【撤稿怪事】2015年发表的SCI抄袭了2019年发表的SCI?

教育   2024-10-31 22:05   以色列  

免费资源:

一、国自然类:


1 2023历年国自然标书全文

3 国自然项目答辩PPT

5 标书写作模板

7 GraphPad 9安装包

2 2018-24年国自然清单

4 基金插图素材(可编辑)

6 近10年国自然标书全文

二、SCI生信+实验类:

1 160套SCI实验操作视频

3 Meta分析范文+教程

5 泛癌分析万能代码

7 130套SCI实验视频

9 单细胞数据挖掘课

11 统计分析万能模板

2 100个SCI实验Protocol

4 miRNA预测靶基因代码

6 动物实验操作视频汇总

GEO/TCGA数据挖掘课

10 SCI写作万能模板

三、科研绘图类:

PPT科研绘图素材合集

3 Adobe illustrator绘图素材

5 动物实验矢量图素材

7 PS修各种SCI实验图视频

资源共享群

PPT科研绘图插件VIP版

4 各种实验仪器矢量图素材

6 细胞实验矢量图素材

AI科研绘图视频课

10 亲交友微信群

一、今日推送:

近日,一篇发生在PLOS One的撤稿引发外网热议(3篇SCI相似,发表于2015,2018,2019,其中2015年发表的SCI惨遭撤稿)。


据悉,北大健康科学中心的研究人员2015年发表在PLOS One 的一篇论文近日遭遇撤稿,编辑部给出的理由竟是,论文中的部分图片与2017年及2019年发表的两篇论文相似或相同。

这个离谱的决定让论文作者们愤怒不已,写信给编辑部称“我们都不同意你撤回这篇论文的想法,并对你感到非常愤怒。”并将邮件公开发布在了pubpeers上,邮件还提到,“我们还添加了高分辨率的原始数据。现在已经是北京时间的凌晨了,我无法将我们的附件翻译成英文。很抱歉,我只是附上了这些中文文件,如果您想阅读它们,请使用谷歌翻译

PLOS One指出的学术不端行为是:该文章[1]和文章[2]、[3]在图片上有10处相似,且图3H Actin电泳图中似乎存在垂直不规则性。


但是,文章[2][3]分别发表于2018年(投稿于2017年)2019年(投稿于2019年),而被撤稿的文章发表于2015年。请问一篇发表于2015年的文章如何抄袭发表于未来3年后和4年后的文章?

作者态度强硬的拒绝编辑部撤回文章,不仅是在撤稿通知中表示:

ML, HH, MZ, HZ, and XP did not agree with the retraction and stand by the article’s findings. JZ, YY, XW, LG, HA, and PE either did not respond directly or could not be reached.

作者还将他们向编辑部发的邮件发布在了pubpeers上

亲爱的扎尔姆博士PLoS One高级编辑、出版道德团队经理)

在您设定的答复截止日期之前,我代表我们所有的作者写信给您。我们都不同意你撤回这篇论文的想法,并对你感到非常愤怒。我们在这项研究中没有做错任何事情。这篇论文是我的实验室在病例学家He博士于美国工作期间同美国团队合作完成的。和我们的认真协作不同,你们团队的决定只是基于我们论文中的一些图片与比我们晚了三四年发表的论文中的部分图片相似或相同而做下的你和你的团队是不是认为我们可以基于阿尔伯特·爱斯坦的超光速理论做到跨越数年去抄袭别人的作品?事实上,是别人抄袭了我们发布的数据,而不是我们抄袭了别人的数据。

在此,我强烈建议大家仔细审视论文,重新思考事实,最终对此事做出准确的决定。一个不恰当的决定会损害我们团队、你的团队以及 PLoS One 的声誉,且无法给那些抄袭他人工作的人带来任何损害。顺便说一句,我们已向我们的机构道德委员会报告了此事,因为 PLoS One 在我们的论文中处理不当。我们也会将此事报告给我们的律师事务所,以保护我们在此事上的权利。

