7867元单细胞空间转录组学实战培训课免费送!

文摘   2025-01-21 22:31   美国  

免费资源:

一、国自然类:


1 2023历年国自然标书全文

3 国自然项目答辩PPT

5 标书写作模板

7 GraphPad 9安装包

2 2018-24年国自然清单

4 基金插图素材(可编辑)

6 近10年国自然标书全文

二、SCI生信+实验类:

1 160套SCI实验操作视频

3 Meta分析范文+教程

5 泛癌分析万能代码

7 130套SCI实验视频

9 单细胞数据挖掘课

11 统计分析万能模板

2 100个SCI实验Protocol

4 miRNA预测靶基因代码

6 动物实验操作视频汇总

GEO/TCGA数据挖掘课

10 SCI写作万能模板

三、科研绘图类:

PPT科研绘图素材合集

3 Adobe illustrator绘图素材

5 动物实验矢量图素材

7 PS修各种SCI实验图视频

资源共享群

PPT科研绘图插件VIP版

4 各种实验仪器矢量图素材

6 细胞实验矢量图素材

AI科研绘图视频课

10 亲交友微信群



一、今日推送:
抓紧热点技术,单细胞空间转录组学数据分析赶快自学起来:

1. 数据预处理

  • 质控(Quality Control):
    检查原始数据的质量,例如读数数目、基因检测数目等;过滤低质量的spots。

    工具:Seurat, Scanpy, Space Ranger

  • 空间位置对齐:
    根据显微图像对spots与组织切片进行空间位置标定。

    工具:Space Ranger, STUtility


2. 数据标准化与降维

  • 归一化与标准化:
    对原始数据进行归一化(如CPM、log-normalization)和批次效应校正(如Harmony)。

  • 降维分析:
    通过PCA、t-SNE或UMAP对高维数据进行降维,展示样本的整体分布特征。

    工具:Seurat, Scanpy, Harmony


3. 空间聚类

  • 基于基因表达的聚类:
    在空间维度上对spots进行无监督聚类(如Louvain、K-means),识别不同的空间功能区。

    工具:Seurat, Scanpy, Giotto

    • 聚类结果通常通过UMAP/空间热图可视化。


4. 差异分析与标记基因识别

  • 差异表达分析:
    通过比较不同空间簇或感兴趣区域之间的基因表达,识别差异基因。

  • 标记基因分析:
    筛选各簇的特异性基因,进行功能注释和通路富集分析。

    工具:DESeq2, limma, Seurat


5. 空间基因表达模式分析

  • 空间可视化:
    可视化关键基因在组织中的空间分布模式,寻找功能热点区域。

    工具:STutility, Seurat, Giotto

    • 热图/点图展示关键基因表达。


6. 数据整合与功能注释

  • 与单细胞数据整合:
    将空间转录组数据与scRNA-seq数据整合,注释spot的细胞类型。

    工具:Cell2location, Seurat, Tangram

  • 通路富集分析:
    基于差异基因进行GO/KEGG分析,注释其功能意义。

    工具:ClusterProfiler, EnrichR


7. 验证与实验设计

  • 生物学验证:
    设计实验验证关键基因和信号通路(如免疫荧光染色)。

  • 功能实验:
    探索感兴趣区域基因的生物学作用。


8. 高质量可视化与结果输出

  • 空间图谱:
    生成直观、清晰的空间基因分布图或分区图。

  • 文章图表:
    整理高质量图片,用于论文或报告展示。

    工具:ggplot2, Seurat, Adobe Illustrator


所以,今天给大家免费送:

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已经上传到百度云了,大家免费保存起来,自学起来。原价7867元的线下培训课,现在免费送啦,理论+实操+实战代码,分分钟学会:


讲原理:


文献套路解读:


实战:


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二、资源免费送:

那我们把今年培训的国自然内部资料一次性免费发送给大家(新手完全可以按照别人中过的标书模仿着写,老手也可以参考别人标书中的套路是怎么回事):


“2018-2024国自然标书清单+标书全文+答辩PPT(原价7878元)”

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这些标书都是全网首发,第一次发送出来,需要的赶紧收藏起来吧。资源如下



