生信培训视频|公共数据库及在线分析工具(11)人类参考基因组数据和注释文件的下载及介绍

文摘   科学   2024-07-05 16:17   湖南  

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「湘雅生信中心」是中南大学湘雅医院生物信息中心运营的公众号,本中心依托国家老年疾病临床医学研究中心(湘雅医院)成立,旨在充分利用中南大学湘雅医院丰富的生物医药数据资源,为湘雅医院高水平医学研究提供高质量的生物信息服务,指导多组学数据和多模态数据的整合分析与挖掘,并培养具有生物信息学和医学交叉背景的青年创新人才,逐步催生重大研究成果,助力“双一流”建设。

本公众号包括了生信工具生信技术生信门诊生信培训会议通知中心成果以及新闻咨询等板块,欢迎生物信息学和医学的相关专家、学者、研究生订阅与交流。如需更多信息,敬请关注“医见生信”和“生物信息应用医学”公众号。


随着高通量测序技术的发展,生物信息分析在临床医学中发挥着越来越重要的作用。为承担湘雅医院的生物信息学基础与技能培训,提供高标准的生物信息学分析指导。湘雅生信中心将定期开展一系列生物信息学专题培训。第一期专题培训为“R语言基础及数据分析与绘图”,相关的培训视频已发布在本公众号上,欢迎大家观看和学习。

第二期生物信息学系列培训主题为“公共数据库及在线分析工具”。本系列培训包括基因组、表观组、代谢组、单细胞组、时空组等组学在内的生物信息学各领域常用公共数据库和在线分析工具的基本介绍和使用方法,并通过实际项目讲解其应用,帮助学员们利用这些公共数据库和在线分析工具进行生物信息分析,为后续的科研工作提供支持。
根据课程安排,本系列培训课程此前已通过腾讯会议陆续线上开讲,为了让大家更好地学习相关课程内容,本公众号将陆续发布本系列课程的培训视频,供大家交流学习。
        本次发布的培训视频为第十一节课:
人类参考基因组数据和注释文件的下载及介绍

人类参考基因组数据和注释文件的下载及介绍

课程大纲

1. 人类参考基因组的背景及应用介绍

2.常见人类参考基因组数据库的介绍(NCBI、UCSC、ENSEMBLE、GENCODE等)
3. 人类参考基因组及注释文件的介绍(FASTA、GTF、GFF等)

人类参考基因组数据和注释文件的下载及介绍

课程录频

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课程ppt可以在「湘雅生信中心」公众号后台对话框输入“数据库及工具培训” 获取!


往期课程回顾

01 单细胞系列数据库初步介绍

02 人类线粒体基因组相关数据库介绍

03 孟德尔随机化研究的原理及其常用工具和数据库介绍

04 肿瘤时空组学相关数据库介绍

05 代谢网络相关数据库及分析工具介绍

06 肿瘤多组学数据挖掘在线平台

07 GEO数据库生物信息挖掘

08 基于ACMG的致病变异解读

09 甲基化研究相关数据库介绍

10 人类参考基因组数据和注释文件的下载及介绍




编辑:周巧

校对:简星星

审核:李津臣





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We are grateful to the Bioinformatics Center, Xiangya Hospital, Central South University for partial support of this work.


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