作者丨丁小然
审校丨范锐
课程简介
工程生物学将工程原理应用于生物学,旨在利用我们的合成生物学知识推动生物经济。工程生物学博士培训中心 (EngBioCDT) 将提供定制的基于群组的培训,重点关注如何将合成生物学概念和技术转化为具有现实影响的产品。
该课程与布里斯托大学联合举办。
在完成数学、生物学、工程和计算基础知识以及基于团队的问题解决项目的培训后,您将完成两个短期研究项目,其中一个将发展成为您的实质性 DPhil 项目。在整个课程中,您将接受转化方面的定制培训。
在该项目的四年内,将有定制的创新和商业化培训、负责任的创新、EDI 和生物伦理学培训以及职业发展计划。
每年的六月/七月都会举办一所暑期学校,其中包括工程生物学领导者的演讲、工程生物学项目创新的推介以及外展项目。在课程期间,您还可以参加工程系和大学其他院系的各种研讨会和座谈会。在学期期间,所有研究生都必须参加院系定期举办的研讨会,以及工程系每年举办的拉伯克讲座和生物工程活动。
学生还会参加定期的进展研讨会,这些研讨会将院系内从事相关领域的团队聚集在一起。候选人的潜在研究小组能够建议您参加哪些系列研讨会。所有研讨会都会在门户网站 Oxford Talks 上公布。候选人将有多个机会在课程内和向更广泛的大学观众展示展示工作。
课程描述
课程第一年将分为三个部分。
第一阶段将以一系列入职介绍开始,作为该系在牛津举办的迎新周活动的一部分。其中包括会见导师、潜在主管、管理团队和其他班级的学生。
然后,候选人将接受大约四周的基础培训。学生群体将根据背景分为两组。具有生命科学背景的学生将接受工程和计算原理方面的基础培训,而具有工程/物理科学背景的学生将接受生物学方面的基础培训。
随后,学生将接受约六周的工程生物学主题、技术和挑战专业培训。该培训将在布里斯托大学面向所有学生进行。它通常包括跨规模(从生物分子到细胞)的工程生物学设计跨学科培训,以及高级工程生物学主题和技术,例如:
建模与控制理论
人工智能和机器学习
基因电路设计
蛋白质设计与工程
组织工程。
在第一阶段结束时,成功的候选人通常会参加工程生物学小组项目创新研讨会。早期学生、合成生物学毕业生、行业合作伙伴和主管可能会参加,他们将提供意见和案例研究。
在第二部分的前四周,您将致力于工程生物学小组项目的创新,并以科学出版物的形式撰写报告,并尽可能向未来学生提供数据和代码,以提供在已进行的研究基础上继续研究的机会(例如通过 GitHub)。接下来是两个个人短期研究项目中的第一个。
第三部分将包括这些研究项目中的第二个和一个暑期学校。研究将针对以下四个主要重点领域:
生物工程的稳健方法;
合理的生物分子和生物系统设计;
进化引导的生物设计;或
数字细胞和人工智能。
布里斯托大学还将提供潜在的合作研究项目,可在该机构的网站上找到。
两个短期研究项目中的一个通常会发展成为实质性的 DPhil 项目,候选人将在第二至四年内继续进行该项目。
大学鼓励与行业合作伙伴合作进行短期项目和实质性的 DPhil 研究,并可以在面试时讨论。
候选人还将与课程的其他部分一起学习工程生物学人工智能和机器人技术以及当前工业工程生物学应用的高级单元。
出席
本课程为全日制,要求在牛津就读。全日制学生需遵守大学的住宿要求。
某些课程的学生可以在大学外的“设施完善的实验室”进行研究。这可能需要前往牛津以外的地点并亲自到场。
支持您学习的资源
作为一名研究生,候选人将可以使用大学广泛的世界一流的资源,包括图书馆、博物馆、画廊、数字资源和 IT 服务。
博德利图书馆是英国最大的图书馆系统。它包括博德利主图书馆和牛津各图书馆,包括主要研究图书馆和教职员工、系和研究所图书馆。这些图书馆总共拥有 1300 多万份印刷品,提供电子期刊访问权限,并包含出色的特殊收藏,包括稀有书籍和手稿、古典纸莎草纸、地图、音乐、艺术和印刷品。
