《合成生物学》推荐 | 给合成生物学“定量”:广东省自然科学奖一等奖刘陈立

文摘   2024-10-22 16:37   北京  

2023年度●广东省科技大会

10月17日,全省科技大会在广州召开,会上颁发了2023年度广东省科学技术奖。中国科学院深圳先进技术研究院刘陈立研究员(图左二)作为第一完成人的“生物有序性的定量合成生物学研究”项目获得自然科学奖一等奖。


该项目针对合成生物学中“缺乏理性设计能力”这一核心瓶颈,为构建稳定合成多细胞系统、预测物种迁移定植的最优策略等问题提供了基础理论指导;突破了领域内半个多世纪以来的经典理论框架,为理解细菌细胞生长、复制、分裂的协同机制带来了全新的视角,推动了“定量合成生物学”这一新学科的提出,提升合成生物系统的理性设计能力。


在著名科学哲学家库恩的范式论里,范式的突破会导致科学革命,从而使科学获得一个全新的面貌。而刘陈立研究员的研究也给“定量合成生物学”领域提出来一种新范式。


合成生物学正成为推动下一代生物制造和生物经济发展的强大引擎。二十多年来,随着DNA合成、基因编辑等技术的不断革新,人们对于合成生物系统的构建能力迅速提升,但设计能力仍然十分有限。由于生物系统的复杂性,即使科学家们已经了解各个生物元件的功能,但将其组合在一起所产生的生物系统,却不一定会表现出预期的功能。


据了解,目前大部分合成生物系统的构建主要依靠人工反复试错,这种方法速度慢、效率低,极大地限制了合成生物学的发展。因此,合成生物学目前面临的最大挑战之一,就是如何提高理性设计的能力。


刘陈立团队提出

所谓理性设计,就是基于“预测”的设计。当把生物分子、基因、线路组合为合成生物系统时,如果能对其行为进行精确预测,就能预知如何构建系统以获得预期的功能,从而避免反复试错。


对此,作者总结出定量合成生物学三种理性设计的范式:基于原理的设计、“自下而上”的设计和人工智能辅助的设计。


刘陈立指出,“定量合成生物学”可以作为合成生物学未来的发展方向。定量合成生物学吸纳了定量生物学与系统生物学的思维与方法,通过建立可定量预测生物系统的数理或AI模型,能够有效指导合成生物系统的设计与构建,从而解决“理性设计”这一合成生物学的瓶颈问题。


本文来源:“中国科学院深圳先进院”微信公众号


责任编辑:焦欣渝 杨蕴力

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