近日,四川农业大学草业科技学院马啸教授领衔的研究团队使用群体叶绿体基因组探究了青藏高原重要的乡土牧草—老芒麦的谱系地理结构,并首次揭示了老芒麦具有多谱系起源,且其母本供体不限于单一物种,研究结果将为老芒麦野生资源的有效保护和合理利用提供参考依据。相关研究成果以“Divergence in Elymus sibiricus is related to geography and climate oscillation: A new look from pan‐chloroplast genome data”为题在中科院生物学大类一区期刊Journal of Systematics and Evolution 发表。在读博士生熊毅为该论文的第一作者,西南科技大学白史且教授和四川农业大学马啸教授为该论文的通讯作者。该研究得到了国家自然科学基金(32271753)等的资助。
今年2月,研究团队还利用重测序、转录组数据,并结合基因功能研究解析了老芒麦ERF家族基因EsiERF285 抗旱和耐热的遗传基础,该研究成功以“Discovery of the ethylene response factors in Elymus sibiricus on a transcriptome-wide scale and the beneficial function of EsiERF285 in combating drought and heat stress”为题发表于中科院农林科学大类一区期刊Industrial Crops & Products 上。在读博士生熊艳丽为该论文的第一作者,四川省草原科学研究院雷雄博士和四川农业大学马啸教授为该论文的通讯作者。该研究得到了国家自然科学基金(32271753)等的资助。
研究团队基于三代全长转录组测序构建了老芒麦的参考转录本序列,并基于此鉴定到285个ERF基因家族的基因。同时基于时间梯度模拟干旱胁迫并进行转录谱分析构建了WGCNA共表达网络,并从中筛选到46个差异表达的ERF基因(图2)。进一步,研究团队结合干旱和热胁迫以及分子对接分析结果最终确定了候选基因(EsiERF285)进行后续功能验证(图3)。亚细胞共定位结果表明该基因在细胞核发挥功能,且该基因过表达酵母后展现出更强的渗透胁迫适应性(图4)。同时,过表达植株也展现出显著更好的抗旱表型和生理生化指标(图4)。
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Grass Research 是一本开放获取的期刊,致力于发表关于草类植物科学和相关领域的研究论文、综述、方法和观点性文章。期刊聚焦在自然生态系统或栽培系统中草类植物的生物机理研究以及其与环境和微生物的相互作用,如饲草(包括豆科植物)、草坪草、观赏草、生物能源草;或者可用于提高草类生产力和对生物或非生物胁迫适应性的其他植物,所提供的相关研究信息和方法。本刊由Maximum Academic Press出版,期刊主编由美国罗格斯大学黄炳茹教授担任。目前已被Scopus、CABI等数据库收录。
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