农村新农合与城镇居民医疗保险，原来分别属于两个不同参保对象的医疗保险，不过现在已经统一整合成为“城乡居民医疗保险”，新整合的城乡居民医疗保险就包含了原来的农村新农合和城镇居民医疗保险。
第一，新农合和城镇居民医保的区别。一是参保对象不一样。新农合主要参保对象为农村居民；城镇居民医保主要参保对象为没有参加城镇职工医疗保险的城镇居民。二是报销比例不一样。新农合在三甲医医院报销比例只有30%，但是城镇居民医保可以达到50%左右，如果通过逐级转院的，报销比例可到70%。三是政府补助资金不一样。新农合政府补助普遍高于城镇居民医保。新农合政府每年每人补助资金平均在400到500元左右。四是参保方式不一样。新农合在农村实行按户缴纳的方式，城镇居民医保实行按人来缴纳。
第二，将新农合和城镇居民医保整合为城乡居民医保后，有哪些好处？将新农合和城镇居民医保整合成城乡居民医疗保险后，无论是和原来新农合还是城镇居民医疗保险整合后，并不只是名称的变化，其性质也发生了巨大的变化。其好处有这么几个：一是有利于促进医疗保障城乡一体化。由于以前是新农合和城镇居民医保，是两套系统运行，两个机构来管理，城乡医疗保障的政策不统一，导致就医、报销等有一定的差别。整合后实行一样的参保政策，一样的报销待遇，一样报销流程。
二是建立了“六个统一”的管理体制。整合后，统一了 覆盖范围。包含农村居民和城镇居民；统一了筹资政策。统一后缴费标准城乡居民都一样，不再划分农村户口和城镇户口；统一了保障待遇。医保基金主要用来保障城乡居民的门诊和住院费用，报销水平逐步提高到75%左右；统一了医保目录。做到种类更齐全，结构更合理；统一了定点管理。所有的定点医院城乡居民都可以进入看病和就医；统一了基金管理。收支更加平衡，支付更有保障。
总之，根据《国务院关于整合城乡居民基本医疗保险制度的意见》，即国发（2016）3号文件精神，已将原来的农村新农合和城镇居民医保，整合为“城乡居民医疗保险”，整合后的城乡居民医疗保险，体制机制更加完善，政策更加统一，医疗保障水平更高。
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