大学的 IT 服务面向所有学生开放,为学生提供核心大学 IT 系统和工具以及许多其他服务和设施的支持。IT 服务还为学生提供一系列 IT 学习课程,以支持学习和研究。候选人将可以使用大学图书馆,例如拉德克利夫科学图书馆和凯恩斯图书馆。图书馆访问权限包括对所有相关科学期刊的完全在线访问。
工程系内设有多间研讨室和会议室,配备齐全的视听设备。导师实验室内将为您提供工作台和合适的办公桌。该部门拥有纳米级表征、流式细胞术、显微镜和基因组工程等中央设施。部门成员还可以使用各种共享设施,包括蛋白质组学、成像、结构生物学、基因组学、3D 打印和生物打印以及药物研发。这些资源的使用均由培训和支持提供。
监管
本课程的研究生指导分配由工程科学系负责,并不总是能够满足新研究生与特定教职员工一起工作的偏好。指导老师通常在工程科学系之外。
在培训期间,您将有机会接受课程主任和其他课程工作人员的定期个人指导。在 DPhil 学习期间,您将根据所在部门的规定进行会面。
评估
在培训期间,将进行形成性和总结性评估(例如论文、演示文稿)。候选人还将在第一年完成两个短期研究项目,其中一个将发展成为您的实质性 DPhil。项目将通过书面报告和口头陈述进行评估。所有学生最初都将以见习研究生 (PRS) 的身份被录取。在作为 PRS 学生的最多六个学期内,您将需要申请从见习研究生身份转为 DPhil 身份。如果无法完成牛津大学 DPhil 学位的转学,则将根据获得的学分 (CP) 发放毕业奖励(由布里斯托大学提供,无论其原就读院校如何)(MRes 获得 180 CP,或对于较低的 CP 有所不同,遵循布里斯托大学学分框架)。要成功从 PRS 转为 DPhil 身份,需要根据您所在院系的当地规定提交作业并参加面试。成功转学的学生随后需要在入学后的 10 个学期内申请并获得 DPhil 身份确认,以表明您的工作仍在按计划进行。入学四年后,您需要提交一份内容丰富、原创的论文。要成功获得博士学位,您需要在两名指定考官面前口头答辩您的论文(口头答辩)。
招聘岗位
博士学生(DPhil)
截止时间
2025 年 1 月 8 日
候选人要求、岗位具体工作内容、岗位待遇以及其他细节请看原文链接:
https://www.ox.ac.uk/admissions/graduate/courses/engineering-biology
职位简介
该职位的主要职责是开展合成和分子生物学研究、进行项目管理、撰写报告、研究论文和申请、在会议上展示研究成果以及指导学生。鉴于该项目的跨学科性,该职位针对具有生物技术/生物学/分子或合成生物学/生物工程背景的申请人。具有合成生物学、细菌和真核细胞工程领域的经验以及熟悉多组合作是基本要求。PDRA 将领导他们的项目,与 Ceroni 和 Ellis 团队合作。Francesca Ceroni 博士是高级讲师,Tom Ellis 教授是教授,两人均在伦敦帝国理工学院工作。
职位要求
成功的申请者将需要设计和开展实验来构建哺乳动物细胞系,通过尖端的分子克隆协议设计和开发遗传构建体,进行转染和细胞表征。
有效的项目管理至关重要,因为候选人将监督时间表、资源和可交付成果,确保项目里程碑得以实现。此外,申请人还将准备研究报告、为科学出版物和实验室的日常活动做出贡献。他们将指导学生并与合成生物学中心和化学工程与生物工程系的社区互动。与其他团队成员和利益相关者的合作对于整合研究结果和推进项目至关重要。
生物学、合成生物学、生物工程、化学工程或相关学科博士学位。具有哺乳动物细胞工程方法的实践经验
具有批判性、独立思考能力并能领导自己的工作计划
有能力指导所监督学生的工作。
招聘岗位
岗位待遇
此职位有效期为24个月。起薪视经验而定。
截止时间
2024 年 12 月 10 日
候选人要求、岗位具体工作内容以及其他细节请看原文链接
