不做实验、0代码,这个生信工具一出手就是3分+!还能做孟德尔随机化……

学术   2024-11-11 17:23   中国香港  

生信研究周期短,难度低,还好发高分近年来,孟德尔随机化在生信研究领域迅速走红,相关论文发表数量呈爆发式增长!绝对算得上一个不可多得的发文好途径!
2024年4月,一篇利用孟德尔随机化方法的文章成功发表在Lacent子刊上,IF9.7分!

通过孟德尔随机化方法,不仅能发表生信文章,许多高分论文也借助这一方法丰富研究内容,使研究论据更加有力。有了孟德尔随机化,咱们医学生发表高分论文变得更加容易了。
但是想要顺利发高分SCI,数据可视化与美化不可忽视。仙桃学术工具升级了模块功能,现在可以零代码搞定孟德尔随机化图表啦!
助力科研小白轻松拿下SCI!!!

话不多说,直接上图~


仙桃学术工具可以让你轻松摆脱R语言的束缚,只需要鼠标点一点,轻轻松松就能获取到想要的图表,还不用纹尽脑汁想配色,用主流数据库的数据还省去了数据清洗的工作量。

想用仙桃学术工具为生信研究提效?想零代码发生信文章?那么本次如何零代码发表第一篇生信SCI】免费课程不可错过!
猕猴桃老师将会教大家如何用仙桃学术工具零代码发生信SCI,带你紧握生信分析红利,快速收割生信红利!实现早发SCI、顺利毕业和职业晋升的目标

课程大纲:

1.什么是生信研究?

2.生信研究的参数结构

3.生信发文现状

4.生信发文流程

5.如何判断疾病能不能做生信分析

6.课题设计

7.生信研究的套路

8.数据库和工具介绍

9.单基因肿瘤/非肿瘤/临床预测模型等套路实操复现


孟德尔随机化法爆火

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零代码发孟德尔随机化SCI


仙桃学术工具能做哪些图?

仙桃学术工具不仅功能丰富,而且操作简便,能极大地提升生信发文效率。通过仙桃学术工具,科研人员可以轻松制作各种类型的图表,包括但不限于热图、火山图、PCA图、箱线图等。

仙桃学术工具能做表达差异分析

仙桃学术工具能做功能聚类分析

仙桃学术工具能做交互网络分析:

仙桃学术工具能做临床意义分析:


实操演示零代码复现生信图表

课程讲师会以一篇2023年11月发表在Frontiers in lmmunologyI期刊IF=5.7的生信文章为例,介绍文章思路,零代码复现图表。

套路:非肿瘤

数据来源:GSE57178,GSE72540数据集

以下截选课程中部分复现操作:
Figure 1A复现

在GEO数据库中下载GSE57178数据集的表达矩阵。

新建一个excel命名为【GSE57178】,提取出表达矩阵。


在GEO数据库中通过GEO2R获取探针的Symbol ID。

新建一个excel命名为【ID1】,提取出“ID”列和“Gene.symbol”列。

对【GSE57178】按第一列“ID_REF”升序进行排序,对【ID1】也按第一列“ID”升序进行排序,然后将【ID1】中“Gene.symbol”列替换【GSE57178】中“ID_REF”列,完成探针合并。将列名“Gene.symbol”改成“Symbol”,并另存为一个excel命名为【exp1_pre】。


进入仙桃网站(https://www.xiantaozi.com/),选择【生信工具】,在左侧的【其他】中选择我们需要用到的【缺失值过滤】。

上传【exp1_pre】,点击【验证】。“过滤类型”选择“过滤掉特定缺失及以上个数”,“特定个数”填“1”,然后点击【确认】。


点击【数据缺失值过滤结果.csv】下载过滤结果。

然后进入仙桃网站(https://www.xiantaozi.com/),选择【生信工具】,在左侧的【其他】中选择我们需要用到的【数据去重】。


仙桃学术工具有哪些亮点?

仙桃学术工具自从上线以来,迅速成为生信人的心头好。那仙桃学术工具为什么这么受欢迎?

亮点一:超全的生信分析模块

基础绘图,差异表达,富集分析,互作网络,临床意义5大功能类型,22个常规分析模块已全部上线,满足几平所有TCGA数据库常规分析要求。GEO数据库数据清洗及最新生信分析套路模块未来持续更新。



亮点二:作图参数调整灵活

仙桃学术工具具备根据上传数据自动匹配统计分析方法,图片风格等参数功能,同时提供多种个性化参数调节功能包含统计分析方法、图片配色,字体,文本内容。



亮点三:发表级别图片一键输出

TCGA数据已全部清洗到服务器,支持随时调用,常规分析绘图速度极快,可实现几秒内快速出图,同时所有工具分析结果支持在线拼图直接输出发表级别图片。


写在最后:

生信研究之所以能够广受欢迎,靠的就是相对高的发文效率,相对短的研究周期以及相对低的难度系数
在生信研究里,最耗时的就是R语言的学习了,不过,有了仙桃学术工具的加持,零代码就可以搞定一篇生信SCI,省时省力还容易发高分!
咱就是说,在繁忙的科研工作中,时间是能省一点就省一点。赶紧扫描下方二维码,免费学习使用仙桃工具,零代码搞定3+SCI~

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