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大学简介
斯坦福大学（Stanford
University）位于美国加州旧金山湾区南部帕罗奥多市境内，临近高科技园区硅谷（Silicon
Valley），是私立研究型大学。截至2017年，斯坦福人员有20位曾获得图灵奖，另有7位获菲尔兹奖, 83人获得诺贝尔奖。2024QS世界大学排名中斯坦福大学位列世界第5位。
招聘信息
美国斯坦福大学和Wu
Tsai 神经研究所Dr. Rongxin Fang 课题组(fanglabstanford.org)诚招1-2名单细胞测序以及空间组学方向博士后。
导师简介
Rongxin Fang于2019年在加州大学圣地亚哥分校（UC San Diego）生物工程系获得了生物信息学与系统生物学博士学位，师从任兵(Bing Ren) 教授。在此期间，他致力于开发了高通量基因组技术 (PLAC-seq/HiChIP,
CREST-seq and single-nucleus ATAC-seq) 和计算工具 (SnapATAC)，用于大规模、高分辨率地绘制哺乳动物基因组的结构和活性。他将这些方法应用于研究基因组中的顺式调控元件如何控制基因表达，以及该过程如何产生哺乳动物大脑细胞多样性的独特基因表达程序。博士毕业后，Dr. Fang加入哈佛大学庄小威 (Xiaowei Zhuang) 实验室从事博士后研究，期间，他开发并应用了大规模和三维MERFISH转录组成像方法，以绘制人类大脑在进化和衰老过程中的分子和细胞结构。
Dr. Fang 共发表23篇文章，文章被引用超过4000余次。其中，他以第一作者和共同第一作者在Science, eLife, Nature
Neuroscience, Nature Methods, Cell Research, Nature Communication and BMC Genomics共发表7篇文章 。他的工作和研究得到了HHMI、戴蒙·鲁尼昂癌症研究基金会、4D基因组、ENCODE项目、Roadmap表观基因组和BRAIN计划的资助。
代表性论文：
1.Fang R*, Halpern AR*, Rahman MM, Huang Z, Lei Z, Hell SJ,
Dulac C, Zhuang X. Three-dimensional single-cell transcriptome imaging of thick
tissues. eLife 10.7554/eLife.90029.1 (2023).2.Fang R*, Xia C*, Close JL, Zhang M, He J, Huang Z, Halpern AR, Long
B, Miller JA, Lein ES, Zhuang X. Conservation and divergence of cortical cell
organization in human and mouse revealed by MERFISH. Science.
2022 Jul;377(6601):56-62.3.Fang R, Preissl S, Li Y, Hou X, Lucero J, Wang X,
Motamedi A, Shiau AK, Zhou X, Xie F, Mukamel EA, Zhang K, Zhang Y, Behrens MM,
Ecker JR, Ren B. Comprehensive analysis of single cell ATAC-seq data with
SnapATAC. Nat Commun. 2021 Feb 26;12(1):1337. 4.Preissl S*, Fang R*,
Huang H, Zhao Y, Raviram R, Gorkin DU, Zhang Y, Sos BC, Afzal V, Dickel DE,
Kuan S, Visel A, Pennacchio LA, Zhang K, Ren B. Single-nucleus analysis of
accessible chromatin in developing mouse forebrain reveals cell-type-specific
transcriptional regulation. Nat Neurosci. 2018 Mar;21(3):432-439.5.Diao
Y*, Fang R*, Li B*, Meng Z, Yu J, Qiu Y, Lin KC, Huang H, Liu
T, Marina RJ, Jung I, Shen Y, Guan KL, Ren B. A tiling-deletion-based genetic
screen for cis-regulatory element identification in mammalian cells. Nat Methods. 2017 Jun;14(6):629-635.6.Fang R*, Yu M*, Li G, Chee S, Liu T, Schmitt AD, Ren B. Mapping of
long-range chromatin interactions by proximity ligation-assisted ChIP-seq. Cell
Res. 2016 Dec;26(12):1345-1348.7.Fang
R*, Wang C*, Skogerbo
G, Zhang Z. Functional diversity of CTCFs is encoded in their binding motifs. BMC
Genomics. 2015 Aug 28;16(1):649.实验室致力于开发空间组学、单细胞测序、基因编辑以及机器学习方法，研究细胞多样性、细胞间通信、神经退行性疾病及癌症的遗传机制。研究方向主要包括：1. 开发单细胞测序和成像技术，探索基因调控在大脑中单细胞水平的作用机制及其在学习和记忆过程中的动态变化；2. 开发高通量空间组学成像技术、单细胞测序方法以及生成式人工智能（AI），用于预测大脑及癌症细胞间的通信和相关信号通路；3. 开发基因编辑技术和靶向药物，通过调控基因表达及信号通路来改变细胞特性和细胞间通信，从而为下一代脑相关疾病的治疗手段奠定基础。申请人需已获得或即将获得生物学相关博士学位，人品正直，乐于助人，对科研有想法有热情，有良好的英文沟通/写作能力和团队合作精神。1.有单细胞测序（single-cell sequencing）以及相关数据分析背景格外优先考虑2.显微成像，超分辨成像(super resolution microscopy)3.空间组学 (spatial genomics)有意者请提供以下材料：（1）个人简历，（2）个人研究兴趣简要介绍；（3）2-3名推荐人联系方式。请将材料发送至以下邮箱：r3fang@stanford.edu本招聘启示长期有效。邮件标题请注明:
Applicant Name, Fang lab Postdoc Application
