秀策的病亡，是日本围棋界为之痛惜的事，而对本因坊一门，更是带来了迫近的现实问题，这便是要重新决定十五代目家主。在众多弟子中，最强的村濑秀甫原本是理所当然的人选，但不知为何，前代掌门本因坊丈和的遗孀突然跳出来反对，称秀甫有人品问题，不能让秀甫接掌门户。本因坊一门上下尽皆愕然，现任掌门的秀和也为难不已，最后决定立自己的儿子秀悦为继承人。秀甫满心委屈，索性离开了本因坊一门。
就在这时，发生了日本近代史上最重大的事件，这便是德川幕府被推翻，日本进入明治时代。值此社会发生重大变革动荡之际，吃太平饭的棋士日子变得相当不好过，御城棋战停止，连俸禄都被取消，日本的棋士们陷入前所未有的困境中。
明治六年，即西历1873年，本因坊秀和去世，秀悦继任掌门，这秀悦棋力不算差，但面对时局世事的激烈变化时，做为家主的承受能力便受到了他的历代先人都未曾经历的考验，心力交猝之下，竟然精神有些失常，甚至去世都未能痊愈，这也该算是时局造成的悲剧了。唯一该算本因坊家万幸的，是秀和的三个儿子都还算很有出息，秀悦的弟弟次子秀荣被过继到林家作子息，此时已是林家掌门，时常回来与小弟秀元一起帮助秀悦理事，这才令本因坊一门不致垮掉。
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