I 论文导读 |
IF：5.5 中科院2区 | JCR/Q2 病毒学 参考译文： 中国家鹅中 H6 流感病毒的进化特征：对宿主在生态系统中地位的影响 第一作者： Liuxia Peng 通讯作者：管轶，朱华晨，Tommy Tsan-Yuk Lam |
I 主要研究结果 |
在2001年至2018年期间，研究人员在中国南方对健康家鹅进行了长期监测，发现H6亚型流感病毒在家鹅中持续存在。在这段时间内，共收集了36,893份样本，H6病毒的检出率最高达到了7.93%，总共分离出893株家鹅H6病毒，总体检出率为2.42%。研究表明，家鹅中的H6病毒几乎全部具有N2或N6神经氨酸酶（NA）亚型，其中N8 NA基因很少见。尽管H6N2病毒在2005年之后在家鸭种群中普遍被H6N6取代，但在监测期间，这两种NA亚型在家鹅中共同循环。
2.I 组和 II 组 H6 病毒在家鹅中同时传播并定居
研究结果显示，家鹅中分离的H6病毒源自已经在家鸭中建立的I组和II组H6病毒。在家鹅中，这些病毒形成了三个不同的血凝素（HA）基因系，分别命名为GS-1、GS-2和GS-3。其中，GS-1系只包含H6N2亚型病毒，而GS-2和GS-3系则包含H6N2和H6N6亚型。这些病毒在家鹅中长期存在，但在监测期间很少传播回家鸭或陆地禽类，也未与其他亚型的病毒发生基因交换。研究还发现，家鹅H6病毒维持了它们鸭类祖先的主要分子特征。
图1.表面蛋白基因的最大似然系统发育
3.H6 跨物种传播并未导致病毒快速进化
研究中观察到，虽然H6病毒从家鸭传播到家鹅，但这种跨物种传播并没有导致病毒的快速进化。在家鹅中，H6病毒的血凝素（HA）基因的核苷酸替换率并没有在家鸭中那么高。此外，研究还发现，尽管在病毒跨物种传播的早期阶段，非同义突变（可能导致氨基酸改变的突变）的积累速度较快，但这些突变在家鹅中长期循环后大多被移除，表明它们可能是对H6病毒在家鹅宿主中持续存在不利的突变。在家鸭中，H6病毒的进化速率较高，可能是由于宿主免疫选择或对新宿主的适应所驱动。然而，一旦在到家鹅中建立，H6病毒的进化速率并没有明显增加，这表明家鹅可能限制了流感病毒的进化速率。
4.基因重配在家鹅中是有限的
在家鹅中，H6病毒的基因重配现象受到了限制。研究中发现，家鹅中的H6病毒主要与同一物种中的其他H6病毒进行基因重配，而很少与野生水禽的病毒或陆地家禽中的H5/H9病毒亚型进行基因交换。这种有限的基因重配模式与家鹅作为流感病毒自然宿主的角色不符，因为在自然宿主中，不同宿主和亚型病毒之间的基因交换通常较为频繁。研究还指出，家鹅中的H6病毒没有检测到与其他流感病毒亚型（如H5和H9）的基因流，这与在家鸭中观察到的频繁的基因重配事件形成对比。这些结果表明，家鹅可能不会像家鸭那样促进流感病毒的快速进化和基因多样性，进一步支持了家鹅可能是流感A病毒的“死胡同”宿主的观点。
图2.鸭和鹅中建立的 H6 病毒重配模式
5.鹅H6病毒的分子特征
家鹅中的H6病毒具有一些特定的分子特征。所有在家鹅中分离的H6病毒均为低致病性病毒，这基于它们在HA1/HA2裂解位点仅含有单个基本氨基酸。大多数家鹅H6病毒在受体结合位点（RBD）含有Q226和G228（使用H3编号），这通常表明它们对禽类型唾液酸有较高的亲和力。GS-1系病毒中大多数携带E190V突变，与Q226和G228一起，表明对禽类型受体有更高的亲和力。GS-2系病毒的HA基因中发现了Q226L突变，这可能增加病毒对人类型受体（α2-6-SA）的亲和力，但这一点还需要进一步研究。
在神经氨酸酶（NA）的茎区，家鹅H6N2病毒中发现了三种氨基酸缺失模式，这些模式自2003年以来已在它们的鸭源病毒中被检测到，可能与基因兼容性的优化有关。在家鹅H6病毒中未检测到任何哺乳动物适应标记，如PB2蛋白中的E627K和D701N突变。这些分子特征表明，家鹅H6病毒可能主要适应水禽宿主，而不是陆地家禽或哺乳动物。
图3.分子特征
| I 研究总结 |
经过18年在中国南方的监测，研究人员发现H6亚型流感病毒在家鹅中频繁被检测到。研究结果表明，家鹅仅接收了来自家鸭的有限种类的H6病毒，并且维持了从这些病毒中获得的多样性和分子标记。然而，家鹅并没有将病毒从自然宿主传播给陆地家禽，也没有通过与其他物种中看到的病毒的基因交换产生变体。这些发现提出了家鹅在流感生态系统中可能更像是一个异常和“死胡同”宿主的可能性。与其它家禽相比，家鹅在流感A病毒的生态系统中的作用可能有限，因此，可以考虑减少对这一宿主的病毒监测。
https://academic.oup.com/ve/article/10/1/veae075/7756921
校对：Collin
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