Actin 不灵了?PNAS 告诉你为什么做 WB 一定要跑双内参

文摘   2024-12-10 22:25   美国  

免费资源:

一、国自然类:


1 2023历年国自然标书全文

3 国自然项目答辩PPT

5 标书写作模板

7 GraphPad 9安装包

2 2018-24年国自然清单

4 基金插图素材(可编辑)

6 近10年国自然标书全文

二、SCI生信+实验类:

1 160套SCI实验操作视频

3 Meta分析范文+教程

5 泛癌分析万能代码

7 130套SCI实验视频

9 单细胞数据挖掘课

11 统计分析万能模板

2 100个SCI实验Protocol

4 miRNA预测靶基因代码

6 动物实验操作视频汇总

GEO/TCGA数据挖掘课

10 SCI写作万能模板

三、科研绘图类:

PPT科研绘图素材合集

3 Adobe illustrator绘图素材

5 动物实验矢量图素材

7 PS修各种SCI实验图视频

资源共享群

PPT科研绘图插件VIP版

4 各种实验仪器矢量图素材

6 细胞实验矢量图素材

AI科研绘图视频课

10 亲交友微信群


一、今日推送:
近期,PNAS上刊发了一篇题为 AMBRA1 levels predict resistance to MAPK inhibitors in melanoma 的论文通过大量WB 「双内参」来精准检测 AMBRA1 和 FAK1 的蛋白表达水平,以确保实验结果的准确性和可重复性。从而揭示了 AMBRA1 蛋白水平是预测黑色素瘤对 MAPK 抑制剂反应的重要生物标志物,并为开发针对 MAPK 抑制剂抗性的新治疗策略提供了可能的靶点。

通览文中的 WB 数据结果,其中之一的内参就是我们常用的看家蛋白(文中分别使用了 Actin 或Vinculin 或 β-tubulin),另外一个固定使用的内参是 Stain-Free 。采用「看家蛋白」+「Stain-Free」的双内参模式为 WB 实验数据保驾护航。从文献中的图片结果来看,也是「赏心悦目」!


图源:论文截图


为什么这篇论文中 WB 实验使用了双内参?而「Stain-Free」又是什么?


双内参:为科研结果加上双保险


在 WB 实验中,内参是用于校正样品加载量和检测过程中可能出现的变异性的关键因素。传统的内参,如 Actin 或 Tubulin,因其在细胞中相对稳定的表达水平而被广泛使用。但一个 Actin 可能不灵,特别是在细胞类型、生理状态或病理条件改变时,这些传统内参的表达水平也可能发生变化。



例如论文中 Figure 5 中展示的 H 图。图中传统内参 Vinculin 显示出了不均一的条带变化,但是 Stain-Free 展示的总蛋白说明上样量是一致的。那么这种情况下,我们就不应该按照 Vinculin 的提示再去调平上样量了。如果仅使用 Vinculin 一种内参,那么实验者则不得不调整上样量,增加实验操作是小事,最终更会导致目的蛋白表达定量失真,那就是非常不幸的结果了!


在很多 WB 实验中,我们总是感觉目的蛋白表达趋势不对劲,也许问题就出在我们使用的内参上。


Stain-Free 技术通过对凝胶或印迹膜上总蛋白进行荧光标记来检测蛋白质的存在及样品加载量,从本质而言,Stain-Free 是一种总蛋白内参方法。与传统的总染色方法(如考马斯亮蓝),及看家蛋白内参相比,具有以下优点:



因而,在 WB 实验中,Stain-Free 技术可以作为第二个内参(loading control)来评估样品加载的一致性,确保实验结果的准确性。接下来我们回归论文,一起来看看这篇论文的具体数据吧!


看双内参在 Figure 中的优异表现



Figure 1:展示了在黑色素瘤患者样本中 AMBRA1 表达水平与 MAPK 抑制剂抗性之间的关系。通过 WB 技术,研究人员观察到在治疗抵抗性黑色素瘤样本中 AMBRA1 的表达水平下降。



Figure 3:利用 WB 技术,研究人员发现在 AMBRA1 表达水平较低的黑色素瘤细胞中,FAK1 的活化增加,这与 MAPK 抑制剂的抗性有关。此外,WB 还被用来展示 AMBRA1 水平的调节如何影响黑色素瘤细胞对 MAPK 抑制剂的反应。



Figure 5:通过 WB 分析,研究人员揭示了在 AMBRA1 表达水平较低的黑色素瘤细胞中,FAK1 信号通路的活化与 BRAFi(一种 MAPK 抑制剂)的抗性有关。WB 结果显示,AMBRA1 的缺失与 FAK1 的磷酸化水平增加相关联。


这些 Figure 通过 WB 技术的应用,不仅证实了 AMBRA1 在黑色素瘤对 MAPK 抑制剂抗性中的作用,还揭示了 AMBRA1 与 FAK1 信号通路之间的联系,为未来的治疗策略提供了新的视角。


那我们把今年培训的国自然内部资料一次性免费发送给大家(新手完全可以按照别人中过的标书模仿着写,老手也可以参考别人标书中的套路是怎么回事):


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这些标书都是全网首发,第一次发送出来,需要的赶紧收藏起来吧。资源如下



