美国纽约爱因斯坦医学院博后招聘,Prof. Charles Query 实验室 RNA 生物学领域招聘 1-2 名博士后,主要研究 RNA 剪接在疾病中的影响。
有分子生物学、遗传学、细胞生物学、计算生物学或相关研究领域经验者优先。
地点 Lab of Charles Query, M.D., Ph.D.Albert Einstein College of MedicineJack and Pearl Resnick Campus1300 Morris Park AvenueChanin Building, Room 415ABronx, NY 10461
联系人 Charles Query
电子邮件 charles.query@einsteinmed.edu
网站 https://einsteinmed.edu/faculty/6996/charles-query/
项目描述 内含子从 pre-mRNA 中移除是由剪接体催化的,剪接体由 5 个 snRNPs 组成,snRNPs 含有小核 RNA (snRNAs)和数十种蛋白质。U2 snRNA 在整个剪接周期中进行关键的 RNA-RNA 和 RNA -蛋白接触。尽管许多 U2 snRNP 蛋白携带与疾病相关的突变,但对U2 snRNA 突变知之甚少-主要是因为定位到复杂的多个遗传位点的生物信息学。
为了解决 snRNA 在基因图谱上的漏洞,我们开发了一个生物信息学单一基因组,使用了定制的 snRNA 单一基因组来识别 U2 突变。我们对 1452 个 TCGA 基因组进行了分析,发现高度保守的分支识别茎环(BSL)中存在 U2-1 和 U2-2 基因突变,在膀胱癌中最为突出(约25%的病例含有基因突变)。
同时,我们在一个哥伦比亚大学膀胱癌类器官生物库中也证实了这些突变的存在。我们目前正在癌细胞系模型中研究已鉴定的突变和 U2-2 完全敲除的功能后果。RNA 测序结果显示,与野生型(WT)相比,突变型和 U2-2 KO 株系显著改变了剪接和基因表达模式。新项目将集中在测试模型上,通过这些模型,改变后的 U2-2 将在拼接中使用不同的分支-3’ 剪接位点 。
纽约的爱因斯坦医学院为生物医学研究提供了非常丰富的环境,为博士后提供全面的培训,支持其职业发展和家庭福利。
此职位的候选人应持有博士学位,并在分子遗传学,RNA 生物学,细胞生物学或其他系统生物学领域有较强的培训和文章发表。
详情请联系 Prof. Charles Query charles.query@einsteinmed.edu
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