tNGS（targeted next - generation sequencing，靶向测序）和mNGS（metagenomic next - generation sequencing，宏基因组测序）是两种基于二代测序技术的检测方法，在临床和科研等领域有重要应用。本文主要对这两种技术进行详细解析，并对比两种技术的差异。
一、tNGS（靶向测序）
技术原理
tNGS是一种基于超多重PCR扩增（或靶向捕获）与高通量测序两种技术结合的新一代测序技术。它使用大量针对特定基因序列的引物/探针对待测样品中抽提出的核酸进行超多重PCR扩增/探针捕获，获得大量目标核酸片段，再对这些目标核酸片段进行高通量测序，然后对所得序列进行生物信息学分析，从而实现对待测样本中的核酸进行高灵敏以及高分辨率的识别。
技术特点
针对性强：tNGS只针对特定基因序列进行测序，因此可以大大减少测序数据量，提高检测效率和准确性。
高灵敏度：由于tNGS可以对低浓度的病原微生物进行检测，因此具有高灵敏度。
高分辨率：tNGS能够实现对病原体特定基因的高分辨率识别，有助于精准诊断。
成本低：与mNGS相比，tNGS的测序数据量更少，因此成本更低。
应用场景
tNGS主要应用于院内感染筛查、呼吸道感染、血流感染、中枢神经系统感染等临床检验领域。此外，它还可以用于遗传病检测、癌症检测和传染病检测等方面。
二、mNGS（宏基因组测序）
技术原理
mNGS是借助二代测序平台快速测序获得样品中的核酸序列，并进一步与已知的各个物种的基因组序列对比，从而得知样品中微生物的种类和比例的技术。它无需临床预判，可以无偏倚地检出样本中包括细菌、真菌、病毒和寄生虫在内的所有微生物。
技术特点
覆盖范围广：mNGS可以检测所有已知基因组序列的病原体，因此覆盖范围广。
准确性高：由于mNGS是基于高通量测序技术，因此准确性高，能够准确识别病原体。
获取耐药突变信息和毒力基因：mNGS不仅可以检测病原体的种类，还可以获取耐药突变信息和毒力基因，为临床用药提供指导。
应用场景
mNGS已广泛应用在呼吸道感染、腹腔感染、中枢神经系统感染、血流感染、骨关节感染、术后感染等场景。此外，它还适用于病原学阴性的疑似肺结核、肺外结核、NTM病及其他病原体感染的诊断及鉴别诊断。
三、tNGS与mNGS的比较
检测范围
tNGS：只针对特定基因序列进行测序，因此检测范围相对较窄。
mNGS：可以检测所有已知基因组序列的病原体，因此检测范围广泛。
灵敏度与准确性
tNGS：由于只针对特定基因序列进行测序，因此具有高灵敏度和准确性。
mNGS：虽然覆盖范围广，但可能受到人源干扰和背景菌群的影响，导致灵敏度和准确性略有降低。不过，随着技术的不断发展，mNGS的灵敏度和准确性也在不断提高。
成本与效率
tNGS：测序数据量较少，因此成本较低，且检测效率较高。
mNGS：测序数据量庞大，因此成本较高，且检测效率相对较低。不过，随着测序技术的不断进步和成本的降低，mNGS的应用也变得越来越广泛。
应用场景
tNGS：主要应用于院内感染筛查、呼吸道感染、血流感染等临床检验领域。
mNGS：适用于各种感染性疾病的病原检测，特别是对于疑难危重症、罕见病原体感染的诊断具有独特优势。
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