1月18日，南京火车站、京沪高铁南京南站官方微博@铁路南京站 发布情况说明，1月17日20时5分左右，上海虹桥至汉口站的D3014次列车运行到紫金山东站至南京南站区间时，因撞鸟临时停车。
现场检查发现，该趟列车车体附着鸟类羽毛，不影响列车继续行车。20时28分，D3014次列车恢复正常运行，受此影响，共有9趟列车出现20分钟左右不同程度晚点。铁路部门对由此给旅客出行带来的不便深表歉意。
2024年10月27日傍晚，一头野猪侵入南京南站至紫金山东站间的高铁联络线，与通过列车D5515次相撞，引发设备故障停车，造成途经南京南站的部分列车晚点。D5515次随车机械师下车排查处置故障过程中，被邻线限速通过的列车碰撞，经抢救无效不幸身亡。@铁路南京站 当时曾就南京南站列车大面积晚点事件致歉，并于10月29日发布情况说明，表示沉痛哀悼。
