15套GEO/TCGA数据挖掘发SCI实操课免费送!

文摘   2024-11-03 22:03   美国  

免费资源:

一、国自然类:


1 2023历年国自然标书全文

3 国自然项目答辩PPT

5 标书写作模板

7 GraphPad 9安装包

2 2018-24年国自然清单

4 基金插图素材(可编辑)

6 近10年国自然标书全文

二、SCI生信+实验类:

1 160套SCI实验操作视频

3 Meta分析范文+教程

5 泛癌分析万能代码

7 130套SCI实验视频

9 单细胞数据挖掘课

11 统计分析万能模板

2 100个SCI实验Protocol

4 miRNA预测靶基因代码

6 动物实验操作视频汇总

GEO/TCGA数据挖掘课

10 SCI写作万能模板

三、科研绘图类:

PPT科研绘图素材合集

3 Adobe illustrator绘图素材

5 动物实验矢量图素材

7 PS修各种SCI实验图视频

资源共享群

PPT科研绘图插件VIP版

4 各种实验仪器矢量图素材

6 细胞实验矢量图素材

AI科研绘图视频课

10 亲交友微信群

一、今日推送:

我相信很多人也在自学生信发SCI:


但是都是公众号这里看一点,那里看一点,知识非常零散。我们建议大家一定要系统化的学习少走很多弯路。所以,今天给大家免费发送的是:


【15套GEO/TCGA数据挖掘发SCI实操课】


这里面都是按照范文套路进行实操讲解,比如5分的套路、3分的套路,一步一步零基础入门到精通!有了这些代码,自己完全可以修改参数,完成个性化分析发一篇SCI。

免费领取方式:

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反正也是免费发送给大家的,有了这些系统化学习的视频教程,任何一套视频都能发一篇 3、5分的SCI论文。这15套课程的目录如下(建议大家按照我的自学顺序,我觉得有用):


资源如下:

GEO数据挖掘ceRNA机制(19节课,适用于肿瘤非肿瘤)

01、数据库简介

02、下载数据

03 ID转换

04 添加基因属性

05 差异表达

06 热图绘制

07 GPL转fasta

08 重注释比对结果

09 比对结果ID转换

10 基因属性

11 基因表达和火山图

12 绘制热图

13 lncRNA结合的miRNA

14 miRNA靶基因的预测mp4

15Cytoscape输入文件准备

16CeRNA网络构建

17基因名称转换为基因ID

18GO分析

19KEGG分析

20 课程数据文件及万能代码


二、

TCGA数据lncRNA共表达网络构建(8节课,肿瘤)

01.共表达方法预测lncRNA靶基因简介_ok

02.基因矩阵文件加上基因属性_ok

03.LncRNA共表达分析_ok

04.基因名字转换成基因id_ok

05.靶基因的GO富集分析_ok

06.靶基因的KEGG富集分析_ok

07.富集结果中的id转换成symbol_ok

08 课程数据文件及万能代码


TCGA数据挖掘视频教程一(15节课,挖掘差异基因)

01、数据库简介

02、网页下载数据

03、命令行下载数据

04、生成矩阵

05、id转换成基因名

06、差异表达介绍

07、edgeR差异表达

08、DESeq差异表达

09、miRNA数据下载与整理

10、miRNA差异表达

11、共表达数据合并

12、WGCNA

13、生存分析介绍

14、生存分析数据准备

15、R做生存分析

16、课程数据及万能代码


TCGA数据挖掘视频教程二(挖掘差异miRNA)

01、课程简介

02、Rstudio重点配置与报错排除

03、最新TCGA-RNA表达数据下载与整理

04、RNA差异表达分析

05、ROC曲线

06、TCGA临床数据下载与整理

07、基因表达与临床因素相关性

08、临床分组表达量分析

09、生存分析

10、COX分析

11、列线图模型

12、基因表达拷贝数甲基化

13、成熟体miRNA表达数据下载与整理

14、miRNA差异表达分析

15、靶基因分析

16、基因与miRNA表达相关性分析

17、miRNA生存分析

18、GSEA分析

19、cBioPortal分析复现

20、课程数据及万能代码


TCGA数据挖掘视频教程三(挖掘转录因子网络)

