2025年1月26日，北京市规划和自然资源委员会网站发布国有土地使用权划拨的公示，拟划拨40.334489公顷作为首都医科大学新校区（校本部）项目建设用地，用地位置为大兴区生物医药基地。与此同时，首都医科大学新校区项目也已纳入北京市2025年“3个100”市重点工程计划。
据2023年8月北京市发改委批复的首都医科大学新校区（校本部）项目建议书（代可行性研究报告），首都医科大学新校区建成后，将腾退现有5个校区，实现“一校一址”办学。
2023年10月29日，首都医科大学校本部新校区开工。
目前，首都医科大学设右安门、顺义、和平里、花乡、东四十条等5个校区，其中4个位于北京中心城区，主校区位于丰台区南二环外。正在建设中的首都医科大学新校区（校本部）则位于京郊大兴区。相关负责人表示，实施新校区建设，将学校位于中心城区的教育科研功能全部迁出，能够更好地服务保障首都核心功能。
去年5月15日，北京大兴区人民政府官网发布了一则征地预公告，本次拟征收土地用地符合大兴分区规划（国土空间规划）（2017年-2035年），拟用于首都医科大学新校区（校本部）建设。