很抱歉,此刻我给您写的信的口吻可能有些严厉。然而正如小说家毛姆所说,有人能指望那些受到不当对待的人轻声说话吗?此外,我们还向两篇包含了与我们相似或相同图片论文的通讯作者发送了电子邮件。我们要求他们展示他们的原始照片。事实上,我们手头有这些原始数据。为此,我建议您在做出决定之前进行彻底的调查。最终一切都会清楚的。我们在这封电子邮件中添加了附件,其中包括了我们的照片与其他两篇文章照片的对比。我们还添加了高分辨率的原始数据。现在已经是北京时间的凌晨了,我无法将我们的附件翻译成英文。很抱歉,我只是附上了这些中文文件,如果您想阅读它们,请使用谷歌翻译,或者等我们后续为您翻译它们,如果到时候您仍有兴趣阅读。

3月18日:

这次我们一如既往,对成为PLOS一批撤稿论文的受害者表示强烈反对。虽然有些论文有问题,但我们是无辜的!我呼吁停止这样做,让事情变得正确和公平!我希望你能有理由的回复我们。

4月2日:

希望你能收到这封电子邮件。

我们像以前一样反对撤回我们的论文。事实上,我们都是抄袭的受害者。你们的团队粗暴地撤回了我们的论文,没有仔细审查谁抄袭了谁。这深深地破坏了你的团队和 PLOS One 的公平性。我们非常失望。你和你的团队在这件事上确实犯了错误,以后会受到良心的谴责。为什么您和您的团队没有花更多时间通过比较论文来澄清事实。这是典型的偏见和霸权。

我们还是希望你们回到正确、公平的轨道上来。

“和以前一样,我们强烈反对成为 PLOS One 批量撤回论文的受害者。我们论文的原始文件正在发送给编辑,特别是图2。我们有所有原始图片和计数文件。但由于文件大小限制,这些原始文件无法在pubpeer上上传。

在此我附上了其中一位合著者Zhou发给编辑部的电子邮件:作为合著者,我不同意此时撤回的决定,如果您无法进一步解释这个决定背后必然要做的原因。我仔细研究了何博士对期刊问询的答复以及期刊决定撤回文章的原因。我非常关心你的决定:

1. 在您的决定中,您提到了“在这种情况下,由于对图 2、3 和 4 中显示的结果的担忧,我们认为有必要撤回。”

麻烦您考虑以下事实:这篇文章于 2014 年 12 月 18 日你们期刊接收,比其他两篇抄袭我们文章中的图片的文章早了几年(一篇于 2017年2月1日被接收,另一篇另一则于2019年3月26日被接收)。我们与其他两篇论文的作者没有任何关系。因此,我们是另外两份欺诈论文的受害者,而不是肇事者。如果这是撤回我们文章的主要原因,那么这个撤稿理由是有缺陷的,没有法律依据。  2.  在您的决定中,您还提到:“此外,在我们的编辑评估过程中,这篇文章被确定为一系列可能发生出版操纵的文章之一。具体来说,杂志方面担心文章内容与其他提交的内容相似,并且明显重复使用图像。”

请提供这一指控的证据。我很期待通过审核相关证据从而做出最终决定。

我是美国一所主要医疗中心的病理科主任。我严格捍卫学术诚信,决不纵容任何形式的科学不端行为。但是,我们在处理学术不端行为时,需要保持清醒、客观的头脑。我期待着您的回复。此致 ZHOU,医学博士,塔夫茨医学中心病理学和检验医学部主任兼病理学家”

当然,PLOS One在撤稿通知中提及的学术不端指控并非全都让人难以理解。唯一相对靠谱的质疑是对于figure3H是否发生了图象剪辑的:


然而它并不是编辑部决定撤稿的重点。通过撤稿通知和作者公布的邮件可知,PLOS One认为:“本文被确定为与图像重用相关的一组文章之一。通讯作者提供了数据文件来支持本文中提出的结果,但这些文件并没有解决问题。”下图是当时被热心网友爆出的涉及图片重复的论文组的其中8篇论文


从图中不难发现,被撤稿的论文(位于左上角)仅和第一排第二个论文与第二排第二个论文有图片重复,但第一排第二个与第二排第二个不止和被撤稿论文有重复,它们与其他论文也有图片重复。

参考论文投稿与发表时间,以及图片重复情况,可以很清晰得看出来,被撤稿论文先投稿发表,几年之后才发生了两篇论文与包括撤稿论文在内的其他论文出现图像重复的情况。

国际出版社维护出版道德无可厚非,但也要充分考虑作者文章的来之不易,粗暴处置,怎不让广大中国作者寒心......

PLOS One需要给一个说法!


此外,看下面这篇NC的论文,整合GWAS和eQTL数据,从SNP水平出发分析哪些基因的表达变化会导致某些疾病的发生就是一篇NC



非常简单。因为还很热,所以很好发。所以小编今天教大家一键完成这个孟德尔分析,得到:49个组织中任意基因的表达水平与任意疾病的因果关系,发一篇Nature。


小鼠实验都不用做了,直接就知道该组织中该基因增加是否会导致疾病的发生下面看操作:


一、snp提取:


先去(49个组织的eqtl数据,该数据来源于GTEX数据库,我们已经给大家处理好了,能直接读取和提取数据下载自己想要的组织的eqtl数据,随后将我们给大家的代码和该文件放在同一个文件夹下,如下:



打开代码后,一键运行(修改你的工作路径和读取文件名就行),运行完代码后就可以得到每个基因的eqtl数据,一个all_genen文件,和每一个基因会有一个文件夹(正常情况下,血液中会提取到1万多个基因有snp,也就是会有1万多个文件夹,我这里仅仅显示3个基因3个文件夹给大家看看),如下:



二、提取影响基因表达量的snp:


那我们提取了基因的snp之后,我们要知道哪些snp会影响该基因的表达量。如下(需要你修改工作路径哦):



这里使用连锁不平衡参数(R平方>0.2和遗传距离为100kb,有些SCI是用0.1,有些是0.2,所以我这里选用的0.2)筛选影响每个基因表达水平的SNP。一键运行后,你就会得到snp影响基因表达量的基因文件,如下示例A3GALT2_expo_rt.txt文件就是说明A3GALT2基因的SNP是可以影响A3GALT2表达量水平的(这只是示例,实际上基因snp能影响该基因表达量的应该有大几千个,运行时间大约为24小时,普通电脑也可以运行的):



这些_expo_rt.txt结尾的基因文件就是我们后面用来做孟德尔随机化分析的文件(我这里仅用A3GALT2_expo_rt.txt作为示例演示)。


二、孟德尔随机化分析:


接下来,我们要看影响了A3GALT2表达量的SNP能不能导致我们疾病的发生。对于疾病文件的选择,你可以从芬兰数据库中选取任意疾病做后续的分析(芬兰数据库R10的数据我们都给大家整理好了,一共2408种疾病,点击即可下载)。


我们从R10下载自己任意想要的疾病数据即可,比如我要下载上图里面的数据,复制链接到网页就自动下载了:



我这里以我们前面得到的A3GALT2_expo_rt.txt的SNP对心源性哮喘finngen_R10_ALLERG_ASTHMA.gz为例(我这里仅以这个基因为例,真实上你会得到几千个基因的文件夹,该代码是循环的,一键批量运行的):



一键运行代码,你就可以该血液中基因表达量增加是否会导致过敏性哮喘的发生



就搞定了,对于结果的解读,非常简单,如果你不懂。小编给你准备了这份中文文献:



