【高原生态】基于高通量测序分析拉萨大黄根部内生菌及根际土壤微生物多样性研究

文摘 2024-07-26 19:07 西藏

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基于高通量测序分析拉萨大黄根部内生菌及根际土壤微生物多样性研究

许鹏辉赵岳浩康泽兵李博文

（西藏大学生态环境学院西藏拉萨 850000）

摘要：以拉萨大黄根部内生菌和根际土壤微生物为研究对象，采用高通量测序技术对其测序并运用生物信息学和统计学方法进行分析，以探究拉萨大黄根部内生菌及根际土壤微生物多样性。结果表明，经过聚类注释后拉萨大黄根及根际土壤中真菌共有90个OTU（Operational Taxonomic Unit, OTU），特有OTU分别为452个和635个；根及根际土壤中细菌共有622个OTU，特有 OTU分别为982个和5 618个。α 多样性分析显示，与根部内生细菌相比拉萨大黄根际土壤细菌估计物种数量大，物种丰富度和均匀度高（P<0.05）；拉萨大黄根际土壤真菌比根部内生真菌的物种总数更多，但根际土壤真菌和根部内生真菌的群落多样性无明显差异（P>0.05）。基于β多样性分析得到拉萨大黄根部内生菌与根际土壤微生物的菌群结构存在显著差异（P<0.05、q<0.05）。从群落组成来看，在门水平上，真菌群落中拉萨大黄根及根际土壤的优势菌门为子囊菌门（Ascomycota），细菌群落中根部内生细菌相对丰度最高的为拟杆菌门（Bacteroidota），相对丰度为75.44%，在根际土壤中优势门为变形菌门（Proteobacteria），相对丰度为44.36%；在属水平上，真菌群落中根部可被分类的相对丰度最高的属为青霉属（Penicillium），相对丰度为21.8%，根际土壤中可分类的相对丰度最高的为截盘多毛孢属（Truncatella），相对丰度为26.16%。细菌群落中根部可被分类出来的相对丰度最高的为JC017，相对丰度为73.44%，根际土壤中可被分类的相对丰度最高的为Bacillus_BD，相对丰度为6.7%。

关键词：拉萨大黄；高通量测序；内生菌；根际微生物；微生物多样性

基金项目：2023年国家级大学生创新创业训练计划项目（202310694017）.

第一作者简介：许鹏辉，男，陕西商洛人，西藏大学生态环境学院教授，主要研究方向为植物生理生态、生物信息。

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