FFPE(福尔马林固定和石蜡包埋) 样本为临床常见样本类型。它们承载着众多疾病相关信息,被称为病理科的“瑰宝”。可以用于大规模的队列研究、患者队列比较和生物标志物寻找。
随着技术的发展和研究的进步,FFPE样本的应用逐渐多样化,从疾病诊断和病理分型到各种组学研究(基因组、转录组、蛋白组、代谢组),FFPE样本的应用范围越来越广。
研究者通过对FFPE样本进行蛋白质组定性和定量分析,可以探究蛋白质表达与疾病的关系。
该产品提供的高质量组学数据和报告图标,不仅可以用于论文发表,还可以作为基金申请前期基础。
1.报告摘要:直击项目结果,体现完整研究思路。
2.结果拼图:高度对标论文,按照目的划分研究模块。
3.方法学表述:高度对标论文,无需客户二次调研。
临床蛋白质组学应用场景
1.研究设计无需做回顾或随访,不过分依赖于原有构建的样本库和病案信息。
2.应用范围广,对前期的研究资源积累要求较低,适用于绝大多数医生和学者。
3.也适用于前期留有样本和病案资料的医生和团队。
4.是最为普适,且便于临床科研起步的服务产品。
1.优化疾病诊疗体系,研发辅助诊断标志物((如肺结节的良恶性诊断,结合LDCT+辅助诊断标志物)。
2.进行不同疾病类型的鉴别诊断(如通过开发新的标志物,从而鉴别诊断肺鳞癌/腺癌)。
3.发现新的诊断标志物用于区分患病与否(如开发新的肿瘤标志物)。
4.分析影响疾病严重程度的分子机制(如开发新的蛋白质标志物用于肿瘤的分型、分级和分期)。
1.存有或可以取得队列样本。
2.建有大队列的课题组/样本库,存留了基线期的样本,可设置不同结局变量进行研究设计。
3.正在有目的性的建小队列的团队,将蛋白质组学加入,在原有基础上筛选和发现相关蛋白质,阐释生理病理机制。
4.帮助客户起步设计方案,建小的短期队列,随访时间不能太长,选择短期可发生的结局变量。
1.发现病因线索。通过横断面研究设计,描述疾病的分布和疾病的蛋白质表达情况及其相关性,分析疾病发生潜在的分子机制,提出疾病可能的病因假设(如儿童高血压,分析血浆中蛋白质的表达情况和疾病的分布特点,推断发病可能的分子机制)。
⒉验证病因假设。常用巢式病例对照研究,探讨疾病的多个病因,根据可疑致病因素(如蛋白质表达情况)对疾病的发病进行定群研究;随后通过队列研究和实验性研究进一步进行疾病病因的因果推导(如儿童高血压的病因,内因:蛋白质表达情况;外因:母亲哺乳期吸烟与否等)。
1.存有或可以取得队列样本。
2.建有大队列的课题组/样本库,存留了基线期的样本,可设置不同结局变量进行研究设计。
3.正在有目的性的建小队列的团队,将蛋白质组学加入,在原有基础上筛选和发现相关蛋白质,阐释生理病理机制。
4.帮助客户起步设计方案,建小的短期队列,随访时间不能太长,选择短期可发生的结局变量。
1.细分疾病预后差异人群。通过蛋白质组学技术,构建预测模型,寻找具有疾病预后分层能力的蛋白质(如影响黑色素瘤的预后好坏的因素)。
2.提高疾病预后的精准度。利用蛋白质组学技术,构建新的疾病预测模型或优化现有预测模型,提高对疾病预后的预测能力。
3.疾病的预后出现时刻,以及影响预后出现早晚可能的蛋白质情况。
今天小编给大家介绍的是临床蛋白质组学的三种应用场景,下一期我们将接着介绍剩余2种并介绍FFPE样本的热门研究方向以及初步思路。
如您想了解FFPE样本研究的基本信息,可以查看往期文章:
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