诺奖解读 | 南大团队与microRNA的二十年

教育   2024-10-28 17:13   上海  



    2024年诺贝尔生理学或医学奖授予Victor Ambros及Gary Ruvkun,以表彰他们“发现microRNA及其在转录后基因调控中的作用”。为此我们邀请到南京大学生命科学学院陈熹教授,为本次诺奖进行解读。





背景引入



    microRNA(简称miRNA)是一类长度约为21至25个核苷酸的RNA分子。它们通过与目标mRNA的3'非翻译区(3' -UTR)结合,调控基因表达,通常通过抑制翻译或促进mRNA降解来实现。miRNA在细胞发育、增殖、分化和凋亡等生物过程中发挥重要作用,并与多种疾病(如癌症、心血管疾病和神经退行性疾病)的发生和发展密切相关。因此,miRNA不仅是研究基因调控的关键分子,也被视为潜在的生物标志物和治疗靶点。


miRNA的前世与今生






    “这次诺奖揭开了microRNA的一角,是启迪性的,具有奠基性的一个工作”



    20世纪90年代末,Victor Ambros 和 Gary Ruvkun在Horvitz实验室研究秀丽隐杆线虫,他们发现短RNA分子 lin-4可以与 lin-14 mRNA中的互补序列相匹配,从而抑制lin-14表达。lin-4是最早发现的miRNA,这一发现在当时并未受到重视。因为lin-4属于在进化过程中逐渐丢失的microRNA,能在线虫里找到,在其他生物中找不到,所以它被认为是低等动物的偶然现象,沉寂了7年。

    “Ambros是一个很佛系的人,他就在他的线虫上做……但是Gary Ruvkun不一样,他又做了好多个物种的microRNA。”

    2000年, Ruvkun研究小组发现了由 let-7 基因编码的 microRNA,这段序列高度保守,存在于整个动物界。这证明了microRNA的病理生理学意义,引起了人们的极大兴趣。

图片来源:www.nobelprize.org



microRNA发展的黄金时期



    2000年以后,microRNA研究进入黄金时期,大量研究人员开始克隆和发现不同物种中的microRNA序列。2006年,二代测序技术发展,高通量技术能够测出量很低的microRNA,且测序深度更深,microRNA的检测变得更加容易。截至目前,microRNA 基因数据库 miRBase已收集到271种生物的 38,000 多个发夹结构前体和 48,860 个成熟 microRNA 基因序列。

    研究者开始探索microRNA的生成机制和生物学功能,发现其在基因表达调控中的关键作用。通过microRNA的敲除和过表达,发现microRNA与多种疾病的关系,其表达水平的变化可能与疾病状态相关联。基于 microRNA 的诊断和治疗方法在代谢紊乱、心血管疾病、神经退行性疾病和癌症等疾病的开发方面正在取得进展。



microRNA的前景与未来



    陈熹教授介绍,未来microRNA的研究会“往复杂系统上走,同时往转化应用上走”。

    人类有几千个microRNA,一个microRNA调控几百个基因,这是一个错综复杂的网络,目前的方法通量低、工作量大而且很难解释复杂的调控网络。下一阶段,很可能就是人工智能与microRNA结合,用计算信息的方法从头合成、设计microRNA,甚至通过完全计算的方法摸清作用规律、生物学功能,把交叉的、复杂的网络鉴定出来。

    此外,microRNA的发展与疾病发生发展以及农业、环境都密切相关,具有很大的应用价值。比如制药方面, “microRNA是双刃剑,它的靶基因多既是它强大的一点,也是做药的瓶颈问题”。一个microRNA能识别200个以上的基因,规范microRNA可能调控好一系列靶基因的紊乱。同时,调控的基因多也可能带来药物的副作用。未来药物开发主要涉及microRNA的精准调控,包括递送更加精准,作用更加精准,稳定性更加精准。

南大团队与microRNA




    团队从“白手起家”,一步步摸索,建立了高通量测序和PCR技术平台,利用二代测序技术实现快速检测,奠定了后续研究的基础,并对多种物种的基因组进行测序来研究验证物种进化树。

    他们还首次在人类血清中检测到了游离在细胞外的microRNA,这一发现挑战了传统观点,揭示了细胞外microRNA的存在及其潜在生物学意义。研究重点随之从基础功能转向探索细胞外RNA的生理和病理功能,开创了新兴的研究领域。

    细胞外RNA在内分泌调控和细胞间通讯中发挥重要作用,可能作为疾病的生物标志物或治疗手段。以及细胞外RNA在体内作为微调机制应对环境变化(如温度、饮食、运动和精神压力),这些研究不仅推动了细胞外RNA领域的发展,具有开创性的意义,也为疾病治疗和诊断提供了新的思路。







教授寄语




    microRNA研究需要投入大量时间精力。实验室目前主要做的是动物和细胞实验,要一代代地看下去,必须要有决心、毅力还有时间。欢迎对相关领域感兴趣的同学加入研究团队!







南京大学生命科学学院

来源 / 南京大学生命科学学院学生会

采访 / 陈鹏昊、邵宇霏

文编 / 邵宇霏

美编 / 胡笑炎

责编 / 祝安琪

南京大学生命科学学院
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