种鸽近亲配对是一个很好的配对方式，多重近亲配对同样如此。但是凡事都有两面性。种鸽近亲配对也有利弊区别。只是有的鸽友趋利避害，有的鸽友看到弊端就不敢让鸽子近亲配对。合理把握好利弊情况，其实近亲配对还是很有效果的一个做法。
近亲配对的有利的一面主要是两点。第一点，通过近亲配对，可以把一些优秀基因进一步融合。比如说杂交关系的两羽鸽子配对，出的鸽子近亲配对，再出的鸽子再选择有优势的近亲配对，把一些优势结合起来。鸽子就会得到提升。所以初期近亲配对对鸽子的提升效果也是十分明显。
第二点，近亲配对可以把一些已经稳定下来的鸽子继续稳定下去，使得这些优秀的鸽子的优秀基因不出现太大的变化。这是很重要的一点。所以虽然近亲配对到一定的程度没有提升了，但是还是很多鸽友会愿意采取近亲配对的方式让鸽子去配对。主要也是看中了基因遗传。
那么近亲配对弊端其实主要就是各种可能出现的退化问题。退化问题不一定出现，但是可能出现。可能多重近亲之后更容易出现。有的退化很明显，有的退化不明显。退化问题是最主要的弊端，不过退化问题可以控制，退化的鸽子可以淘汰，所以也不算是太大的问题。只要不总是认为好鸽子近亲出的鸽子就是好鸽子，注意淘汰掉一些鸽子，其实这个弊端问题也不大。
