目前,不管你是写标书、做预实验、发纯生信SCI,还是做湿实验。经常遇到:已知一个分子基因在该组织中高表达,但是不知道高表达后是否会导致疾病的发生。
如果能知道这个逻辑关系,那对写标书、结合转录组数据单细胞数据发纯生信SCI、做湿实验验证都非常有帮助。
孟德尔就可以实现这个操作。所以,小编给大家免费分享:
“组织基因表达量与疾病关系的孟德尔随机化分析资源包(原价5万元)”
一键对任何组织中任何分子、任意疾病进行逻辑关系分析,了解哪个分子升高或者降低会对疾病有什么样的影响。如果你能一次性把所有组织、2万分子、各种临床疾病统一做了。也就是一键明确任意组织中,任意基因与各种疾病的逻辑关系。发个Nature我估计都没有问题。
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资源包分为三步,如下:
第一步是提取gTEX数据中血液组织中CDK11A基因的eqtl数据:
2是来自gTEX数据中血液组织数据,里面包括了任何基因的eqtl数据(你也可以自己在gTEX网站下载任何组织的数据文件)。随后通过运行1_extract_eqtl from tissues.R代码得到CDK11A文件,即CDK11A基因的eqtl数据。操作非常简单,运行代码时你可以输入任何你想要的基因名字:
结果文件就出来了,就可以得到血液组织中该基因的eqtl数据,如下:
第二步,基因的eqtl数据过滤(不平衡)。我们给大家准备了各种万能文件,操作也是非常简单。就是改一下工作路径和参考文件的路径和将输入文件改为你自己的:
随后就得到结果文件:
第三步,孟德尔随机化分析。经历前面两步,我们就已经有了血液中CDK11A分子表达量文件,也就是暴露因素。接着比如我要分析它对慢性肾盂肾炎疾病发生的影响。我就从芬兰数据库下载慢性肾盂肾炎疾病这个结果文件(不会下载?点这里,你也可以下载任何一种疾病的结果文件,一样的操作就行),随后打开代码,修改路径,输入文件:
A-J那些结果就出来了:
从表中我们可以看到b小于0,也就是说血液中CDK11A高表达与慢性肾盂肾炎是负相关的。然而P是没有意义的,所以这是阴性结果(小编只是随意拿一个基因而已,你自己做分析,应该是要做转录组学差异分析,或者单细胞分析中差异表达的基因,或者是根据临床经验要进行探索的基因)。做出10个左右的阳性结果,基本SCI就稳了。
如果你是做了转录组的差异分析,或者单细胞数据分析,亦或者是临床样本做了qPCR。再接一个这样的孟德尔随机化分析,分分钟就是一一篇SCI。
总而言之,有了这份资料,你可以知道任何组织中,任何一个基因表达量与疾病的逻辑关系。
好了,资料我已经上传到百度云了,大家记得保存起来,想看就看:
赶紧保存到自己的百度云盘下载使用吧。
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发高分论文都要附带一张论文模式图,自己画一只小鼠、一个细胞可能需要花一整天的时间。但是要是有了可编辑的素材,修改一下颜色和大小,随后组装起来就是一张SCI图:
所以,今天小编给大家免费赠送:
“生物医学之家CNS插图可编辑素材永久VIP账户”
生物医学之家CNS插图素材部分截图如下:
这些素材都是用Adobe illustrator绘制的,打开后可以继续编辑修改,这些素材原价是9999元的,现在免费给大家送永久账户。如下免费获取永久VIP账户:
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免费发送1万个永久VIP账户,有了这个账号之后,你可以无限、永久下载生物医学之家的CNS插图素材。共有1万张素材,囊括了各种生物、人体组织、细胞、病毒、植物等。素材首页如下:
一、比如我需要用到小鼠插图来描述自己的小鼠动物实验模型,那就直接搜索鼠,有几百张小鼠插图就出现了:
有了VIP账号之后就可以随意下载。下载下来是AI绘制的可编辑图:
可以随意修改颜色:
也可以随意修改大小:
Ctrl+c和V复制粘贴到自己的画板中,并对齐:
随后画一条线,示意要D369打药:
随后添加字体,这样审稿人一看就知道你做了什么动物模型。
最后保存和导出,一定要记得保存,保存就是矢量图了,以后还能修改。导出就是导出为图片,用来讲PPT或者投稿。
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还有,我们下载的素材,也可以右键取消分组:
然后修改任何一个你想要修改的元素,比如修改液体的颜色:
也可以将注射器放在背上,模拟皮下注射:
还可以将小鼠变为黑色:
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二、比如我需要绘制细胞机制图。那就搜索细胞:
有了这些素材,分分钟就可以绘制如下这种高分插图:
三、各种Nature插图原图:
下载下来之后每个细微的元素都可以修改:
我们一共上传1万张Nature插图。大家赶紧获取永久VIP账户吧,投稿绘图的时候用得着:
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在我们论文投稿时,一张论文图可以很清晰的展现自己的研究思路,让审稿人一目了然。如下面这种图:
很多人都是用PPT绘图的。但是对于没有想象力的初学者来说,一个线粒体、烧杯、细胞核、一个WB的电泳仪、一只老鼠等可能就需要画一天:
所以,今天小编给大家免费赠送:
“3000+PPT科研绘图素材(无限高清、可编辑)”
(共12个模块)
大约是3000张素材,原价1999元,各种动物、细胞、病毒、植物、人体组织、生物化学仪器、疾病模型图等都在这里了。所有素材由PPT制作,每个部件都可以进行编辑,可以根据自己需要更改配色,增添内容,任意组合,放大缩小不改变清晰度。
这样我们就可以轻轻松松搞定绘图。以上素材如下即可免费下载:
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那都有哪些素材呢?一共是12个模块素材,具体如下,为了全部截图,所以有点小,大家可以点击下图放大看!
1、传染病学绘图素材:
2、分子生物学图片素材:
3、骨骼绘图素材:
4、疾病风险绘图素材:
5、临床医疗绘图素材:
6、神经学绘图素材;
7、生理学绘图素材:
8、实验室设备绘图素材:
9、细胞生物学与组织学绘图素材:
10、心脏和循环系统绘图素材:
11、医学常用绘图素材:
12、其他医疗绘图素材:
以上就是所有的素材,以后我们用于SCI作图、课题汇报作图、申报基金作图,这些都是能用的到的。大家先下载到电脑收藏起来,以后总用得着!如下免费:
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