医院前身为合肥基督医院，始建于1898年，2017年12月成为中国科学技术大学直属附属医院。现已发展成为一所设备先进、专科齐全、技术力量雄厚，集医疗、教学、科研、预防、保健、康复、急救为一体的省级大型三级甲等综合性医院。在最新一轮（2021年度）全国三级公立医院绩效考核排名第21位，等级A+；连续五年进入“复旦版中国医院排行榜”全国百强，5个学科进入全国榜单，23个学科进入华东榜单。在2022年自然指数（Nature Index）年度榜单中，位列全球医疗机构第45位，中国医疗机构第7位。在中国医学科学院发布的2022年度中国医院科技量值（STEM）评价结果中，综合排名位列67位，共有6个学科进入全国学科榜单TOP30，11个学科进入TOP50，27个学科进入TOP100，13个学科位列安徽省首位。
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