华南农业大学植物保护学院李华平教授/饶雪琴副教授团队在香蕉内源性病毒序列鉴定取得新进展

学术   科学   2024-08-02 09:42   北京  
点击上方蓝字了解更多精彩


原文链接:
    https://doi.org/10.1186/s42483-024-00256-7
来源于花椰菜花叶病毒科(Caulimoviridae)的内源性植物副逆转录病毒(endogenous plant pararetrovirus,EPRV)序列在许多植物基因组中都存在,这些EPRV已成为植物基因组的组成部分。EPRV可能是古代病毒侵染寄主植物的分子化石,可以用来研究病毒的进化史以及病毒与宿主间的共进化。
香蕉线条病毒(Banana streak virusBSV)属于花椰菜花叶病毒科(Caulimoviridae)杆状病毒属(Badnavirus)。在香蕉染色体上发现了内源性香蕉线条病毒endogenous banana streak viruseBSV)和大量的香蕉内源性病毒序列(banana endogenous virus sequencesBEVseBSVs可以从香蕉基因组中被激活而游离出来侵染香蕉,但BEVs因基因容量限制而无法激活。虽然BEVs在不同基因型香蕉染色体中能检测到,但在香蕉基因组中的遗传特征尚不清楚。
Phytopathology Research今日在线发表了华南农业大学植物保护学院题为“Identification of new banana endogenous virus sequences highlights the hallmark gene encoded by retroviruses integration in banana genomes”的论文。该研究利用PCR、Southern杂交和荧光原位杂交(fluorescent in situ hybridization, FISH)等技术在不同基因型的香蕉中发现了2个新BEVs(BEV GZ5和BEV GZ13)。BEV GZ5以单拷贝整合在含BB基因的不同香蕉品种中,而GZ13只存在于ABB基因型的大蕉中;BEV GZ5包含BSVs所具有的完整RT/RNase H基因,并在其上下游有一对340 bp部分序列与RNase H重叠的反向重复序列,其上游有锌指结构;而BEV GZ13只含部分RT/RNase H基因。虽然新BEVs与BSVs不同,但是它们与逆转录病毒都含有部分RT/RNase H基因,这表明逆转录病毒编码的RT/RNase H标志基因已经整合到香蕉基因组中,这将推动BEVs、BSVs和香蕉的共进化研究,该研究为进一步研究不同BEVs在香蕉中的整合机制奠定了理论基础。

Fig 1. Analyses of BEV GZ5 and GZ13 based on the partial sequences of RT/RNase H with BEVs from GenBank.

Fig 2. Identification of BEV GZ5 and GZ13.

Fig 3. Schematic diagram of BEV GZ5 and the corresponding protein alignment of BEV GZ5 and BSVs.

华南农业大学植物保护学院已毕业硕士研究生陈华宙为本文第一作者,植物保护学院热带果树病毒病防控团队李华平教授和饶雪琴副教授为本文共同通讯作者。本研究得到了国家重点研发计划(2019YFD1001800)和国家现代农业产业技术体系资助(CARS-31)的资助。

华南农业大学植物保护学院是我国主要研究热带果树病毒病害的单位之一,是国家香蕉(芒果)产业技术体系病虫草害防控研究室依托单位。在Plos Pathogen, Journal of Experimental Botany, International Journal of Molecular Science, Phytopathology Research, Phytopathology, Plant Disease, 中国农业科学、科学通报、植物病理学报、植物保护学报等刊物上发表论文200余篇,授权专利10余件,获省部级科技奖7项。

Cite this article:

Chen, H., Li, H. & Rao, X. Identification of new banana endogenous virus sequences highlights the hallmark gene encoded by retroviruses integrated in banana genomes. Phytopathol Res, 2024, 6, 39. https://doi.org/10.1186/s42483-024-00256-7

《植物病理学报(英文)》交流群

    为了能更好的帮助广大科研工作者获取相关信息,《植物病理学报(英文)》特建立微信交流群,Phytopathology Research投稿以及文献相关问题等都会集中在群内进行解答,同时鼓励在群内进行学术交流,碰撞思维。为了保证更好的群内良好的讨论环境,请先添加小编微信,扫描下面二维码添加,之后我们会邀请您入群。温馨提示:在添加小编微信时,请务必备注学校或单位+姓名。

点击了解更多

# Phytopathol Res | 中国植物保护学科百年(1921-2021) – 中国植物病理学纪念专刊

#《Phytopathology Research》期刊2023年度编委会会议成功召开

#《Phytopathology Research》官微上线



Phytopathology Research

Phytopathology Research是我国植物病理学科的第一本英文期刊,由中国科协主管,中国植物病理学会和中国农业大学联合主办,与Springer Nature旗下BMC合作在线出版,与中国农业大学出版社合作纸质出版,于2019年1月正式刊载文章。期刊采用开放获取形式,刊载涵盖植物病理学学科基础和应用研究,现已被DOAJ、Scopus、SCIE等数据库正式收录,2022年获得首个SCI影响因子3.955 (Q1),2023年最新影响因子3.4 (Q2);入选中国科学院期刊2区。期刊主编由中国农业大学彭友良教授担任,与全球11个国家的53位行内知名专家组成编委会。目前Phytopathology Research所有稿件处理费用(APC)均由中国植物病理学会资助,作者无需支付任何费用。官方网站:

https://phytopatholres.biomedcentral.com/


PR植物病理学研究
Phytopathology Research (PR)是我国植物病理学科的第一个英文期刊,由中国植物病理学会和中国农业大学联合主办,与BMC合作出版,于2019年1月正式上线。
 最新文章