一模一样的操作,他们只是做了lncRNA与肺腺癌的因果关系。有了我们这份代码和工具你可以做任何组织中任何基因与任何疾病的因果关系,你也可以照着模仿写作,结果出的好就是一篇5-10分的SCI。结果不好就跟上面一样发篇中文的。


好了,总结一下,你只要有了我们给大家分享的代码和工具就能天下无敌。你如果能一次性分析完(GTEX数据库中有49个组织,芬兰数据库R10中有2408个疾病,49乘以2408。一个组织一个疾病跑一次代码,你如果想一次性做出来,你需要跑117992次代码),我觉得发篇Nature都是可以的。一键eqtl孟德尔随机化分析代码和工具免费分享给大家:


如下免费获取:

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二、资源免费送:

顶级CNS插图如下:



但是自己画一只小鼠可能需要花一整天的时间。


所以,今天小编给大家免费赠送:


“生物医学之家CNS插图可编辑素材永久VIP账户”


生物医学之家CNS插图素材部分截图如下:



这些素材都是用Adobe illustrator绘制的,打开后可以继续编辑修改,这些素材原价是9999元的,现在免费给大家送永久账户。如下免费获取永久VIP账户:


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免费发送1万个永久VIP账户,有了这个账号之后,你可以无限、永久下载生物医学之家的CNS插图素材。共有1万张素材,囊括了各种生物、人体组织、细胞、病毒、植物等。素材首页如下:



一、比如我需要用到小鼠插图来描述自己的小鼠动物实验模型,那就直接搜索鼠,有几百张小鼠插图就出现了:



有了VIP账号之后就可以随意下载。下载下来是AI绘制的可编辑图:



可以随意修改颜色:



也可以随意修改大小:



Ctrl+c和V复制粘贴到自己的画板中,并对齐:



随后画一条线,示意要D369打药:



随后添加字体,这样审稿人一看就知道你做了什么动物模型。



最后保存和导出,一定要记得保存,保存就是矢量图了,以后还能修改。导出就是导出为图片,用来讲PPT或者投稿。



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还有,我们下载的素材,也可以右键取消分组:



然后修改任何一个你想要修改的元素,比如修改液体的颜色:



也可以将注射器放在背上,模拟皮下注射:



还可以将小鼠变为黑色:



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二、比如我需要绘制细胞机制图。那就搜索细胞:



有了这些素材,分分钟就可以绘制如下这种高分插图:



三、各种Nature插图原图:



下载下来之后每个细微的元素都可以修改:




我们一共上传1万张Nature插图。大家赶紧获取永久VIP账户吧,投稿绘图的时候用得着:


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更多免费资源:

三、科研绘图类:

1 GraphPad绘图模板

50套R绘图万能代码

直装版PS+AI安装包

医学统计分析R版

9 单样本RNAseq分析

11 SnapGene序列比对

13 Endnnote安装包

15 R语言绘图模板

17 中文版RNAseq教程

19 Image J图片处理视频

21 更多资源在更新中.....

2 600套PPT模板

4Origin绘图模板

SPSS统计分析模板

8 铜铁死亡分析代码

10 m6A甲基化分析代码

12 qPCR计算模板

14 英文简历模板

16 R各种统计分析模板

18 46套生信分析代码

20 Sigma plot绘图软件和视频

四、生信和写作类:

1 ChIPqPCR引物设计

3 过表达引物设计

零代码复现6分SCI教程

零代码复现4分SCI教程

WGCNA分析课程

11 GO分析傻瓜式教程

13 GSEA分析傻瓜式教程

15 渐变火山图傻瓜式教程图

17 GEO+TCGA数据挖掘课

19 41GB的生信分析+实验资源

2 shRNA设计

4 Crispr-csa9素材

零代码复现5分SCI教程

8分SCI零代码复现步骤

10 超全生信数据库使用教程

12 KEGG富集分析教程

14 Meta分析范文+实操课

16 交集基因筛选高级教程

18 生信软件合集

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