Positron,新一代数据科学IDE(R+Python+...)

文摘   2024-07-06 09:05   浙江  

Introduction

Positron(正电子),是由 RStudio 母公司(改名叫 Posit)构建的下一代数据科学 IDE,一个可用于编写代码和探索数据的可扩展的多语言工具,并提供可重复创作和发布的熟悉环境。

主页:https://github.com/posit-dev/positron

下载:https://github.com/posit-dev/positron/releases。目前,Positron 正在通过适用于 macOS、Windows 和 Linux 的持续集成 (CI) 系统生成预发布版本。选择要下载的版本,.dmg(适用于 Mac)、.exe(适用于 Windows)或 .deb(适用于 Linux)文件。

正电子(又称阳电子、反电子、正子)是电子的反粒子,即电子的对应反物质,与电子碰撞时会产生湮灭现象。这名字不错。

Positron 构建于 Code OSS 之上,外观和功能都跟VS Code很像。官方直接说了,要了解命令、设置、使用源代码管理等基本功能,请参阅 VS Code 文档😂。

Positron适合你吗?

注意⚠️:Positron 是一个正在积极开发的早期项目。官方并不期望它立即适合每个从事数据科学的人。

Positron 适合以下情况:

  • • 您使用 VS Code 进行数据科学(Python 或 R),但希望它包含专用控制台、变量窗格、数据浏览器以及其他用于特定数据工作的功能。

  • • 您使用 Jupyterlab 进行数据科学(Python 或 R),并准备好使用更强大、功能齐全的 IDE。

  • • 您使用 RStudio 并希望拥有更多自定义或扩展 IDE 的能力。

  • • 您在日常数据科学或包开发工作中使用其他语言,例如 Rust、C++、JavaScript 或 Lua。

Positron 不适合以下情况:

  • • 您需要稳定、完善的软件。Positron 仍处于测试阶段,某些功能不稳定或未完成。

  • • 您需要 RStudio IDE 的所有功能。Positron 不具备 RStudio 的所有功能;一些值得注意的缺失是 Quarto 和 R Markdown 的内联输出、分析、Sweave、RStudio 插件支持等。

  • • 您使用远程开发功能(例如开发容器、远程 SSH);Positron 尚不支持这些。然而,提供远程 SSH 工具已在我们的路线图中。

Positron 与 RStudio、VS Code 或 Jupyter 有何不同

  • • Positron 通过集成控制台对 R 和/或 Python 提供一流的内置支持,并在未来提供针对其他语言的扩展选项。这包括整个 Positron 的专用视图和窗格,例如数据浏览器、连接窗格、变量窗格等。

  • • Positron 与 IDE 分开运行解释器,因此与 RStudio 不同,R/Python 中的崩溃不会使 IDE 崩溃。这还意味着您可以即时在首选语言的版本之间进行切换,而无需完全重新加载 IDE,只需集成控制台即可。

  • • Positron 支持 VS Code 兼容扩展(.vsix 文件),允许扩展核心 IDE 本身之外的功能。通过在 Code OSS 上构建,Positron 获得了丰富的文本编辑器功能,并可以立即访问 1,000 个社区扩展。

  • • Positron 深度专注于原生数据科学工作流程;它提供了超越通用 IDE 或文本编辑器(如 VS Code)的功能和凝聚力体验。

体验

R/R markerdown/Qurato

Rstudio界面:

Positron界面:

Positron 内置了 R、R Markdown 和 Quarto 的支持。基本上是开箱即用,我之前的R环境和python环境都得到了很好的兼容,打开之前的代码项目也都能直接运行。

R的debug我试了一下也挺好的,可以直接在R环境中调试,很方便。R Markdown 和 Quarto的预览功能也没问题,可以实时看到效果。

点击data.frame对象可进入数据浏览器(和Rstudio的不太一样),可以看到以下信息:

  • • 数据网格:以类似于电子表格的方式显示各个单元格和列以及排序

  • • 摘要面板:每列的列名称、类型和缺失数据百分比

  • • 过滤栏:特定列的临时过滤器

Python

Positron 也支持 Python,脚本和Jupyter Notebook 都可以运行。运行逻辑跟R基本一致,我很喜欢使用Ctrl/Cmd+Enter来运行代码块。

Shiny

Positron 也支持 Shiny等交互应用,可以直接运行R Shiny应用。另外的网页构建,Rbookdown等项目也都顺利执行了(毕竟对R的支持做了很多年了)。

Connection

Connection窗格允许探索在 R 或 Python 会话中创建的数据库连接。它还包括对存储和管理连接字符串以供将来使用的基本支持。

  • • 用R连接,只需使用支持连接协定的任何包(例如 odbc、sparklyr、bigrquery 等)连接到数据库。

  • • 用Python连接,支持使用 sqlite3 和 SQLAlchemy 模块创建的连接。要在连接窗格中打开连接,请创建代表连接/引擎的顶级对象。

总结

我简单体验了一下 Positron,因为我之前VS Code用得不多,主要用的都是Rstudio(Rstudio基本也支持R和python的,而且R makerdown和Quarto写起来也很流畅)。Positron挺酷的,基本的界面和功能都有了,各种常用语言的界面也统一了,可以尝试一下。

而且感觉这种趋势也是对的,比如我们做生信的,基本上都是用R,Python比较多的,再提供一下Terminal用来连接服务器,这几个体验做好了整个IDE感觉就不错。

RStudio不会消失,Posit官方表示将继续致力于维护和更新 RStudio。

虽然 Positron 和 RStudio 有一些共同的功能,但一些以 R 为中心的功能仍将是 RStudio 独有的。他们开始开发 Positron,作为支持多种语言(包括 R 和 Python)开源数据科学的使命的一部分。

如果你当前正在使用 RStudio 并且对体验感到满意,则可以继续使用 RStudio。RStudio 包含 10 多年针对 R 数据分析和包开发的应用优化。

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bio llbug
博士生一枚,主攻生物信息学,微生物组,暴露组。分享自己科研道路上的经验方法。
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