重磅!不花钱的分子对接平台上线了

教育   2024-12-01 08:20   四川  

今天的题目略显浮夸,“重磅”这样浮躁的字眼竟然也被我们用上了。

但分子对接平台值得这两个字,因为这个分析找公司至少千把块,用这个工具,一分钱不要!

为啥这么贵?

因为好看,放文章里显著增加逼格,进而增加期刊接受率(我猜的,但谁不喜欢图片好看的文章呢)。
还因为会做的人少,计算生物学专业的同学会,一般人都不会。
但其实,凡是你的文章或课题结果里涉及到小分子和靶蛋白结合,多肽和蛋白结合,蛋白和蛋白结合的结果,都可以增加分子对接的数据,相当于增加了原子水平的的结合证据,如此显然就可以让结论更加Solid啦。
随便搜一篇,比如在这篇Nature Communications上的文献里,作者在实验的基础上,进行了分子对接,以说明 QPD-OTf 和驱动蛋白-1的结合。

再比如我们平常生信分析里经常会分析到蛋白相互作用,针对某个靶蛋白筛选出一些小分子呀,都可以加上了。实验的时候发现上下游蛋白直接作用.....
分子对接(Molecular docking)就是从原子水平,通过计算机模拟技术,研究分子之间的相互作用过程。
这个工具支持零基础,零代码,基于靶蛋白的小分子、多肽、蛋白对接分析,高清结果图可在论文中直接使用。
比如可以做文献中类似这样的图:

比如

再比如

使用方法小白化。

第一步登录工具,页面简洁无比,顶部支持小分子,多肽,蛋白质和蛋白质的对接分析,分子哪个选哪个。

左边可见只需三步完成:第一步是从PDB数据库选择蛋白的三维结构(PDB是目前收录蛋白三位结果的数据库,基本上你想研究的蛋白都能找到。),可以直接搜关键词或者输入PDB编号。

第二步:系统自动会选择使用原对接口袋(位置)还是全蛋白对接范围。

第三步:选择小分子,是从PubChem数据库(也是一个收录小分子化合物的权威数据库,基本都能找到),也可以直接搜关键词或者输入CID编号。

第四步:点击开始对接

出图!

左边按结合能排序,越低越好(好理解,需要结合的能量越低,就越说明能结合)

可以导出对接结果的原始文件,投稿不用怕了。

直接点击下载按钮,设置超高清分辨率,获得高清图片。

文章写作呢?

不怕,方法学,结果,图例写作示例也都有了啦,中英文对照哦,(当然,也可以用AI写作助手根据关键词搜索,匹配海量文献语料)。

以下是某个专做分子对接收费的老铁的试用反馈。看到这,我们就放心了,2个月爆肝没白干

对不起老铁,这是科研者之家的使命:“降低科研门槛,提高科研效率,创新科研教育模式”。

希望这个工具对大家有用。

本月推文额度有限,顺便把另一个小工具讲一下哈。

就是最近给临床的同学整了一个可以分享临床指南(Guideline)的小工具,大家自行分享就行,目前有超过500+个指南,大家自由分享,阅读学习。



最近更新:

1. “审稿人/回复信”写作工具总量超135万个段落。

2. Crosscheck自助查重系统上线,采取市场成本价:1.5万字35元

3. AI写作助手CNS期刊等语料开始录入。

4. Scihub永久链接上线(首页底部按钮)

5. 简明统计学工具上线,包含6种场景。

6. 智能选刊助手上线。

7. 课题思路助手上线。

8. 服务器第七次扩容,提升检索速度(8月23日0点-1点)

9.AI写作助手检索速度进入“毫秒级”时代

10.CNS语料库上线

11.自建语料库功能上线

12.CNS语料库再次增加1000万

13.自建语料库,语料支持收藏、导出、打印

14.家族迎来首个新成员:临床生信之家 www.aclbi.com它为”生信0代码”而生。

15.每日文献速递上线

16.同义替换功能上线

17.风禾云课堂上线

18.文献单词我爱记上线

19.Figdraw绘图平台上线

20.22年影响因子预测上线

21.获国家级高新技术团队认证

22.AI降重改写上线

23.中文版Pubmed上线

24.24小时预审平台上线(巧了,名字和序号竟然正好一样了哈)

25.专刊/特刊追踪系统上线

26.实验数据探索工具上线

27.临床指南汇上线

28.分子对接平台上线


http://www.home-for-researchers.com

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