浙大医学院刘颖、马拥军等:宏基因组二代测序技术(mNGS)在感染性疾病中的临床应用

学术   2024-07-31 19:54   浙江  

内容介绍

中文摘要

传染病对人类健康产生巨大威胁。快速准确地检测出病原体对于传染病的诊断和治疗非常重要。宏基因组二代测序技术(mNGS)能无差别检测样本中所有的核酸(DNA和RNA)。随着测序和生物信息学技术的发展,mNGS正从实验室研究向临床应用迈进,为病原体检测开辟了新的途径。大量研究表明,mNGS在感染性疾病的临床应用中具有良好的潜力,尤其适用于难检测、罕见和新型病原。但是,mNGS在临床应用中仍存在一些问题:(1)缺乏通用的、可验证的工作流程和质量保证;(2)对高宿主背景和低生物量的样本不敏感;(3)缺乏对海量数据分析和报告解读的标准化指导。因此,全面了解这项新技术将有助于促进mNGS在感染性疾病中的临床应用。本文简要综述了二代测序技术的发展历史、主流测序平台和mNGS工作流程,并讨论了mNGS在感染性疾病中的临床应用及该技术的优缺点。

关键词组:宏基因组二代测序技术(mNGS);感染性疾病;脑脊液(CSF);牛津纳米孔技术(ONT);微生物群

作者: 

刘颖,马拥军


本文引用格式:

Ying LIU, Yongjun MA. Clinical applications of metagenomics nextgeneration sequencing in infectious diseases[J]. Journal of Zhejiang University Science B, 2024, 25(6): 471-484. 

http://doi.org/10.1631/jzus.B2300029

本文精要导读:

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