一、2018-2024国自然中标项目清单:



比如生科院和医学院的:



如医学部有1万左右:



二、国自然中标项目标书全文:


这都是已经中标的标书全文,对我们参考非常有用,部分截图如下:


(模糊截图,高清请下载)


三、几十套杰青、优青申报PPT(可编辑)


对于申报杰青、优青、长江的科研人员,一份已中的PPT模板可以很好的参考,思路逻辑格式等等:



比如优青答辩PPT:



再比如杰青的答辩:



好了,这些资料我们都已经打包好了放在百度云了,大家赶紧保存到自己的百度云中吧,非常有用。



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二、资源免费送:

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这些都是分析数据就能发SCI,比如NHANES临床数据库,它几乎适合大部分的临床科室,如:各大内科、口腔科、眼科、检验科、儿科、妇科、生殖科等,但不包括肿瘤外科以及各大需要开刀动手术的科室,也不包括核磁共振以及超声检查,中医目前也不适合。检索一下已经发表的看看,看能不能不做实验只挖掘数据发SCI:

第一步,打开 PubMed 数据库,网址:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/第二步,输入检索式:(NHANES[Title/Abstract]) AND (N[Title/Abstract])此处的 N = 你所在科室的各种常见疾病,比如神内就搜个「阿兹海默」吧,英文是「alzheimer」,那么检索式就是:(NHANES[Title/Abstract]) AND (alzheimer[Title/Abstract])



发的还是比较少的,套路也很简单,先选取患者(如成年T2DM患者),随后选取指标进行分析(如分别通过肝刚度测量的中值(LSM)和控制衰减参数(CAP)来评估肝纤维化和脂肪变;采用Logistic回归分析来评估他汀治疗与脂肪变和晚期(≥F3)肝纤维化之间的相关性)。最后结果就是评价有没有相关性。这样就是一篇2区的文章。


所以,大家赶快免费领取这7套课:


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这7套实操课,都是非常完整的课程,入门到精通,就非常好。按照实操教程,分分钟就能发表SCI。涵盖了孟德尔随机化分析,联合免疫、代谢、肠道菌群,还有PheWAS分析、NHANES分析等。



一共130GB,赶紧保存到自己的百度云,按照操作教程先发一篇SCI再慢慢学吧。毕竟发了SCI才是硬道理。


部分截图如下(课程+课件+代码都是齐全的哦,只是这里篇幅有限,我就部分截图了):



这些我都已经上传百度云了,大家赶紧免费保存吧:


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三、免费资源:

顶级CNS插图如下:



但是自己画一只小鼠可能需要花一整天的时间。


所以,今天小编给大家免费赠送:


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生物医学之家CNS插图素材部分截图如下:



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一、比如我需要用到小鼠插图来描述自己的小鼠动物实验模型,那就直接搜索鼠,有几百张小鼠插图就出现了:



有了VIP账号之后就可以随意下载。下载下来是AI绘制的可编辑图:



可以随意修改颜色:



也可以随意修改大小:



Ctrl+c和V复制粘贴到自己的画板中,并对齐:



随后画一条线,示意要D369打药:



随后添加字体,这样审稿人一看就知道你做了什么动物模型。



最后保存和导出,一定要记得保存,保存就是矢量图了,以后还能修改。导出就是导出为图片,用来讲PPT或者投稿。



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还有,我们下载的素材,也可以右键取消分组:



然后修改任何一个你想要修改的元素,比如修改液体的颜色:



也可以将注射器放在背上,模拟皮下注射:



还可以将小鼠变为黑色:



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二、比如我需要绘制细胞机制图。那就搜索细胞:



有了这些素材,分分钟就可以绘制如下这种高分插图:



三、各种Nature插图原图:



下载下来之后每个细微的元素都可以修改:




我们一共上传1万张Nature插图。大家赶紧获取永久VIP账户吧,投稿绘图的时候用得着:


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更多免费资源:

三、科研绘图类:

1 GraphPad绘图模板

50套R绘图万能代码

直装版PS+AI安装包

医学统计分析R版

9 单样本RNAseq分析

11 SnapGene序列比对

13 Endnnote安装包

15 R语言绘图模板

17 中文版RNAseq教程

19 Image J图片处理视频

21 更多资源在更新中.....

2 600套PPT模板

4Origin绘图模板

SPSS统计分析模板

8 铜铁死亡分析代码

10 m6A甲基化分析代码

12 qPCR计算模板

14 英文简历模板

16 R各种统计分析模板

18 46套生信分析代码

20 Sigma plot绘图软件和视频

四、生信和写作类:

1 ChIPqPCR引物设计

3 过表达引物设计

零代码复现6分SCI教程

零代码复现4分SCI教程

WGCNA分析课程

11 GO分析傻瓜式教程

13 GSEA分析傻瓜式教程

15 渐变火山图傻瓜式教程图

17 GEO+TCGA数据挖掘课

19 41GB的生信分析+实验资源

2 shRNA设计

4 Crispr-csa9素材

零代码复现5分SCI教程

8分SCI零代码复现步骤

10 超全生信数据库使用教程

12 KEGG富集分析教程

14 Meta分析范文+实操课

16 交集基因筛选高级教程

18 生信软件合集

辛苦整理,全文无任何广告!

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