1935年1月，中共中央在遵义召开了政治局扩大会议，此次会议纠正了“左”倾错误军事路线，剥夺了李德和博古的最高军事指挥权，重新确立了以毛泽东为代表的正确军事路线和毛泽东在党内的领导地位，从而挽救了红军，挽救了革命。遵义会议结束后，博古虽然心情很郁闷，但还是服从中央的决定，准备把总书记的权交出去。
博古
时任共青团中央书记的凯丰得知博古的想法后，马上跑过来劝他说：“不能就这样把中央的权交出去！我们不否认军事指挥可能有问题，但在这样的借口下推翻中央的总负责，这是一种反共产国际的做法！博古同志，你想到过没有？”
博古却回答说：“我看没这个必要，既然政治局会议已经决定下来，那就服从决定吧！”
凯丰气得跺了脚：“哎，政治局的决定？你是什么？你呀你！”
凯丰
博古没有在意凯丰的激动情绪，只是淡淡地说：“你让我夜里想想。”
第二天一早，博古就派机要员小康，将象征着中央权力的一担铁皮箱送到了新任总书记张闻天的住处，里面装的是中央的重要文件、会议记录和印章。
铁皮箱送到的时候，正好毛泽东、周恩来等人都在张闻天那里，他们对此十分感动。因为若是博古借口向共产国际请示撤换中央总负责的事，事情将变得非常复杂，而且存在着中央最高领导层的分裂之虞！这在有的人是完全做得到的事情，博古竟然提也没有提！
博古交权以后，仍然保留了中央政治局委员、政治局常委、军委委员的职务，重要的会议他都参加，他还被任命为红军总政治部代理主任，是长征期间中央和红军的四个主要领导人之一。
1935年春天，毛泽东指挥了他称之为“一生得意之笔”的四渡赤水战役，红军在他的带领下，面对40万敌军的“铁壁合围”，时东时西、忽南忽北地大踏步转移，成功地跳出了敌人的包围圈。但红军为了甩掉敌人，难免会多跑一些路，广大指战员由于长时间行军，没有得到休整，都感到极度疲劳，他们又因为对中央的战略意图不甚理解，所以部队里出现了一些牢骚和埋怨的情绪。林彪还专门给张闻天写了信，要求更换军事领导人，提出把毛泽东换下来，让彭德怀上。
四渡赤水要图
面对这一情况，博古和周恩来以中央政治局常委的身份出面做工作，和广大指战员进行解释，总算把事情平息了下去。
1935年5月12日，红军攻克会理，中央决定在会理休整一周，同时召开政治局扩大会议，解决前期有人对军事领导不信任的问题。毛泽东在会上严厉地批评了林彪：“你是个娃娃，你懂什么？土城硬拼，我们吃了亏就要长一智，不和敌人硬顶，就得绕点圈子，就得多走点路，这你就受不了啦？就要反对军事领导人，就要把毛泽东换下去，难道你要军委听你指挥？你太自不量力了！”
博古也在会上表态支持了毛泽东，他说：“在目前极端困难的条件下，党和红军内部绝对不能发生分裂，必须上下一心，共度困难。四渡赤水、过乌江、抢渡金沙江，毛泽东同志的决策是正确的，我们应该支持他。”
最终此次会议正式明确了毛泽东是中央军事小组的负责人，博古对此功不可没。
1935年6月，红一、四方面军在懋功会师后，中央红军只剩下8000余人，但张国焘领导的红四方面军有8万余人，力量的悬殊让他的心理发生了变化。张国焘找到博古说：“遵义会议怎么开的？我们四方面军不承认遵义会议，它的决定是不合法的。”张国焘的话是想挑拨离间，希望博古跟毛泽东等人分开，跟自己合作。
张国焘
博古却严肃地拒绝了张国焘的挑唆，他还反问张国焘：“四方面军中为什么仍沿用伙夫、马夫的称呼？这是旧军阀的残留！”
张国焘听后大怒：“叫什么名称有什么要紧！”他回去以后，马上召集四方面军的营以上干部开会，说毛泽东和博古的态度最坏。
毛泽东听说此事后，对周恩来说：“博古是一个很有原则、很有组织观念的人。”
7月18日，张国焘给中央发了一个电报，公然提出一份新的中革军委人事名单，宣称由他任中革军委主席，中央政治局决定方针大计后，交中革军委“独断决行”之权。
中央收到电报后，在黑水县的芦花召开政治局会议，商讨应对措施。博古在会上第一个发言说：“张国焘这是向党示威，对他这样的人，决不可让步！”
周恩来、毛泽东和博古
张闻天表示愿意把自己总书记的位置让给张国焘，博古听后惊呼：“这是党权，不可相让！”周恩来又提出愿将自己红军总政委的职位让出来，博古仍然反对：“这是军权，让不得！”
毛泽东见博古态度如此坚决，心里非常感动，他对博古进行了让权的劝说。会议经过再三权衡，最终同意周恩来的意见，决定让张国焘接任红军总政委的职务。
8月3日，红军分成左右两路军分头北上，左路军由张国焘、朱德等人率领，右路军由徐向前、陈昌浩、叶剑英等人领导，中共中央、中革军委都跟随右路军行动。
但此后张国焘篡权的野心仍然不死，9月9日，他竟然向陈昌浩发去密电，命令陈昌浩率领右路军南下，假如中央领导同志不听劝告，就要“彻底开展党内斗争”，企图用武力危害中央，分裂党和红军。
还好叶剑英及时向毛泽东通报了这一秘密，毛泽东马上开会研究对策，博古在会上提出，继续说服张国焘北上已没有任何指望。会议最终决定：为了执行党的北上抗日决议，避免红军内部可能发生的武装冲突，中央率一、三军团迅速先行北上。
博古
部队出发之际，博古对叶剑英说：“老叶，你和我们不一样，你把密电送给了毛主席，又把军委直属队带了出来，人家会恨死你，会放过你吗？”
叶剑英听从了博古的劝告，当晚迅速回去组织直属队北上，并赶上了中央的大部队。博古见到叶剑英后，对他说：“老叶，好在你走了，好危险啊！你走了大约十多二十分钟的时候，追上来4个持驳壳枪的人，到处找你。我问‘找他干什么？’，他们说‘把他打死后再说。’”
叶剑英听后不禁长舒了一口气，他对博古说：“谢谢你昨天提醒了我，是你帮了我很大的忙。”
张国焘分裂中央、分裂红军的罪恶阴谋，最终还是被粉碎了。在这场事关党的前途、红军的命运的险恶斗争中，博古始终是一名向分裂路线猛烈反击的排头将！
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