国自然「科学假说」的 3 种叙事方式

学术   2024-11-28 18:34   浙江  
科学假说是国自然标书的灵魂。分子机制又是科学假说的关键。我们假设分子机制是:A→B→C,那么分子机制的「故事」该如何娓娓道来呢?这里推荐三种写法,分别是:正序、倒序和两头堵!究竟哪种写法更好呢?

(一)正序:A→B→C

就像一部电影一样,不用反转,就是一部纪录片的手法,从大数据分析提炼出 A 的差异表达和功能作用,然后沉默 A 或者过表达 A 之后,发现了 B 分子,B 分子是 C 通路或者表型的明星分子,这种叙事方式最波澜不惊。

如果我们以这篇文章的思路为例,这种叙事方式类似于下面这种逻辑:


已知的基础知识:
①铁死亡可抑制肝纤维化,抑制铁死亡,发生肝纤维化;
②SLC7A11 是铁死亡的抑制因子;
③HIF-1α 是转录激活因子。
A(HIF-1α)→B(SLC7A11)→C(铁死亡)
故事如下:
(1)  索拉非尼抑制肝星状细胞(HSC)激活而改善肝纤维化;
(2)  在索拉非尼诱导的抗纤维化过程中,HIF-1α 表达降低;
(3) HIF-1α 通过激活 SLC7A11 的转录,SLC7A11 是铁死亡的抑制因子;
(4)  索拉非尼通过抑制 HIF-1α 触发 HSC 铁死亡;
(5)  阻断 HSC 铁死亡可消除索拉非尼诱导的抗纤维化作用。

(二)倒序:C→B→A

(1)  索拉非尼诱导的小鼠肝纤维化发生了铁死亡;
(2)  索拉非尼通过体外触发铁死亡抑制 HSC 激活;
(3)  阻断 HSC 铁死亡可消除索拉非尼诱导的抗纤维化作用;
(4)  在索拉非尼诱导的抗纤维化过程中,SLC7A11 表达降低;
(5)  索拉非尼通过抑制 SLC7A11 触发 HSC 铁死亡;
(6) HIF-1α 通过激活 SLC7A11 的转录抑制 HSC 铁死亡;
(7)  索拉非尼抑制 HIF-1α 的表达水平促进 HSC 铁死亡;


(三)两头堵:A→?→C,原来中间分子是 B(SLC7A11)!

这种叙事方式的逻辑的硬伤最少,最符合逻辑推理的习惯,更容易被大家理解。

(1)  索拉非尼抑制 HSC 激活而改善肝纤维化;
(2)  索拉非尼处理肝纤维化的小鼠后肝发生了铁死亡;
(3)  阻断 HSC 铁死亡可消除索拉非尼诱导的抗纤维化作用;
(4)  在索拉非尼诱导的抗纤维化过程中,HIF-1α 表达降低;
(5)  索拉非尼通过抑制 HIF-1α 触发 HSC 铁死亡;
(6) HIF-1α 通过激活 SLC7A11 的转录抑制 HSC 铁死亡。


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