https://www.imperial.ac.uk/jobs/search-jobs/description/index.php?jobId=21744&jobTitle=Research+Associate+in+Synthetic+Biology
职位简介
金属螯合是许多家庭和工业清洁场景中必不可少的机制。在洗衣过程中,各种颜色鲜艳的污渍的颜色都来自污渍中存在的金属络合物。螯合这些污渍络合物中的金属,有效地将它们从污渍中去除,去除污渍颜色,是有效去污的主要机制之一。此外,重金属会积聚在织物上,随着时间的推移会损坏纤维结构,并降低其他清洁成分的有效性,例如受金属催化分解机制影响的氧化剂(过氧化氢)。因此,有效地螯合这些金属有助于提高整体洗涤剂的性能。
目前,洗衣产品中使用的大多数性能最佳的螯合剂都是不可生物降解的化学品,目前很少有高性能可持续替代品可以替代这些螯合剂。许多蛋白质与金属结合力强,因此有望成为高效的金属螯合剂。
该项目旨在开发对铁具有高结合亲和力的肽,铁是污渍中最常见的金属之一。为实现这一目标,我们将结合合成生物学、自适应实验室进化 (ALE)和计算蛋白质设计方法。
这项研究有可能对广泛的产品应用产生重大影响。它为博士生提供了一个独特的机会,使候选人们成为计算和湿实验室分子技术方面的专家,这对于 21 世纪的学术和工业研究与开发事业都至关重要。通过与宝洁公司紧密的工业合作伙伴关系,它为未来的学生提供了真正影响日常消费品可持续性的机会,有助于向生物技术驱动的循环经济转变。除此之外,我们预计该项目将产生大量具有高影响力的出版物。
招聘岗位
博士 (PhD student)
职位及入学要求
详细信息请参考原文链接
通过构建合成生物回路,将表现最佳的候选蛋白质直接与细菌生长联系起来,实现金属结合蛋白质的定向蛋白质进化。这将涉及使用液体处理机器人和自动化生物反应器的自动化技术,以及用于突变体高通量组合组装的尖端分子生物学技术。
结合量子力学、分子动力学模拟、对接模拟和 3D 神经网络等尖端计算方法,进行从头蛋白质设计,以生成模拟全长蛋白质对铁的高亲和力的肽。学生将接受这些计算方法的世界级培训。
使用各种光谱和其他分析技术对最小铁结合肽进行详细的生化表征。
拟录取学生的学术成绩优秀,即 2:1(或非英国大学的同等 GPA [优先考虑一等荣誉]);或硕士学位(优先考虑优异或以上成绩)。
如果需要,可提供适当的雅思成绩或同等成绩。
如果申请人目前正在攻读博士学位,则不能申请此项资助。
截止时间
2024 年 11 月 22 日
候选人要、岗位具体工作内容以及其他细节请看原文链接:
DeepMind简介
科学是 Google DeepMind 一切工作的核心。从一开始,DeepMind就从科学中汲取灵感,构建更好的算法,现在,DeepMind希望利用工具包来加速科学发现。通过汇集机器学习、计算机科学、物理学、化学、生物学等背景的专家,DeepMind认为,他们可以构建新的方法,突破可能的界限,帮助解决人类面临的最大问题。
招聘岗位
实验室研究科学家(Laboratory Research Scientist)
岗位要求
成功担任 Google DeepMind 的研究科学家,需要您具备以下技能和经验:
相关领域(蛋白质设计/工程、生物化学、结构生物学或类似领域)的博士学位或 5 年以上同等行业经验。
机械酶学或生物催化方面的专业知识。
具有开发和运行酶活性检测(例如比色法、荧光法、质谱法等)的实践经验。
具有开发和运行生物物理蛋白质特性(例如稳定性、寡聚状态、结构等)分析的实践经验。
能够独立排除故障并实施研究项目。
高度关注细节并表现出解决问题和生成高质量数据的毅力。
擅长与计算和实验研究人员进行团队合作。
此外,以下情况也是一大优势:
2-3年的博士后研究经验。
拥有以下任何领域的专业知识:计算蛋白质设计、计算化学、机器学习、高通量分析开发或实验室自动化。
能够编写代码来执行自定义数据分析。
对人工智能和蛋白质设计的热情!
