DBgDel是一个数据库驱动的框架，用于计算基因删除策略，以解决计算效率低下的问题。该框架分为两个主要步骤：首先，从MetNetComp数据库中提取最大删除策略的“剩余基因”，以形成集中初始基因池；然后，应用改进版的gDel minRN算法，快速有效地计算基因删除策略。DBgDel在处理E. coli核心、iMM904和iML1515等三种代谢模型时，表现出显著的性能提升，平均加速达到6.1倍，并能够识别507种目标代谢物的删除策略，为基因组规模的代谢工程提供了可扩展且实用的解决方案。
参考：
https://arxiv.org/abs/2411.08077
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