Fruit Res | 浙江农林大学徐凯团队揭示枇杷AP2/ERF基因家族的全基因组鉴定、进化扩增及表达多样性分析

文摘   三农   2025-01-17 10:03   江苏  



AP2/ERF(APETALA2/Ethylene response factor)是最大的植物转录因子家族之一,在调控植物生长发育和果实成熟、响应非生物和生物胁迫及其相关防御机制、生物合成等方面发挥着重要的作用。枇杷Eriobotrya japonica是蔷薇科亚热带常绿果树,具有极高的经济效益和营养价值。然而,枇杷中AP2/ERF转录因子家族的鉴定尚未见报道。


2024年10月,Fruit Research 在线发表了浙江农林大学徐凯教授团队题为Genome-wide identification, evolutionary expansion and expression divergence of the AP2/ERF gene family in loquat (Eriobotrya japonica) 的文章。

本文对枇杷AP2/ERF 基因家族进行全基因组鉴定分析,在枇杷基因组中共鉴定出189个枇杷AP2/ERF 基因家族成员,分布在17条染色体上。根据系统进化分析将AP2/ERF 基因家族分为3个亚家族,其中ERF亚家族包含96个成员,DREB亚家族包含51个成员,AP2亚家族包含42个成员。保守结构域分析结果表明,所有AP2/ERF 基因家族成员均包含AP2结构域。通过物种内和物种间的共线性分析,揭示了植物AP2/ERF 基因在进化中的潜在关系。顺式作用元件分析表明,枇杷AP2/ERF 基因可能响应不同激素和环境胁迫,并在植物生长发育过程中发挥作用。此外,AP2/ERF 家族成员在不同枇杷品种及其发育阶段果实中的表达模式具有多样性,且AP2/ERF 基因与枇杷果实发育成熟的生理过程密切相关。研究为后续枇杷AP2/ERF 的生物学功能研究奠定了重要基础,为枇杷新品种选育提供新思路。


图1. 枇杷AP2/ERF 基因家族进化分析


图2. 枇杷AP2/ERF 基因共线性分析


图3. AP2/ERF 基因家族在枇杷果实中的表达模式分析


浙江农林大学园艺科学学院硕士生刘雨梦蔡霖琦范秀润为该论文的共同第一作者,徐凯教授、吴伯萍讲师和浙江省农业科学院陈俊伟研究员为论文的通讯作者。硕士生张慧玲陈铭辉林月参与了此项研究。该研究得到了浙江省农业(枇杷新品种选育)新品种选育重大科技专项(2021C02066-3)、浙江省自然科学基金(LQ21C150001)和浙江农林大学科研发展基金(2019FR046)的支持。


原文链接:

https://doi.org/10.48130/frures-0024-0028

frures-0024-0028.pdf

特邀作者:吴伯萍、刘雨梦
编辑:顾笑寅
审核:史安琪

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期刊官网:

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投稿网址:

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