王瑞连早年在西藏自治区党委组织部任职，2000年3月任西藏自治区党委组织部副部长。2003年1月，他任西藏自治区党委组织部副部长、老干部局局长。2005年7月，任西藏自治区山南地委副书记、行署常务副专员（正地级）。2006年12月，任西藏自治区山南地委副书记、行署专员。
2008年1月，他任西藏自治区昌都地委书记、地区人大工委主任。2011年11月，任西藏自治区党委组织部常务副部长。2012年4月，任西藏自治区党委秘书长，区直机关工委书记。
2013年1月，他任西藏自治区人大常委会副主任，区党委秘书长，区直机关工委书记。同年6月，任西藏自治区党委常委、秘书长。2017年2月，他跨省份履新，任海南省委常委、组织部部长、教育工委书记。2018年10月，任湖北省委常委、组织部部长、省委党校校长。2020年10月，任湖北省委副书记。
2021年4月，他任国家体育总局副局长、党组副书记，直至此次到龄卸任。此前，他还担任中国体育仲裁委员会主任，中国关心下一代工作委员会副主任。
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