岗位职责
作为从事蛋白质设计的实验室研究科学家,将在开发和验证用于创造具有新功能的蛋白质的尖端 AI 工具方面发挥关键作用,重点是酶催化。候选人将运用在酶学和生物化学方面的深厚实践专业知识,在弗朗西斯克里克研究所的研究实验室开发和执行检测,以验证由机器学习模型设计的蛋白质。此外,候选人将与机器学习专家合作,利用您对酶结构和机制的理解来排除故障并改进设计方法。最后,将就酶设计和工程以及更广泛的生物分子建模提供建议并制定雄心勃勃的新研究目标。
设计、优化和执行实验来表征机器学习模型设计的新型酶和其他蛋白质的功能。
培训队友进行实验室技术。
与来自不同科学背景的队友合作,改进和扩展蛋白质设计工具的功能。
在快节奏的环境中,以口头和书面的方式,清晰有效地向内和向外报告和呈现研究成果和发展,包括现状和结果。
与外部合作伙伴合作并与相关研究实验室和关键利益相关者保持适当的关系。
维护高质量的电子实验记录,为湿实验室空间和运行的维护做出贡献。
截止时间
2024年11月27日英国时间下午5点
https://boards.greenhouse.io/deepmind/jobs/6394421
中国科学院天津工业生物技术研究所简介
中国科学院天津工业生物技术研究所是从事生物技术创新推动工业领域生态发展的科研机构,肩负着建立我国工业生物技术创新体系、促进工业绿色升级的历史使命。围绕“以可再生碳资源替代化石资源、以清洁生物加工方式替代传统化学加工方式、以现代生物技术提升产业水平”三大战略主题,重点开展“工业蛋白质科学与生物催化工程、合成生物学与微生物制造工程、生物系统与生物工艺工程”三个领域方向的基础研究和应用基础研究。面向天津与国家经济社会发展重大需求,由中国科学院与天津市人民政府共建、天津工业生物所牵头建设“国家合成生物技术创新中心”(National Center of Technology Innovation for Synthetic Biology),定位于实现从合成生物科学到合成生物技术的转化,促进合成生物科技成果产业化。中心以建成专业化、开放共享的国家科技平台为建设目标,形成合成生物技术创新的大联合、大协同、大网络,打造我国合成生物领域战略科技力量,为国家产业技术变革与国际竞争提供战略支撑。中心将凝聚百余个创新创业团队,科技人员总量规模逾千人,成为我国生物技术人才汇聚和培养的高地,是合成生物科技创新和产业发展的重大引擎。
根据研究所创新发展和国家合成生物技术创新中心建设及相关重大项目攻关需要,诚邀海内外优秀人才加入,共同为促进工业生物技术领域的发展而奋斗!