01、简介

02、TCGA数据下载

03、TCGA命令行下载

04、TCGA数据整理

05、TCGA的id转换

06、mRNA提取

07、mRNA差异表达

08、IncRNA提取

09、IncRNA差异表达

10、转录因子富集分析

11、转录因子数据整理

12、cytoscape下载和安装

13、cytoscape构建转录因子调控网络

14、课程数据及万能代码


TCGA数据挖掘视频教程四(挖掘ceRNA网络)

01、TCGA数据库简介

02、软件安装

03、数据下载提取

04、差异分析

05、差异lncRNA与差异miRNA比对

06、DEmiRNA靶基因预测

07、网络构建数据准备

08、构建ceRNA网络

09、生存分析

10、课程数据及万能代码


批量挖掘TCGA miRNA

01、课程介绍

02、批量获取TCGA miRNA

03、辞选差异的miRNA

04、单因素Cox回归数据准备

05、单因素Cox回归

06、lasso回归数据格式准备

07、lasso回归

08、多因数Cox数据准备

09、多因素Cox回归分析

10、绘制列线图

11、绘制校准图

12、绘制ROC曲线

13、课程数据及万能代码


TCGA数据甲基化差异分析生存分析

01、TCGA甲基化简介

02、甲基化数据下载

03、甲基化数据提取

04、差异甲基化

05、热图

06、基因甲基化与表达相关性

07、位点甲基化与表达相关性

08、生存分析

09、甲基化和表达联合生存分析

10、课程数据及万能代码


TCGA甲基化驱动基因高级课程

01、甲基化驱动基因简介

02、甲基化驱动基因数据准备

03、甲基化驱动基因MethtylMix数据分析

04、甲基化驱动基因MethtylMix绘制图形

05、甲基化驱动基因热图绘制

06、甲基化驱动基因ConsensusPathDB分析

07、课程数据及万能代码


TCGA数据库SNP突变数据分析

01、TCGA数据库SNP突变分析简介

02、突变数据下载

03、突变数据整理和统计

04、瀑布图输入文件准备

05、瀑布图

06、带临床性状瀑布图数据准备

07、绘制带临床数据的瀑布国

08、突变和表达关系数据准备

09、绘制突变和表达关系图

10、提取生存时间

11、生存分析文件准备

12、生存分析

13、SNP位点数据整理

14、位点矩阵和表达矩阵合并

15、位点突变和基因表达关系

16、位点生存分析文件准备

17、位点生存曲线

18、课程数据及万能代码


11

TCGA数据库CNV拷贝数变异分析

01、CNV简介

02、数据下载

03、基因注释

04、数据整理合并

05、卡方检验输入文件准备

06、正常和癌症的CNV差异

07、圆圈输入文件准备

08、CNV绘制

09、提取差异基因的CNV矩阵

10、差异CNV基因和表达数据合并

11、CNV和表达水平的相关性检验

12、CNV和表达水平的可视化

13、基因名字转换成ID

14、GO富集分析

15、KEGG通路富集分析

16、课程数据及万能代码


12

TCGAimmune免疫细胞浸润

01、肿瘤免疫侵润简介

02、TCGA数据下载

03、数据整理

04、提取mRNA

05、数据矫正

06、CIBERSORT运行.

07、CIBERSORT结果整理

08、柱状图绘制

09、热图绘制

10、相关性热图绘制

11、小提琴图绘制

12、临床数据下载

13、临床数据整理

14、免疫细胞矩阵和生存时间合并

15、免疫细胞批量化生存分析

16、免疫细胞矩阵和临床性状合并

17、批量临床相关性分析

18、批量临床相关性

19、课程数据及万能代码


13

生信分析+免疫,妥妥上5分!

