浆液分为三层,即:上清液(含RNA)、中间蛋白层及下层有机相。吸取上清液转移至另新的离心管中。

注:每管大概取 200-300μL,此步骤非常关键,提出的RNA质量好纯度高即可。若吸取水相时吸到有机相会导致双峰,A260/230特别低。

(4)沉淀 RNA:向其中加入相同体积异丙醇,上下颠倒混匀。在-20℃放置10mins。12000rpm 4℃离心10mins后弃去上清。

(5)清洗 RNA:向沉淀中加入500μL预冷的无水乙醇,吹散沉淀洗涤RNA,洗涤两次,12000rpm 4℃离心后弃去上清。

注:把沉淀弹起来,让其悬浮在酒精中,然后放1-2mins,让酒精充分接触沉淀,充分溶解有机试剂,然后再离心。

(6)打开离心管,室温干燥沉淀约5分钟。

注:不要离心干燥,否则RNA将很难溶解,如果残留乙醇较多可延长干燥时间。

(7)向离心管中加入20μL DPEC水溶解RNA。将溶解后的RNA放入-80℃保存。

注:如果提取的是组织样本,溶解液可以多加点。

(8)取2μL进行电泳。


四、注意事项:

1. 防止RNA酶污染。

  • 戴好口罩,手套。

  • 全程最好在生物安全柜操作(根据实验条件)

  • 实验所涉及的试剂/溶液,尤其是水,必须确保RNase-Free。耗材均需要通过DPEC处理。

2. 明确目标。

  • 提取成功标准是RNA的质量和纯度,而不是得率。

3. 测量结果:

  • A260/A280:1.8-2.2,若<1.8则表明有蛋白质污染;

  • A260/A230:1.5-2.4,若<1.5则表明有明显的有机物如糖、肤、苯酚的污染。






本文作者是"等等"同学,在获得授权后,实验老司机将本文发表于公众号。
文稿:等等 
校对:煲仔饭
素材:Canva
参考资料:
  • https://images.app.goo.gl/nA6CTBzDRZE4pSTw6
  • https://images.app.goo.gl/XGPq7nQBPYGG2X7N6



往期文章推荐

手把手教学|RNA提取的实验步骤&注意事项


手把手教学|miRNA的逆转录和荧光定量PCR


手把手教学|CRISPR-Cas9系统:sgRNA的设计及质粒构建







实验老司机分享生命科学实验知识,通过短视频、在线讲座、直播演示帮助新手实验操作者完成从0到1的入门学习。

exdrive.cn
公众号、视频号、知乎、Bilibili
抖音、西瓜、今日头条、小红书
内容同步





实验老司机
关注老司机,实验不死机。实验老司机分享生命科学实验知识,通过短视频、在线讲座、直播演示帮助新手实验操作者完成从0到1的入门学习。
 最新文章