近日,我院生物科学专业2020级本科生潘贤润以第一作者及并列第一作者身份,分别在《Scientific Data》(中科院二区,影响因子5.8)和《Autophagy》(中科院一区,影响因子14.6)杂志上发表了关于细胞膜接触位点蛋白质相关数据库及平台的研究论文。
论文介绍
一.开发细胞膜接触位点蛋白质数据库MCSdb
该研究开发了膜接触位点(Membrane Contact Site, MCS)的数据库MCSdb,收录了大量MCS驻留蛋白的全面信息,为解析MCS功能及细胞器间的通讯提供了重要资源。这是目前全球首个专注于MCS相关蛋白质的数据库。MCSdb网址:https://cellknowledge.com.cn/mcsdb/。
图1. 细胞器膜间接触位点示意图
二.开发自噬相关MCS蛋白质导航工具AutoMCS Navigator
2024年8月,基于MCSdb的开发成果,潘贤润同学及所在团队在细胞死亡领域的旗舰期刊《Autophagy》(中科院一区,影响因子14.6)上发表了题为《Mapping Autophagy-Related Membrane Contact Site Proteins and Complexes with AutoMCS Navigator》的论文,潘贤润同学为论文并列第一作者。
在MCSdb数据库的数据编纂过程中,团队发现,大量MCS及其相关蛋白和复合物与自噬过程高度相关。为深入阐明MCS在自噬中的作用,团队重新整理了MCSdb中与自噬相关的MCS蛋白和复合物,进一步开发了了名为AutoMCS Navigator的在线数据导航工具(https://cellknowledge.com.cn/mcsdb/autophagy.html)。该工具可为研究人员提供便捷途径,帮助了解自噬相关的MCS结构、组装、功能及其在相关疾病治疗中的潜在应用。
图2. AutoMCS Navigator示意图
学习经历
潘贤润,生物科学专业2024届毕业生,中共党员,生物科学2024届团支书,曾多次获得“成都中医药大学学习优秀三等奖”、“优秀团干部”等奖项。2021年暑假于四川大学华西医院疾病系统遗传研究院实习,基于所做工作于2022以第二作者发表文章;2021起于创新研究院张杨副教授处学习工作,并发表8篇高质量文章;2024年考研至电子科技大学生命科学与技术学院生物学专业。
论文链接
https://www.nature.com/articles/s41597-024-03104-7
https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/15548627.2024.2394291
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◇编辑 | 曾晓彤
◇校对 | 医学技术学院宣传部
◇初审 | 肖潇
◇复审 | 黎奇
◇终审 | 王海