后备母猪淘汰的主要原因是发情异常造成的，主要是因为后备母猪到了配种日龄还没有出现发情症状，这可能是由于后备母猪的先天发育不良，生殖器官畸形造成的，或者是由于饲养管理不当而引起的体内激素分泌紊乱，不能使卵泡正常的发育和成熟，从而导致后备母猪不发情。
还有一方面是由于后备母猪的体况过肥，脂肪在卵巢内脂肪沉积而影响正常的发情排卵，这类母猪经处理后仍不发情，则应淘汰。
经产母猪发情异常是指母猪在仔猪断奶后的20天仍没有发情症状或者发情症状不明显，这主要是由于经产母猪在产后恢复不到位，卵巢的机能降低，或者由于发生子宫炎等生殖系统疾病造成的，还有一部分原因是母猪在哺乳期失重严重，体质较差，母猪的生殖功能还没有恢复等，如果经调理后正常发情，该母猪可继续使用，但是如果经处理后仍不发情，则应考虑淘汰处理。有些母猪还存在隐性发情的现象，因发情症状不明显，有的几乎观察不到发情症状，常错过最佳的配种时机而导致配种受胎率低，这类母猪也应及时的淘汰。
屡配不孕的母猪是指经过多次配种后返情率较高的母猪，这类母猪通常患有生殖器官的炎症，或者感染病毒而引起的，还有一方面原因是营养缺乏引起的。母猪在正常配种受胎后出现习惯性流产，或者经常难产，产死胎、畸形胎的数量较多时也应及时的淘汰。还有母猪的繁殖性能下降，产仔数少，泌乳性能差，在产后常表现为少乳，甚至无乳，经催乳后产奶性能仍无法提高的情况下，则应考虑淘汰。
引起母猪异常淘汰的主要原因就是患有疾病，常发生的疾病主要是生殖障碍疾病和肢蹄病。常见的繁殖障碍疾病有猪瘟、细小病毒病、伪狂犬病等，这些病会使母猪出现子宫炎、胎衣不下等而面临淘汰的命运。母猪患有肢蹄病是母猪异常淘汰的重要因素，当母猪患有肢蹄病后不但会影响运动，还会使母猪无法承受本身的重量和公猪的爬跨，不能正常的参与配种。
对母猪的饲养管理不到位，如给母猪饲喂发生霉变的饲料，会引起母猪中毒，影响繁殖性能，饲料的营养物质不全，配比不合理等会引起母猪体质下降，导致无法正常的排卵发情。如果母猪的养殖环境过于恶劣，管理粗放，在日常管理、转群、免疫、换料等使母猪产生较大的应激，会对母猪造成极其不利的影响，使健康水平下降，抗病能力下降，繁殖能力下降，而发生异常淘汰。
母猪异常淘汰会增加猪场母猪淘汰率，造成了人力物力的浪费，因此在母猪的养殖过程中需要做好母猪异常淘汰的预防工作。
首先要科学的引种，需要从正规的种猪场引进种猪，并且要加强管理，入场后要做好隔离观察工作后，确保没有问题，并免疫接种后再入舍饲养。
母猪需要进行定期的检疫，以及时的掌握猪场整体的免疫状态，预防重要疫病的发生。做好消毒还要根据当地以及本场的疫病发生情况科学的接种相关的疫苗，以提高机体的免疫力。还要做好养殖场疫病的净化工作，做好消毒、检疫、免疫、隔离的工作，对于检出的阳性个体要及时的淘汰、扑杀并进行无害化处理工作，以避免母猪感染传染性疾病而淘汰。
对母猪进行精心的饲养管理，给母猪提供合适的营养物质，严格的按照母猪不同生产阶段的营养需求来配制和提供日粮，以保证母猪获得充足的营养物质。在妊娠80天-114天添加“牲命1号”，补充母猪的生殖营养，促进胎儿的发育。另外，在饲喂时还要注意饲料的质量，严禁饲喂发生霉变的饲料，以免母猪发生中毒。对母猪进行科学的管理，首先要给母猪提供一个舒适的生活环境。加强母猪的配种管理，在实施人工授精时要保证精液的质量，配种时要做好准备工作和消毒工作，以免母猪感染疾病。加强母猪产后的护理工作，防止母猪发生繁殖系统疾病。另外，母猪哺乳期要合理饲养管理，防止失重过多，影响再次的发情排卵。