一、2018-2024国自然中标项目清单:



比如生科院和医学院的:



如医学部有1万左右:



二、国自然中标项目标书全文:


这都是已经中标的标书全文,对我们参考非常有用,部分截图如下:


(模糊截图,高清请下载)


三、几十套杰青、优青申报PPT(可编辑)


对于申报杰青、优青、长江的科研人员,一份已中的PPT模板可以很好的参考,思路逻辑格式等等:



比如优青答辩PPT:



再比如杰青的答辩:



好了,这些资料我们都已经打包好了放在百度云了,大家赶紧保存到自己的百度云中吧,非常有用。



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三、免费资源:

顶级CNS插图如下:



但是自己画一只小鼠可能需要花一整天的时间。


所以,今天小编给大家免费赠送:


“生物医学之家CNS插图可编辑素材永久VIP账户”


生物医学之家CNS插图素材部分截图如下:



这些素材都是用Adobe illustrator绘制的,打开后可以继续编辑修改,这些素材原价是9999元的,现在免费给大家送永久账户。如下免费获取永久VIP账户:


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免费发送1万个永久VIP账户,有了这个账号之后,你可以无限、永久下载生物医学之家的CNS插图素材。共有1万张素材,囊括了各种生物、人体组织、细胞、病毒、植物等。素材首页如下:



一、比如我需要用到小鼠插图来描述自己的小鼠动物实验模型,那就直接搜索鼠,有几百张小鼠插图就出现了:



有了VIP账号之后就可以随意下载。下载下来是AI绘制的可编辑图:



可以随意修改颜色:



也可以随意修改大小:



Ctrl+c和V复制粘贴到自己的画板中,并对齐:



随后画一条线,示意要D369打药:



随后添加字体,这样审稿人一看就知道你做了什么动物模型。



最后保存和导出,一定要记得保存,保存就是矢量图了,以后还能修改。导出就是导出为图片,用来讲PPT或者投稿。



还在等什么?赶快免费获取账号呀,发SCI、作图的时候肯定用得着。


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还有,我们下载的素材,也可以右键取消分组:



然后修改任何一个你想要修改的元素,比如修改液体的颜色:



也可以将注射器放在背上,模拟皮下注射:



还可以将小鼠变为黑色:



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二、比如我需要绘制细胞机制图。那就搜索细胞:



有了这些素材,分分钟就可以绘制如下这种高分插图:



三、各种Nature插图原图:



下载下来之后每个细微的元素都可以修改:




我们一共上传1万张Nature插图。大家赶紧获取永久VIP账户吧,投稿绘图的时候用得着:


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更多免费资源:

三、科研绘图类:

1 GraphPad绘图模板

50套R绘图万能代码

直装版PS+AI安装包

医学统计分析R版

9 单样本RNAseq分析

11 SnapGene序列比对

13 Endnnote安装包

15 R语言绘图模板

17 中文版RNAseq教程

19 Image J图片处理视频

21 更多资源在更新中.....

2 600套PPT模板

4Origin绘图模板

SPSS统计分析模板

8 铜铁死亡分析代码

10 m6A甲基化分析代码

12 qPCR计算模板

14 英文简历模板

16 R各种统计分析模板

18 46套生信分析代码

20 Sigma plot绘图软件和视频

四、生信和写作类:

1 ChIPqPCR引物设计

3 过表达引物设计

零代码复现6分SCI教程

零代码复现4分SCI教程

WGCNA分析课程

11 GO分析傻瓜式教程

13 GSEA分析傻瓜式教程

15 渐变火山图傻瓜式教程图

17 GEO+TCGA数据挖掘课

19 41GB的生信分析+实验资源

2 shRNA设计

4 Crispr-csa9素材

零代码复现5分SCI教程

8分SCI零代码复现步骤

10 超全生信数据库使用教程

12 KEGG富集分析教程

14 Meta分析范文+实操课

16 交集基因筛选高级教程

18 生信软件合集

辛苦整理,全文无任何广告!

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科研部
由哈佛医学院及国内高校硕博们创办,一个共享临床论文、科研实验、生信挖掘、雅思托福等资源的平台!
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