六月份总结

文摘   2024-11-30 10:30   中国香港  

六月份总结


以后每个月份的最后一天,我都会为公众号进行一次小小的总结。


六月份开始,公众号上总共开展了2个专题内容, 分别是在模仿中精进数据可视化基因家族分析
这两部分的专题内容,无论是从浏览量还是加我微信的角度来看,可以说是受到了广大网友的肯定。

  • 在模仿中精进数据可视化

在模仿中精进数据可视化合集
在模仿中精进数据可视化_R语言复现Nature Microbiology中的拟合曲线
在模仿中精进数据可视化_R语言复现Nature Microbiology中的气泡图
在模仿中精进数据可视化_R语言绘制Cell中的柱形图
在模仿中精进数据可视化_R语言实现Nature Microbiology中的无缝拼图
在模仿中精进数据可视化_使用ggplot2绘制相关性热图
在模仿中精进数据可视化 R语言绘制Nature正刊中的雷达图
在模仿中精进数据可视化:R语言绘制Journal of Transl Medicine中的热图
在模仿中精进数据可视化_R&Python绘制Nature_Medicine中的时序图
在模仿中精进数据可视化 使用ggtree绘制Nature Mircobiology的Fig1
在模仿中精进数据可视化_使用ggtree绘制Nature_Microbiology的Fig5b
在模仿中精进数据可视化_使用网络图绘制不一样的GO和KEGG可视化
在模仿中精进数据可视化_使用circlize绘制不一样的GO和KEGG可视化
在模仿中精进数据可视化_使用ggplot2绘制Nature_Microbiology的Figure3
在模仿中精进数据可视化 使用ggplot2绘制Nature Microbiology的Figure1c
在模仿中精进数据可视化_使用ggplot2绘制Nature Medicine Fig5
在模仿中精进数据可视化_使用ggplot2绘制Nature_Microbiology的Figure2a
在模仿中精进数据可视化_使用ggplot2绘制Nature Microbiology的Figure2b
在模仿中精进数据可视化_使用ggplot2绘制Nature Microbiolog的Figure1d
在模仿中精进数据可视化_使用ggtree绘制Nature Microbiology的Figure1
在模仿中精进数据可视化_使用ggplot2和ggh4x绘制定化的相关性热图
在模仿中精进数据可视化_使用俊哥开发的ggcirclize绘制circos圈图
在模仿中精进数据可视化_使用ggtree&ggplot2绘制散点图组合图
在模仿中精进数据可视化_使用ggplot2绘制森林图
在模仿中精进数据可视化_使用ggplot2绘制发表级的扇形图
在模仿中精进数据可视化_使用ggtree进行进化树的美化
在模仿中精进数据可视化_R语言进行单因素方差分析及可视化
在模仿中精进数据可视化-R-云雨组合图
在模仿中精进数据可视化-R-线性拟合加公式以及相关系数
在模仿中精进数据可视化-R-好看的火山图
在模仿中精进数据可视化-Python初识matplotlib
在模仿中精进数据可视化-R语言绘制象限散点图+注释
在模仿中精进数据可视化--RPython绘制散点图/气泡图
在模仿中精进数据可视化-PCA主成分分析
在模仿中精进数据可视化-ggplot2绘制火山图
在模仿中精进数据可视化-ggplot2绘制气泡图
在模仿中精进数据可视化-ggplot2散点图+显著性
在模仿中精进数据可视化-ggplot2+ggtree复现Nature Microbiology的Figure1

  • 基因家族分析

模仿中精进数据可视化_基因家族十张图
基因家族分析01_基因家族环境配置和基因组数据的下载
基因家族分析02_hmmsearch筛选基因家族成员
基因家族分析03_blast筛选家族成员
基因家族分析04_hmmsearch&blast结果鉴定、Python自动化爬取家族成员信息
基因家族分析05_序列比对以及进化树的构建和可视化
基因家族分析06_进化树_结构域_motif_基因结构四合一可视化
基因家族分析流程07_物种内染色体定位共线性(基因复制)分析及可视化
基因家族分析流程08_物种间_共线性分析_kaks分析及可视化
基因家族分析流程_09.启动子分析及可视化
基因家族分析流程_10.GO功能注释及可视化
基因家族分析流程11_蛋白质互作网络PPI



七月份的计划:首先基因家族分析还剩下2个推文就结束了。那么我肯定会为其进行一个完美的收尾。
届时,我会以一个项目实战,从头到位把基因家族分析整合好。并且将其写一个完整的项目分析报告,里面不仅仅包含了常规的基因家族的分析,还会涉及到R语言和Python语言的编程、数据清洗和数据可视化
我个人还是认为是诚意满满,良心满满的


除此之外,在模仿中精进数据可视化我会继续持续更新。希望大家能给我一些好看的图片以及附上原文

未来展望,我会和我的好朋友以及师兄们有更加深度的合作,同时会在单细胞转录组方面走很长的路。期待大家能和我一起学习和进步下去。


历史绘图合集


进化树合集


环状图


散点图


基因家族合集


基因组共线性


WGCNA ggplot2版本


其他科研绘图


合作、联系和交流

有很多小伙伴在后台私信作者,非常抱歉,我经常看不到导致错过,请添加下面的微信联系作者,一起交流数据分析和可视化。


RPython
人生苦短,R和Python。
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