圣域与冥界之间的战斗刚刚结束不久，然而，一个新的威胁悄然降临——天界的力量开始干涉人间。天界之主阿波罗决定派遣他的天斗士来到人间，意图征服并统治地球。五小强与天斗士进行了初次交锋，虽然英勇抵抗，但由于天斗士的力量过于强大，五小强遭遇了失败。战败之后，星矢本来想给阿波罗跪下求饶。紫龙给了星矢一个大比兜，告诉星矢谁都可以跪就你不能跪。于是，他们决定寻求新的力量来源。
这时一个声音飘来，原来是童虎小宇宙发出的声音。童虎说，这都不是问题！想要打天斗士和阿波罗需要新圣衣，集齐散落在人间的五大神灵之石，才能唤醒传说中的圣器——天界圣衣，这是唯一能与天斗士抗衡的力量。五小强踏上了寻找神灵之石的旅程，途中经历了许多艰难险阻。五小强们要从自己的修炼地去寻找自己作为圣斗士的本源，才能找到神石。五小强分别在世界各地找到了神灵之石，并通过一系列试炼，成功唤醒了天界圣衣的力量。
五小强身穿天界圣衣返回圣域，准备与阿波罗及其天斗士展开最终决战。随着一声巨响，天界使者率领剩余的天斗士出现，包围了五小强。阿波罗现身，傲慢地宣布人间即将成为天界的一部分。五小强与天斗士展开激烈战斗，双方势均力敌。战斗中穿插着各种特效和高速移动，场面壮观。在战斗中，星矢回忆起了与雅典娜共同经历过的困难时光，激发了他的斗志，他领悟到了超越天界圣衣的力量。在战斗的紧要关头，十二黄金圣斗士居然全部复活了！
因为黄金圣斗士是守护地球黄道的，拥有匹敌太阳神的能量。十二黄金圣斗士一起出现，并告知星矢打败阿波罗的办法。阿波罗曾经被东方的神射手击败过，他的内心也有着深深的恐惧。随着艾俄洛斯的一支黄金箭，星矢突破极限，召唤出前所未有的力量，这种力量超越了任何圣衣的限制，他的身体开始发光，星矢终于挥出了“天马流星拳”，巨大的能量波，整个圣域都在颤抖，最终，阿波罗被打碎圣衣，当场失败，星矢也内力耗尽，倒在地上。
阿波罗不甘心失败，使用最后的力量反击，想用这招杀掉星矢。别忘了还有四位小强，四位小强分别使用了自己的绝招，将阿波罗彻底击败。在激烈的战斗中，五小强充分发挥了天界圣衣的力量，展现了前所未有的实力。在一场艰苦卓绝的战斗之后，五小强最终击败了阿波罗，解救了被奴役的人类。阿波罗被封印，天界的力量被约束，不再干涉人间事务。
最后的画面，五小强站在圣域的废墟之上，仰望星空的画面结束。他们看着天界的方向，心中充满了对未来的希望和对和平的渴望。镜头缓缓拉远，展示出一个全新的、和平共处的世界。
