霉菌毒素对危害猪只健康的常见毒素有十余种，这十余毒素对猪只的组织器官，不仅有主嗜性而且均有不同程度的泛嗜性，呈现肝毒性、肾毒性、细胞毒性、神经毒性、心血管毒性、血液毒性、免疫毒性、类雌激素毒性等等，对猪体组织器官产生广泛的损害。
各种毒素呈现毒性的机理不尽相同哪怕是对同一脏器，因此采食被霉菌毒素混合污染的谷物后，在猪体内必然引起极为复杂多样的临床表现。霉菌毒素中毒虽无传染性，群发性却很突出，所以在阐述时常常涉及这些群发性的临床现象。
1.呕吐
霉菌毒素中毒的呕吐有反射性呕吐与中枢性呕吐，但以反射性呕吐多见。
能直接引起呕吐的霉菌毒素主要由镰刀菌属真菌产生，它们分别是由三线镰刀菌等九种真菌产生的T-2毒素，和谷镰刀菌等八种真菌产生的脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON)，雪腐镰刀菌等八种真菌产生的雪腐镰刀菌烯醇(NIV)，藨草镰刀菌等四种真菌产生的二醋酸藨草镰刀菌烯醇(DAS)。
上述四种霉菌毒素均具有强烈的粘膜刺激性，引起胃肠粘膜广泛炎症、糜烂、溃疡、坏死、出血，发生反射性的呕吐。许多霉菌毒素可以损伤肝脏，临床上亦能见到肝源性内中毒引起的中枢性呕吐。
代猪场里急性霉菌毒素中毒相对罕见，临床多为慢性蓄积性中毒，故呕吐很少有人想到是饲料的问题。有些呕吐应当示为饲料长期被霉菌毒素污染的结果，并且有了胃粘膜的眼观上损伤和肝肾损伤引起的内中毒。
呕吐物为咖啡色，说明胃出血严重，是血液与胃液的盐酸作用的结果;呕吐物带有鲜红血液说明呕吐时胃正在出血;若先呕吐鲜血后有呕吐物说明食道出血;呕吐物若为绿色(未吃青绿饲料情况下)应为胆汁反流所致。
据长期临床观察发现，猪只耐受力较强，一旦出现呕吐说明胃、肠、肝脏、肾脏的损伤比较严重。
2.红眼与红色眼露
这是当今猪群中极为普遍的现象，也是被许多人视为PRRSV感染的症状，但是经笔者保肝治疗与更换霉变玉米的措施此症状逐步消失，说明此症状是霉菌毒素所致。
能直接引起眼结膜充血与炎症的霉菌毒，只有二醋酸藨草镰刀菌烯醇，但是红眼与红色眼露的发生还与肝脏的损伤密切相关。这种关联现象在西医中很难得到解释，但在中医里可归结于肝开窍于目的理论。
临床上在治疗牛的肝片吸虫病时就发现驱虫后牛的体况好转了，红眼与大量眼分泌物也消失了。肝片吸虫寄生越严重，上述症状也越明显。故而将此经验移植到观察治疗猪的霉菌毒素中毒症引起的红眼同样取得成功。
红眼与红色眼露作为判断霉菌毒素中毒的表观症状是切实可靠的，非常便于诊断时把握与应用。特别是红色眼露的出现必然寓示肝肾参与的凝血功能的紊乱或者寓示霉菌毒素的血管毒性造成的毛细血管损伤。
3.种猪群繁殖障碍
母猪临床症状
一般母猪患病后体温正常，皮肤出现黄疸，四肢乏力，粪便干燥，并导致直肠出血，尿液颜色加深，甚至出现浓茶色尿样(血红蛋白尿)，尤其是黄曲霉毒素中毒时此症状变现尤为明显。怀孕母猪常出现产死胎、木乃伊、流产或新生仔猪死亡率上升等现象，并导致母猪产后出现发情不正常;发育成熟的青年母猪食用的饲料中玉米赤霉烯酮的含量接近0.1mg/kg~0.15mg/kg时，青年母猪会出现阴门红肿，子宫的体积和重量增加，并出现假发情或临产表现;产后哺乳逐渐出现拒食，变现为持续性发情或发情周期延长，严重影响哺乳期仔猪的成活率。
成年种公猪的临床表现
患病种公猪表现睾丸萎缩，并出现雌性化变化，包皮增大，睾丸萎缩，乳腺肿大，精子数减少，严重影响受配母猪的受胎率和产子数。
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