秦始皇在公元前三世纪统一了六个国家，并在中国建立起了最早的一个中央王朝。秦始皇雄才大略，在军政两方面都有很高的造诣，他对长生之道也很感兴趣，他派出徐福东渡，到蓬莱去寻那传说中的仙岛，以求仙药延寿。徐福首次西行于西元前219年，率领五百童男童女出海寻仙，但因未寻得仙岛，遂无功而返。九年之后，秦始皇又派遣徐福西行，这次徐福带来的人更多，物资也更多，粮食、种子、工具也都带上了，发誓在没有找到那株仙药之前，绝对不会再回到中国。但自此之后，这些人就再也没有消息了，这就成了中国历史上的一个巨大的谜团。对于徐福的“船队”去向，历来有多种说法。有些人说，他们也许已经到了朝鲜半岛；有些人则往南走，最后来到日本。从科学上讲，现代人类学、古生物等研究表明，日本人很有可能不是徐福的后裔，他们很有可能是自冰期以来，由中国、朝鲜等地迁移过来的。
考古发掘表明，在30,000年以前，日本就已经有人居住了。而琉球群岛的发现，也进一步证实了日本在18,000年前就已有人类活动的遗迹。另外，大约在公元前3000年，又有一批来自朝鲜半岛的弥生族，他们带着先进的稻作耕作工艺和青铜器具，从日本来到了这里。最近几年，有了先进的 DNA科技，科学家可以对日本人的祖先进行更为客观的调查。我们前期对日本人群进行了大规模的 DNA检测，发现日本人具有不同种族、不同地域的遗传背景，与中国北部汉族，特别是河南、河北等地有较高的同源性。已有研究表明，大约10%的日本人遗传自北部汉族，这一部分的基因很可能与中国历史上的民族迁徙有关，特别是战争年代。在此期间，一部分汉族迁徙到朝鲜半岛，最后经由海路进入日本九州。更多细节，可参阅下面的视频：
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