说一下当年清华和协和的“合并”事宜，因为时间比较久远了，一晃儿20多年了。
首先还是得先说一下北京协和医学院中国医学科学院这个独特的共同体，协和医学院跟北京医科大学不同，协和医学院下面的好多研究所都是独立法人单位，以药物所为例，她的举办单位是卫健委，从法理上来讲她与协和医学院是两个不同的单位，这不同于北医，北医就一个单位，她下面的药学院、基础医学院等是北医的组成部门，是一个整体，说合并一块就进来了。而协和医学院则更像一个“联合国”
当时协和医学院内部也有不同声音，主张合并的，其实主要就是基础所和院本部，至于阜外、肿瘤等几个医院都是卫健委直属医院，更不要说协和医院了，协和医院跟北京医院一样太特殊了，是不可能并到清华做直属附属医院的。对于这种复杂的情况，清华不清楚吗？答案是很清楚的，所以清华也并没有像外部所说的对于合并有那么多积极、乐观与期盼。
早在2000年以前，王校长期间，其实就开始谈了，进展很慢，而这时清华已经成立自己的医学院了。到了2002年，顾校长期间签订了第一次协议，说合并，中国协和医科大学更名为“清华大学北京协和医学院”，后续期间各种因素吧，推动的也不顺利，清华也没有外界说的那么“上杆子”，因为清华很明白很清楚其中的利害关系。而这期间，清华已经在着手筹建自己的直属医院了，也就是后来台塑王永庆先生捐建的长庚医院，到了2006年，还是顾校长期间，在外部因素的干预下，又签了一个协议，于是“清华大学医学部”就诞生了。好多人可能不知道，“清华大学医学部”这个名字其实不属于清华大学，而是属于北京协和医学院，而且协议还要求清华大学不再办医学院，看到如此苛刻的条件，可能很多人就能想象当时清华的处境了，用那时的一句俏皮话说起来就是“清华第一次被放到括号里”。所以清华与协和的“合并”并不是外界所传的那样，什么“强行合并”、急于求成之类的说辞。
令：很多人一说北京协和医学院就和北京协和医院划等号，其实这个概念是有些偏颇的。在北京协和医学院成立之初，北京协和医院是北京协和医学院的直属医院，是一体化的，到现在北京协和医院的英文名称还是：Peking union medical college hospital北京协和医学院医院。但现在北京协和医学院与北京协和医院是两个完全不同的概念，都是卫健委直属事业单位，没有隶属关系，更没有领导关系，如同首医与天坛医院之类的关系。这跟北大、复旦、中山的附属医院是有很大区别的。中国医学院科学院北京协和医学院能够直接领导的也只是其下属的一些研究所，而这些研究所的科研精度可能也没有传说中的那么高。这么多年来，清华对于协和看中的一直是临床，清华也一直和协和医院有着密切的合作，比如共建重大疾病全国重点实验室，参与转化医学中心，协和医院的好多教授也在清华带研究生。但是清华和协和医学院除了毕业证盖章，基本上没有其他实质性的合作。
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