01、下载TCGA数据

02、计算样本免疫微环境评分

03、免疫微环境评分与各个临床特征的关系

04、免疫微环境评分高低与预后的关系.

05、免疫微环境评分高低样本的基因表达差异

06、这些差异基因与预后的关系,筛选预后显著相关

07、外部数据集验证这些基因.

08、课程数据及万能代码


以上是13套视频的内容,资源一共是15套,任何一套都有实操视频和课程资料:


(任何一套都是完整的)


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二、资源免费送:

顶级CNS插图如下:



但是自己画一只小鼠可能需要花一整天的时间。


所以,今天小编给大家免费赠送:


“生物医学之家CNS插图可编辑素材永久VIP账户”


生物医学之家CNS插图素材部分截图如下:



这些素材都是用Adobe illustrator绘制的,打开后可以继续编辑修改,这些素材原价是9999元的,现在免费给大家送永久账户。如下免费获取永久VIP账户:


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免费发送1万个永久VIP账户,有了这个账号之后,你可以无限、永久下载生物医学之家的CNS插图素材。共有1万张素材,囊括了各种生物、人体组织、细胞、病毒、植物等。素材首页如下:



一、比如我需要用到小鼠插图来描述自己的小鼠动物实验模型,那就直接搜索鼠,有几百张小鼠插图就出现了:



有了VIP账号之后就可以随意下载。下载下来是AI绘制的可编辑图:



可以随意修改颜色:



也可以随意修改大小:



Ctrl+c和V复制粘贴到自己的画板中,并对齐:



随后画一条线,示意要D369打药:



随后添加字体,这样审稿人一看就知道你做了什么动物模型。



最后保存和导出,一定要记得保存,保存就是矢量图了,以后还能修改。导出就是导出为图片,用来讲PPT或者投稿。



还在等什么?赶快免费获取账号呀,发SCI、作图的时候肯定用得着。


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还有,我们下载的素材,也可以右键取消分组:



然后修改任何一个你想要修改的元素,比如修改液体的颜色:



也可以将注射器放在背上,模拟皮下注射:



还可以将小鼠变为黑色:



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二、比如我需要绘制细胞机制图。那就搜索细胞:



有了这些素材,分分钟就可以绘制如下这种高分插图:



三、各种Nature插图原图:



下载下来之后每个细微的元素都可以修改:




我们一共上传1万张Nature插图。大家赶紧获取永久VIP账户吧,投稿绘图的时候用得着:


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更多免费资源:

三、科研绘图类:

1 GraphPad绘图模板

50套R绘图万能代码

直装版PS+AI安装包

医学统计分析R版

9 单样本RNAseq分析

11 SnapGene序列比对

13 Endnnote安装包

15 R语言绘图模板

17 中文版RNAseq教程

19 Image J图片处理视频

21 更多资源在更新中.....

2 600套PPT模板

4Origin绘图模板

SPSS统计分析模板

8 铜铁死亡分析代码

10 m6A甲基化分析代码

12 qPCR计算模板

14 英文简历模板

16 R各种统计分析模板

18 46套生信分析代码

20 Sigma plot绘图软件和视频

四、生信和写作类:

1 ChIPqPCR引物设计

3 过表达引物设计

零代码复现6分SCI教程

零代码复现4分SCI教程

WGCNA分析课程

11 GO分析傻瓜式教程

13 GSEA分析傻瓜式教程

15 渐变火山图傻瓜式教程图

17 GEO+TCGA数据挖掘课

19 41GB的生信分析+实验资源

2 shRNA设计

4 Crispr-csa9素材

零代码复现5分SCI教程

8分SCI零代码复现步骤

10 超全生信数据库使用教程

12 KEGG富集分析教程

14 Meta分析范文+实操课

16 交集基因筛选高级教程

18 生信软件合集

辛苦整理,全文无任何广告!

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科研大亨
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