“药食同源”再发力,狠狠拿捏中医药1区宝藏刊!河南中医药大学瞄准小众疾病,网络药理学+分子对接+实验,干湿结合简直太好发了!

文摘   2024-11-29 10:00   上海  


网药怎么做点新鲜的?

馆长推荐你做“药食同源”方向,最近可火了呢!

今天就带来发在中医药宝藏刊(Journal of Ethnopharmacology)中的药食同源文章。该刊最新影响因子4.8,是中科院1区Top刊,初审一般在28-42天左右,从投稿到最终决定通常需要2-3个月。年发表量大约1281篇,可选择无版面费发表。适合植物药的药效研究、传统医学的科学验证、民族药物的药理机制和天然产物的分离与鉴定方向的小伙伴投稿。

回到正题,看文章。从切入角度来看,文章选择的疾病是烧伤,研究比较少,比较新颖;选择的中药是药食同源的沙棘,研究量也不大,两者结合创新性不错。从思路设计角度来看,该文将常规网药分析与分子对接和实验相结合,干湿结合,内容丰富,比较好发文!思路送到眼前啦,赶紧换个药食同源的中药复现它!什么?你说不知道如何把自己的课题与这类思路进行有机结合?那还等什么,找馆长来帮你啊,咱有专业团队,为您精准提供个性化服务。

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题目:探索沙棘籽乙酸乙酯组分作为天然伤口修复剂的潜在机制

杂志:Journal of Ethnopharmacology(IF=4.8)

发表日期:2024年8月

研究背景

沙棘因其营养价值被国家卫生委员会指定为“药食同源”水果。在传统的中国民族医学中,沙棘通常用于治疗不愈合的伤口,如烧伤、溃疡和胃溃疡。该研究的主要目的是确定沙棘籽治疗烧伤的最有效药物作用部位,并探讨其治疗作用的物质基础和机制。

研究思路

该研究首先通过MTT试验、划痕试验、transwell试验和羟脯氨酸分泌分析评价沙棘籽提取物的不同组分对人皮肤成纤维细胞(HSFs)增殖和迁移的影响。由于SBS-EF有最大活性,作者通过UPLC-Orbitrap-Exploris-120-MS鉴定其化学成分。随后从公共数据库中收集SBS-EF化学成分的靶点和烧伤的靶点,进行网络药理学分析,将成分与关键分子进行分子对接分析。最后在烧伤大鼠模型中检测SBS-EF的伤口修复作用和简单机制。

主要结果

1. 体外筛选 SBS 中最具药用价值的部分

首先制备SBS各类提取物,得到沙棘籽水提取物(SBS-AE)、沙棘籽乙醇提取物(SBS-EE)、沙棘籽石油醚馏分(SBS-PF)和沙棘籽乙酸乙酯馏分(SBS-EF)。通过MTT实验、划痕实验、transwell实验和羟脯氨酸分泌分析评价沙棘籽提取物的不同组分对HSFs细胞增殖和迁移的影响。结果发现,SBS-EF可以显著增加细胞活性(图1),显著增强细胞迁移(图2,图3),显著增加羟脯氨酸分泌(图4)。

图1:MTT实验

图2:划痕

图3:transwell实验

图4:羟脯氨酸分泌检测

2. SBS-EF成分的鉴定

由于SBS-EF馏分最具药用价值,所以作者通过UPLC-Orbitrap-Exploris-120-MS鉴定SBS-EF化学成分。MS指纹图谱显示,具有不同保留时间、质量数和碎片模式的10种化合物的数据与在线数据库中的数据相匹配(图5)。

图5:SBS-EF成分的鉴定

3. 网络药理学分析和分子对接

使用来自这10种化学成分的UPLC Orbitrap Exploris 120 MS数据,从SwissTargetPrediction数据库筛选出82个相关靶标。从TTD、GeneCards,、PharmGKB、 OMIM和NCBI数据库中筛选出4451个烧伤相关靶标,取交集后得到150个共享靶标。对共享靶标进行PPI网络分析,TNF、IL-6、AKT1、SRC和EGFR是主要的核心靶标。利用 KEGG 数据库进一步研究了degree超过平均值(20)的57个核心靶点,发现它们的治疗效果与VEGF信号通路、糖尿病疾中的 AGE-RAGE 信号通路和 HIF-1 信号通路之间存在潜在的相关性(图 6)。根据上面分析结果,作者对参与Wnt/β-连环蛋白信号通路的蛋白质Wnt3A、β -连环蛋白、GSK3β、APC、AXIN、FRIZZLED 和LRP5/6 进行了八种不同化合物的分子对接分析(图7)。

图6:网络药理学分析

图7:分子对接

5. 动物实验验证SBS-EF的伤口修复作用

作者制备了大鼠烧伤模型检测SBS-EF的伤口修复作用。结果显示,SBS-EF处理后的伤口愈合率显著升高,皮肤水合作用也显著减少,烧伤皮肤中羟脯氨酸含量显著增加(图8)。组织病理学结果显示,SBS-EF处理显著的改善了真皮组织中胶原纤维的排列、产生和构型,减少疤痕组织和提高愈合过程中再生组织的质量(图9)。最后用WB检测Wnt3a、β-连环蛋白和GSK-3β的蛋白水平,结果发现SBS-EF的使用导致Wnt3a和β-连环蛋白的显著上调以及磷酸化GSK-3β的水平表达的显著降低,激活了Wnt/β-连环蛋白信号通路,增强了伤口修复过程(图10)。

图8:SBS-EF 对烧伤大鼠皮肤的修复功效

图9:组织病理学检测

图10:WB检测

小结

这篇文章的网药+生信分析内容非常丰富的,又具备较高的创新性,再加上验证试验的锦上添花,发到BIB上也是实至名归的。做中药方向的朋友不妨试试用这个新方法扩充你的网药分析,争取能纯生信发文!想要在中医药领域求突破的朋友,这个创新思路可别错过,想个性化设计这类思路?欢迎随时联系馆长!专业团队为你保驾护航,1V1定制创新思路!

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