tidyplots让科研图表制作更高效

学术   2024-11-15 11:10   上海  

分享一个新出的R可视化工具tidyplots

tidyplots的宗旨是简化科研论文中符合发表标准的图表制作流程它通过一致、直观的语法,让用户能够逐步添加、删除和调整图表元素,使得图表制作更加高效便捷。

https://doi.org/10.1101/2024.11.08.621836

tidyplots简介

它主要还是重新包装了ggplot2、ggpubr等热门R语言可视化packages,

但是,代码更简洁

它通过一致、直观的语法,让用户能够逐步添加图表元素(Add),主要是Add ggplot2 code to a tidyplot,

它通过一致、直观的语法,让用户能够逐步删除图表元素(remove)

它通过一致、直观的语法,让用户能够逐步调整图表元素(adjust)

它通过一致、直观的语法,让用户能够逐步设置图表外观(themes and color schemes)


tidyplots使用

  • 安装
#安装
install.packages("tidyplots")
  • 一个小例子
library(tidyplots)
study %>% #内置数据集study
  tidyplot(x = treatment, y = score, color = treatment) %>% 
  add_data_points() %>%  #add points图
  add_mean_bar(alpha = 0.4) %>%  #add bar图
  add_sem_errorbar() %>%  #add errorbar图
  adjust_colors(new_colors = c("#644296","#F08533","#3B78B0""#D1352C")) #adjust设置颜色

更多例子:https://github.com/jbengler/tidyplots/


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