2024即插即用CLEEGN模块:自动化EEG去伪影与重建,涨点起飞

文摘   2024-11-20 17:20   天津  

论文介绍

题目:SFFNet: A Wavelet-Based Spatial and Frequency Domain Fusion Network for Remote Sensing Segmentation

论文地址:https://arxiv.org/pdf/2405.01992

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创新点

  • 自动化EEG重建模型: 提出了CLEEGN,一个轻量级卷积神经网络,能够完全自动化地进行EEG重建,从而去除伪影,提升信号质量。

  • 无需校准的即插即用设计: CLEEGN是一个基于预训练模型的设计,能够实现跨被试的通用性,免去了针对每个用户的个性化校准,适用于实时信号处理和在线场景。

  • 高效的去伪影性能: 该模型在EEG解码准确率上优于传统的伪影去除方法,且不依赖手工标记或复杂的人工调整,展示了在去除伪影的同时保留脑活动信息的能力。

方法

整体结构

       CLEEGN模型是一个基于编码器-解码器的轻量级卷积神经网络,通过多层卷积结构来自动去除EEG信号中的伪影。编码器部分提取信号的空间和时间特征,而解码器则将这些特征重建为无伪影的EEG信号。在每层卷积层之后使用零填充和批归一化,以确保信号在去伪影过程中保持一致性并提升训练效率,实现了无需个性化校准的即插即用EEG重建。

  • 编码器:编码器部分包含多个卷积块,主要用于提取EEG信号中的空间和时间特征。最初的卷积层提取空间特征,每个空间滤波器与EEG通道数量一致。接下来的层交换信号的维度,以便捕获时序信息,使用带有较大时间窗口的卷积层来提取时间特征。这种层设计考虑到了EEG信号的空间和时间结构。

  • 解码器:解码器部分与编码器对称,由多个卷积块组成,用于将编码后的特征重建回无伪影的EEG信号。解码器的第一个卷积层使用时间滤波器来解码时间特征,随后通过空间滤波器还原空间信息,最终将信号还原到时间域。

  • 零填充和批归一化:为了保持输入和输出的一致性,每层卷积层除了第一层之外都使用了零填充。同时在每个卷积层之后使用批归一化,以增强梯度的稳定性,优化网络的训练效率。

即插即用模块作用

cleegn 作为一个即插即用模块,主要适用于:

  • 无需校准的自动化去伪影:能够在无需个体化校准的情况下,对新的EEG数据进行伪影去除,使系统更具通用性和便捷性。

  • 提高EEG解码准确性:通过高效去除伪影,保留关键的脑活动信息,从而提升EEG信号的解码准确性,助力相关应用的精确度和稳定性。

  • 便于实时应用:由于其轻量化设计,CLEEGN在复杂场景中也能保持计算效率,适合实时EEG处理需求。

消融实验结果

  • 评估了不同神经网络去伪影方法的整体性能,包括 CLEEGN 模型与其他基准模型的均方误差 (MSE)、参数数量、和 AUC 指标。结果表明 CLEEGN 模型在 MSE 值上最低,在 AUC 分数上最高,说明它在去伪影的同时能够更好地保留脑活动信息,优于其他对比模型。。

即插即用模块

import torch
import torch.nn as nn
#论文:CLEEGN: A Convolutional Neural Network for Plug-and-Play Automatic EEG Reconstruction
#论文地址:https://arxiv.org/pdf/2210.05988v2.pdf

class Permute2d(nn.Module):
    def __init__(self, shape):
        super(Permute2d, self).__init__()
        self.shape = shape

    def forward(self, x):
        return torch.permute(x, self.shape)


class CLEEGN(nn.Module):
    def __init__(self, n_chan, fs, N_F=20, tem_kernelLen=0.1):
        super(CLEEGN, self).__init__()
        self.n_chan = n_chan
        self.N_F = N_F
        self.fs = fs
        self.conv1 = nn.Sequential(
            nn.Conv2d(1, n_chan, (n_chan, 1), padding="valid", bias=True),
            Permute2d((0, 2, 1, 3)),
            nn.BatchNorm2d(1, eps=1e-3, momentum=0.99)
        )
        self.conv2 = nn.Sequential(
            nn.Conv2d(1, N_F, (1, int(fs * tem_kernelLen)), padding="same", bias=True),
            nn.BatchNorm2d(N_F, eps=1e-3, momentum=0.99)
        )

        self.conv3 = nn.Sequential(
            nn.Conv2d(N_F, N_F, (1, int(fs * tem_kernelLen)), padding="same", bias=True),
            nn.BatchNorm2d(N_F, eps=1e-3, momentum=0.99)
        )
        self.conv4 = nn.Sequential(
            nn.Conv2d(N_F, n_chan, (n_chan, 1), padding="same", bias=True),
            nn.BatchNorm2d(n_chan, eps=1e-3, momentum=0.99)
        )
        self.conv5 = nn.Conv2d(n_chan, 1, (n_chan, 1), padding="same", bias=True)

    def forward(self, x):
        # encoder
        x = self.conv1(x)
        x = self.conv2(x)
        # decoder
        x = self.conv3(x)
        x = self.conv4(x)

        x = self.conv5(x)
        return x


if __name__ == '__main__':

    # 定义输入张量的参数
    batch_size = 1  # 批次大小,表示处理一个样本
    n_channels = 56  # EEG信号的通道数
    sampling_rate = 128.0  # 信号采样频率,单位为Hz
    time_length = int(sampling_rate) # 时间长度(宽度),即一个时间序列周期内的数据点数

    # 初始化模型
    model = CLEEGN(n_chan=n_channels, fs=sampling_rate, N_F=20, tem_kernelLen=0.1)

    # 生成随机输入张量,模拟EEG数据
    input_tensor = torch.randn(batch_size, 1, n_channels, time_length) # (batch_size, channels, height, width)

    # 执行前向传播
    output = model(input_tensor)

    # 输出输入和输出张量的形状
    print(f'输入张量形状: {input_tensor.shape}')
    print(f'输出张量形状: {output.shape}')

便捷下载方式

浏览打开网址:https://github.com/ai-dawang/PlugNPlay-Modules

更多分析可见原文


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