2024年10月10日,浙江大学农业与生物技术学院都浩研究员团队在Plant communications在线发表了题为“Developing an FBP-based bioluminescence reporter system for studying transcriptional regulation in plants”的研究论文,开发了一种基于真菌生物发光途径FBP的新型转录调控报告系统。
https://doi.org/10.1016/j.xplc.2024.101143
研究背景
研究内容
本研究利用FBP这一优势开发了一种基于真菌生物发光途径的报告系统,该系统利用植物自身的咖啡酸作为底物,以NnLuz基因作为报告基因,从光量子数和NnLuz表达量两个方面定量检测蛋白质-DNA的相互作用强弱。此外作者将FBP-Luz报告系统与AlphaFold 3相结合,开发了一个针对植物中转录因子靶点DNA的基序,其中包括多个TFs的结合位点。通过操纵这些结合位点来调节亲和力,可以创建多个启动子的变体,用于研究顺式作用元件的功能及顺式作用元件的定向进化。研究人员成功利用此报告系统在烟草叶片、向日葵花瓣和矮牵牛叶片中评估了三组水稻转录因子-启动子复合物(OsDREB1C-pOsRBCS3、OsJAMYB-pOsAGO18、OsbZIP42-pOsPER1A)的结合亲和力和特异性,以及条件依赖性蛋白质-DNA的相互作用。
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