招聘团队简介
有机一碳生物代谢与转化研究组聚焦于甲醇等一碳化合物的微生物代谢与生物转化利用研究,针对天然和合成的甲基营养微生物,开发基于CRISPR等系统的高效基因组编辑、多基因精细表达调控等先进的合成生物学使能技术,解析微生物一碳代谢的遗传与调控机制,重塑一碳代谢网络与产物合成途径,设计创制高效生物转化甲醇等一碳原料合成生物基材料单体、氨基酸和单细胞蛋白等的一碳细胞工厂,为推动生物制造的一碳原料替代和生物基产品的可持续供给提供源头创新和技术支撑。
研究组组长王钰,博士,研究员,博士生导师。本科和硕士毕业于山东大学,博士毕业于上海交通大学,2016年获得博士学位后加入天津工业生物技术研究所,历任助理研究员和副研究员,2022年破格晋升研究员。主要从事生物制造微生物菌种(细胞工厂)的设计创制与一碳原料的生物转化利用研究。国家自然科学基金优秀青年科学基金获得者,中国科学院首批特聘研究岗位、中国科学院青年创新促进会会员,获得MIT Technology Review亚太区“35岁以下科技创新35人”、日本生物工程学会DaSilva Award、“伦世仪教育基金”杰出青年学者等荣誉,在Nature Communications、Trends in Biotechnology、Metabolic Engineering等期刊发表第一或通讯作者论文50余篇,申请PCT及中国发明专利40余项。目前主持中国科学院战略性先导科技专项、国家重点研发计划“合成生物学”重点专项、国家自然科学基金优青、面上项目等。兼任天津市青联常委、中国化工学会生物化工青年委员会委员、中国生物工程学会青年工作委员会和一碳生物技术专委会委员、中国遗传学会微生物遗传专委会委员、天津微生物学会理事、中国科学院青年创新促进会生命分会副会长等。
招聘岗位
博士后1-2名,助理研究员1-2名
岗位待遇
博士后:
1.年薪最高可达研究所副研究员标准;
2.按照研究所规定足额缴纳社保和住房公积金;
3.符合条件者推荐申报“全国博士后创新人才支持计划”;
4.符合条件者推荐申报“全国博士后国际交流合作计划”,入选者自动入选中国科学院特别研究助理项目;
5.符合条件者推荐申报中国科学院特别研究助理项目;
6.解决本人及新生子女落入研究所集体户口;
7.享受天津市博士后相关政策和滨海新区人才服务证银卡政策,具体以政府部门解释为准。
助理研究员:
1.提供具有竞争力的薪酬待遇;
2.按照研究所规定足额缴纳社保和住房公积金;
3.对科技成果转化作出贡献的,根据研究所制度给予额外奖励;
4.具有完善的员工职业发展体系和培训体系,给员工创造培训、学习及晋升条件,享受健康体检、带薪年假等福利;
5.解决本人及新生子女落入研究所集体户口;
6.享受天津市和滨海新区相关人才政策,具体以政府部门解释为准。
招聘要求
1.具有微生物学、发酵工程、合成生物学、代谢工程、分子生物学、生物化工等相关专业背景;
2.具有或近期将取得博士学位,拥有丰富实践经验和特殊技能者可放宽至硕士学位;
3.具有独立开展科研工作的能力和优秀的中英文写作能力,以第一作者在国际主流期刊上发表过高水平研究论文;
4.人品端正,具有强烈的进取心、责任心、独立思考能力和团队协作精神,具有良好的沟通表达能力;
5.工作勤奋、细致,有较强的学习能力。
应聘方式
应聘者请填写中国科学院天津生物技术研究所岗位申请表(见附件)以附件形式发送至wang_y@tib.cas.cn,同时抄送至tib_zp@tib.cas.cn。邮件名称为“有机一碳研究组+岗位名称+姓名”。
截止时间
尽快申请
http://www.tib.cas.cn/tzxx/rczp/202411/t20241101_7415905.html
\上期回顾\
深圳先进院合成所,荷兰瓦赫宁根大学,慕尼黑工业大学...博士/博士后丨再创·人才
再创对于每个合成生物学相关课题组的招聘信息发布是免费的。
请将招聘信息以 Word 文件格式发送至微信ID:Bio-regenesis2017。微信消息标题注明【课题组招聘】,招聘信息至少包含课题组介绍、岗位具体介绍以及应聘联系方式等。
\ END \